癌癥是導致死亡人數(shù)最多且死亡率最高的疾病之一,嚴重威脅了人類的健康。盡管癌癥研究近年來有了很大的進展,但由于缺乏特異性強的診斷標記物,尤其是早期診斷標記物,癌癥診斷仍然是個難題。TCGA和GTEx等數(shù)據(jù)平臺提供了海量的公開數(shù)據(jù)讓研究者可以綜合多種組織的數(shù)據(jù)進行特異表達基因的篩選。本研究的目的是篩選一批高特異性的癌癥診斷及預后標記物并對癌癥特異高表達基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡和潛在藥物靶點進行研究。首先,使用SEGtool從TCGA和GTEx數(shù)據(jù)庫的表達量數(shù)據(jù)中篩選了各癌癥組織、癌旁組織以及正常組織的特異表達基因（SEGs）,并從中篩選了僅在一種癌癥特異表達的癌癥特異表達基因（cSEGs）。然后在癌癥特異表達基因的基礎上篩選了靈敏度高的基因作為潛在標記物。這樣總共得到了來自15種癌癥的283個潛在標記物,其高表達樣本比例均大于50%,其中KICH的三個cSEGs（OGDH、MUDENG和ACO2）的高表達樣本比例>80%。此外還篩選了13種癌癥的245個對早期癌癥敏感的潛在標記物,其高表達樣本比例均大于50%,其中MUDENG和ACO2在早期KICH的高表達樣本比例達到了95%,一致性非常... 

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 癌癥研究概況
    1.2 組織特異表達基因研究進展
    1.3 轉(zhuǎn)錄組相關生物信息學數(shù)據(jù)庫
    1.4 研究目的和意義
2 癌癥診斷標記物篩選
    2.1 研究目的與方法
    2.2 表達量數(shù)據(jù)收集和處理
    2.3 特異表達基因的篩選
    2.4 癌癥診斷標記物篩選
3 早期癌癥診斷標記物篩選
    3.1 研究目的與方法
    3.2 早期癌癥組織表達量數(shù)據(jù)處理
    3.3 早期癌癥特異表達基因篩選及處理
    3.4 早期癌癥診斷標記物篩選
4 癌癥特異表達基因綜合分析
    4.1 預后分析
    4.2 轉(zhuǎn)錄調(diào)控
    4.3 藥物分析
5 全文總結(jié)與討論
致謝
參考文獻
附表


【參考文獻】：
期刊論文
[1]Biomarkers in colorectal cancer: Current clinical utility and future perspectives[J]. Marco Vacante,Antonio Maria Borzì,Francesco Basile,Antonio Biondi.  World Journal of Clinical Cases. 2018(15)
[2]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He.  Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)



本文編號：3669351