毛竹PP2C基因家族鑒定與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-07-12 17:06
PP2C (2C type protein phosphatase)是一類廣泛存在于生物體中、具有重要調(diào)控作用的蛋白磷酸酶,在植物抵抗逆境脅迫及激素響應(yīng)等過(guò)程中具有重要作用,而在毛竹(Phyllostachys edulis)中的研究尚未充分開展。本研究以毛竹為材料,利用生物信息學(xué)方法,從毛竹全基因組中鑒定出125個(gè)具有完整PP2C保守結(jié)構(gòu)域的基因,這些基因編碼蛋白長(zhǎng)度為110~1 086 aa,分子量為12.07~121.02 kD;系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,125個(gè)毛竹PP2C基因共可分為9個(gè)亞家族,其中4個(gè)基因(PH02Gene36278.t1, PH02Gene48541.t1,PH02Gene37946.t1, PH02Gene29918.t1)未被分入任何亞家族,而是單獨(dú)形成分枝;基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的組織特異性分析顯示,121個(gè)PP2C基因在毛竹不同組織及不同發(fā)育階段中都有不同程度的表達(dá),多數(shù)PP2C基因在毛竹筍的不同發(fā)育階段呈現(xiàn)較高的表達(dá),也有部分PP2C基因在根與葉片等部位具有較高的表達(dá);qRT-PCR結(jié)果顯示,毛竹經(jīng)過(guò)脫落酸處理后有9個(gè)PP2C基因上調(diào)表達(dá)、1個(gè)下調(diào)表達(dá);在鹽和茉...
【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 毛竹PP2C基因家族鑒定
1.3 毛竹PP2C基因結(jié)構(gòu)與進(jìn)化分析
1.4 毛竹PP2C基因的組織特異性分析
1.5 非生物脅迫及激素處理?xiàng)l件下毛竹PP2C基因表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 毛竹PP2C基因家族鑒定與理化性質(zhì)分析
2.2 毛竹PP2C家族基因結(jié)構(gòu)與蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析
2.3 毛竹PP2C基因家族系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.4 毛竹PP2C家族基因組織特異性分析
2.5 毛竹PP2C家族基因在鹽脅迫與不同激素處理下的表達(dá)模式分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]毛竹PeNAC047基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 趙鐘毓,侯丹,胡秋濤,魏涵天,鄭穎,林新春. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2020(01)
[2]毛竹bHLH轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及其在干旱和鹽脅迫條件下的表達(dá)分析[J]. 徐秀榮,楊克彬,王思寧,高志民. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]毛竹B3家族全基因組鑒定及表達(dá)模式分析[J]. 吳佳軍,俞率成,劉志剛,傅鷹,周明兵. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2019(01)
[4]毛竹PIN基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 白羽聰,李翔宇,程占超,侯丹,劉俊,謝麗華,高健. 分子植物育種. 2019(16)
[5]擬南芥蛋白磷酸酶PP2C31的鹽脅迫響應(yīng)功能研究[J]. 張弛,蔚靜玲,儲(chǔ)謨立,張邦民,蘭文智. 中國(guó)科技論文. 2018(18)
[6]葡萄PP2C家族基因的鑒定與表達(dá)分析[J]. 何紅紅,路志浩,馬宗桓,梁國(guó)平,馬麗娟,萬(wàn)鵬,毛娟. 園藝學(xué)報(bào). 2018(07)
[7]竹類植物快速生長(zhǎng)的機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 陶貴耘,傅鷹,周明兵. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(05)
[8]毛竹生長(zhǎng)素反應(yīng)因子基因的生物信息學(xué)分析及差異表達(dá)[J]. 程占超,侯丹,馬艷軍,高健. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(04)
[9]毛竹NAC轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析[J]. 黎幫勇,胡尚連,曹穎,徐剛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(08)
[10]浙江安吉縣毛竹林高溫干旱災(zāi)害調(diào)研報(bào)告[J]. 柳麗娜,董敦義,李云,李雪濤. 世界竹藤通訊. 2014(01)
碩士論文
[1]玉米脫落酸受體(PYL3)與2C型絲氨/蘇氨酸蛋白磷酸酶(PP2C)的互作分析[D]. 程梅.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3659516
【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 毛竹PP2C基因家族鑒定
1.3 毛竹PP2C基因結(jié)構(gòu)與進(jìn)化分析
1.4 毛竹PP2C基因的組織特異性分析
1.5 非生物脅迫及激素處理?xiàng)l件下毛竹PP2C基因表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 毛竹PP2C基因家族鑒定與理化性質(zhì)分析
2.2 毛竹PP2C家族基因結(jié)構(gòu)與蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析
2.3 毛竹PP2C基因家族系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.4 毛竹PP2C家族基因組織特異性分析
2.5 毛竹PP2C家族基因在鹽脅迫與不同激素處理下的表達(dá)模式分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]毛竹PeNAC047基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 趙鐘毓,侯丹,胡秋濤,魏涵天,鄭穎,林新春. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2020(01)
[2]毛竹bHLH轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及其在干旱和鹽脅迫條件下的表達(dá)分析[J]. 徐秀榮,楊克彬,王思寧,高志民. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]毛竹B3家族全基因組鑒定及表達(dá)模式分析[J]. 吳佳軍,俞率成,劉志剛,傅鷹,周明兵. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2019(01)
[4]毛竹PIN基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 白羽聰,李翔宇,程占超,侯丹,劉俊,謝麗華,高健. 分子植物育種. 2019(16)
[5]擬南芥蛋白磷酸酶PP2C31的鹽脅迫響應(yīng)功能研究[J]. 張弛,蔚靜玲,儲(chǔ)謨立,張邦民,蘭文智. 中國(guó)科技論文. 2018(18)
[6]葡萄PP2C家族基因的鑒定與表達(dá)分析[J]. 何紅紅,路志浩,馬宗桓,梁國(guó)平,馬麗娟,萬(wàn)鵬,毛娟. 園藝學(xué)報(bào). 2018(07)
[7]竹類植物快速生長(zhǎng)的機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 陶貴耘,傅鷹,周明兵. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(05)
[8]毛竹生長(zhǎng)素反應(yīng)因子基因的生物信息學(xué)分析及差異表達(dá)[J]. 程占超,侯丹,馬艷軍,高健. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(04)
[9]毛竹NAC轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析[J]. 黎幫勇,胡尚連,曹穎,徐剛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(08)
[10]浙江安吉縣毛竹林高溫干旱災(zāi)害調(diào)研報(bào)告[J]. 柳麗娜,董敦義,李云,李雪濤. 世界竹藤通訊. 2014(01)
碩士論文
[1]玉米脫落酸受體(PYL3)與2C型絲氨/蘇氨酸蛋白磷酸酶(PP2C)的互作分析[D]. 程梅.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3659516
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