結球甘藍（Brassica oleracea L.var.capitata）簡稱甘藍,是一種重要的十字花科蕓薹屬蔬菜。甘藍葉色通常為綠色,YL-1和4036Y是本課題組發(fā)現的兩個黃綠葉色突變體。本研究對兩個突變體進行了遺傳規(guī)律分析及基因精細定位,完成了兩個候選基因的變異分析,為揭示黃綠葉色形成機理、促進甘藍葉色育種奠定了基礎。主要研究結果如下:1.在YL-1的C01染色體重組抑制區(qū)段精細定位了BoYgl-1基因,揭示了該區(qū)段發(fā)生一個6.3 Mb的倒位,候選基因Bo1g078470和Bo1g078800在YL-1中啟動子區(qū)域或編碼區(qū)存在變異。以黃綠葉色甘藍突變體YL-1和正常綠葉芥藍自交系11-192為親本,構建BC3-BC5分離群體,最終將BoYgl-1黃綠葉色基因定位于C01染色體392 Kb的區(qū)間。同時發(fā)現YL-1在標記B4-4和T1-49之間發(fā)生了一個6.3 Mb的染色體倒位,導致該區(qū)段嚴重的重組抑制。定位區(qū)間內共包含32個基因,其中Bo1g078470編碼CLPC2/HSP93-Ⅲ蛋白,調控葉綠體蛋白轉運;Bo1g078800編碼一種PPR五肽重復蛋白,參與線粒體和葉綠體的RN... 

【文章頁數】：69 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
主要符號對照表
第一章 緒論
    1.1 葉色突變體研究進展
        1.1.1 葉色突變體的來源
        1.1.2 葉色突變體的分類
        1.1.3 葉色突變體的遺傳規(guī)律
        1.1.4 葉色基因的定位及克隆
        1.1.5 葉色突變體的分子機制
    1.2 圖位克隆技術
        1.2.1 圖位克隆的原理
        1.2.2 圖位克隆的應用及不足
    1.3 BSA-seq技術
        1.3.1 BSA-seq的原理
        1.3.2 BSA-seq技術的應用
    1.4 目的意義
第二章 甘藍黃綠葉色基因BoYgl-1的精細定位及候選基因分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗材料
        2.1.2 InDel標記開發(fā)篩選
        2.1.3 DNA提取
        2.1.4 PCR擴增及電泳
        2.1.5 構建遺傳圖譜
        2.1.6 RNA提取及cDNA的合成
        2.1.7 熒光定量PCR測定基因表達量
    2.2 結果與分析
        2.2.1 BoYgl-1基因的精細定位
        2.2.2 YL-1在定位區(qū)間內染色體倒位的確定
        2.2.3 候選基因預測
        2.2.4 候選基因表達水平分析
        2.2.5 候選基因序列分析
    2.3 討論
        2.3.1 BoYgl-1基因精細定位分析
        2.3.2 染色體倒位導致嚴重的重組抑制
        2.3.3 YL-1染色體倒位邊界位置分析
第三章 甘藍黃綠葉色基因BoYgl-2的遺傳分析及精細定位
    3.1 材料與方法
        3.1.1 試驗材料
        3.1.2 表型調查及集群分離分析法(BSA)混池測序
        3.1.3 InDel標記開發(fā)篩選
        3.1.4 DNA提取、PCR擴增及電泳
        3.1.5 遺傳圖譜的構建
    3.2 結果與分析
        3.2.1 突變體4036Y葉色遺傳規(guī)律分析
        3.2.2 兩個不同基因控制4036Y與YL-1葉色黃綠突變的遺傳學驗證
        3.2.3 利用BSA-seq初步定位BoYgl-2基因
        3.2.4 BoYgl-2基因的精細定位
        3.2.5 候選基因預測
        3.2.6 候選基因分析
    3.3 討論
        3.3.1 BoYgl-2與BoYgl-1編碼不同的PPR蛋白
        3.3.2 RNA-seq分析4036Y染色體片段缺失
第四章 結論
    4.1 甘藍黃綠葉色基因BoYgl-1的精細定位及候選基因分析
    4.2 甘藍黃綠葉色基因BoYgl-2的遺傳分析及精細定位
參考文獻
附錄A
附錄B
致謝
作者簡歷



本文編號：3672885