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基于新疆紫草轉錄組的對羥基苯甲酸香葉基轉移酶(PGT)基因的挖掘及生物信息學分析

發(fā)布時間:2022-07-15 18:38
  對羥基苯甲酸香葉基轉移酶(PGT)在紫草素類化合物的生物合成途徑中起重要作用。該文主要通過生物信息學的方法從新疆紫草轉錄組中獲得6個PGT基因,并預測其編碼蛋白的理化性質,進行相關基因的表達分析。結構域預測結果顯示,6個PGT蛋白序列均包含Ubi A異戊烯基轉移酶家族保守結構域及異戊烯焦磷酸結合位點NDxx Dxxx D和可能的芳環(huán)的結合位點GX(K/Y)ST AL;系統(tǒng)進化樹分析顯示PGT與同源的對羥基苯甲酸多異戊烯轉移酶(PPT)屬于2個不同的進化枝;基因表達分析表明在紫草素類化合物產量較高的新疆紫草紅色高產系懸浮細胞及植株的地下部分,其PGT基因的表達量明顯高于白色低產系及植株的地上部分,說明新疆紫草PGT基因的表達量與紫草素類化合物的合成呈正相關。該研究為進一步了解對羥基苯甲酸香葉基轉移酶(PGT)的功能及特性奠定了基礎,并為紫草素類化合物生物合成及代謝調控提供依據。 

【文章頁數】:8 頁

【文章目錄】:
1 材料
2 方法
    2.1 新疆紫草PGT基因的獲得
    2.2 生物信息學分析
    2.3 熒光定量PCR檢測基因表達量
        2.3.1 RNA提取和c DNA合成
        2.3.2 Real-time PCR
3 結果與分析
    3.1 新疆紫草6個Ae PGTs基因的核苷酸特性分析
    3.2 新疆紫草6個Ae PGTs基因編碼蛋白特性分析
    3.3 新疆紫草6個Ae PGTs基因編碼蛋白的二級結構分析
    3.4 系統(tǒng)進化樹分析
    3.5 基因表達分析
4討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]兩種新疆紫草細胞系紫草素生物合成關鍵酶基因的表達差異分析[J]. 王升,謝騰,周良云,吳志剛,張燕,陳美蘭,黃璐琦,郭蘭萍.  中華中醫(yī)藥雜志. 2014(05)
[2]新疆紫草2種懸浮細胞生長及紫草素類化合物積累的動力學研究[J]. 王升,謝騰,葉和春,林淑芳,張燕,陳美蘭,黃璐琦,郭蘭萍.  中國中藥雜志. 2013(08)
[3]紫草素及其衍生物的調控策略[J]. 黃文虎,葛鋒,劉迪秋,陳朝銀.  中國生物工程雜志. 2010(11)
[4]芳香族異戊烯轉移酶的研究進展[J]. 高娟,曾英,盧山.  植物學報. 2010(06)
[5]新疆紫草提取物對小鼠免疫性肝損傷的保護作用[J]. 劉燕,買爾旦·馬合木提,尼加提·熱合木.  新疆醫(yī)科大學學報. 2006(06)
[6]現代發(fā)酵工程技術在食品領域的應用研究進展[J]. 史先振.  中國釀造. 2005(12)
[7]紫草素的全合成研究進展[J]. 徐德鋒,管鵬健,毛志強,李紹順.  有機化學. 2005(07)
[8]滇紫草愈傷組織培養(yǎng)與紫草素產生[J]. 周立剛,鄭光植,王世林.  云南植物研究. 1991(03)
[9]離體培養(yǎng)的新疆紫草萘醌色素的誘導形成[J]. 李國鳳,伍正容,葉和春,盧馥蓀,向桂瓊.  植物學通報. 1988(02)

碩士論文
[1]新疆紫草的化學成分研究[D]. 徐新剛.北京中醫(yī)藥大學 2009



本文編號:3662628

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