熱激轉(zhuǎn)錄因子（heat shock transcription factor,Hsf）是植物脅迫抗性調(diào)控中的一類重要因子,在植物脅迫應(yīng)答和生長發(fā)育調(diào)控中起著關(guān)鍵作用。本試驗(yàn)基于甜瓜（Cucumis melo L.）基因組數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)手段對CmHsf家族進(jìn)行鑒定,并對其基因結(jié)構(gòu)、位置信息、系統(tǒng)發(fā)育、共線性關(guān)系及啟動子等進(jìn)行了分析。結(jié)果表明:在甜瓜基因組數(shù)據(jù)中共鑒定到22個CmHsf基因家族成員,這些基因不均勻地分布在11條染色體上,所有基因均含有內(nèi)含子,且內(nèi)含子數(shù)量大多為1～2個;根據(jù)蛋白結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)育分析,CmHsf可被分為3個類群,各類群數(shù)量不等,與其他植物Hsf基因在類群劃分上具有一定的相似性;在與模式植物擬南芥進(jìn)行同源進(jìn)化分析中,系統(tǒng)進(jìn)化樹將所有的CmHsf基因家族聚為3類;在共線性分析中,甜瓜共有19個基因與黃瓜、西瓜存在共線性關(guān)系;在啟動子分析中,鑒定到脫落酸、茉莉酸、生長素、赤霉素以及干旱、低溫、機(jī)械損傷等信號響應(yīng)順式作用元件。 

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 甜瓜Hsf家族基因鑒定及染色體定位
    1.2 甜瓜Hsf家族序列比對及進(jìn)化樹的構(gòu)建
    1.3 甜瓜Hsf家族基因結(jié)構(gòu)分析
    1.4 甜瓜與西瓜、黃瓜共線性基因分析
    1.5 啟動子分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 甜瓜Hsf家族基因的鑒定
    2.2 甜瓜Hsf家族基因的染色體定位
    2.3 甜瓜Hsf家族基因結(jié)構(gòu)特征及系統(tǒng)進(jìn)化分析
        2.3.1 甜瓜Hsf家族基因系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.3.2 甜瓜Hsf家族基因保守結(jié)構(gòu)域分析
        2.3.3 甜瓜Hsf家族基因結(jié)構(gòu)分析
        2.3.4 甜瓜與擬南芥Hsf家族基因系統(tǒng)發(fā)育分析
    2.4 甜瓜與黃瓜、西瓜共線性基因分析
    2.5 甜瓜Hsf家族基因順式作用元件分析
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]熱激轉(zhuǎn)錄因子在植物脅迫應(yīng)答和生長發(fā)育中的作用[J]. 陸偉,耿玉璐,鄭宇茜,王幼平,方玉潔.  分子植物育種. 2020(03)
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