昆蟲線粒體基因密碼子的偏好性及其演化
發(fā)布時(shí)間:2022-07-12 17:05
昆蟲是地球上物種數(shù)目最多的動(dòng)物類群。昆蟲mtDNA是具有小分子量的共價(jià)閉合的雙鏈環(huán)狀分子。它通常包含37個(gè)緊密排列的基因,其中13個(gè)是蛋白質(zhì)編碼基因。線粒體DNA由于其母系遺傳,保守的基因含量和較少的重組、突變率較快(與核DNA相比),且在不同譜系中幾乎保持不變,已被廣泛用作系統(tǒng)發(fā)育研究中的中性分子標(biāo)記。但在某些鳥類等動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)了純化的或適應(yīng)性進(jìn)化力。由于同義密碼子的不均勻使用是復(fù)雜進(jìn)化力的指標(biāo),我們對(duì)昆蟲線粒體基因組中密碼子使用的綜合分析,目的是估計(jì)它們的進(jìn)化特征。了解昆蟲的各種進(jìn)化歷史將有助于理解昆蟲的遺傳和表型進(jìn)化;谏镄畔W(xué)方法,本文研究了 29目,372科,2,842種昆蟲完整的線粒體基因組,分析了所有已發(fā)表不同進(jìn)化地位昆蟲的mtDNA的密碼子使用偏好模式及其異同。其次,結(jié)合相關(guān)演化指數(shù)分析揭示昆蟲形成mtDNA密碼子使用模式中貢獻(xiàn)最大的進(jìn)化力;趍tDNA偏好的詳細(xì)分析可以更好地理解昆蟲之間的進(jìn)化關(guān)系。具體研究結(jié)果和結(jié)論如下:1.基于線粒體基因組構(gòu)建的昆蟲系統(tǒng)發(fā)育分析本研究基于線粒體基因組所構(gòu)建昆蟲關(guān)系的系統(tǒng)樹拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)與以往形態(tài)學(xué)和分子分類的研究結(jié)果一致。昆蟲系統(tǒng)發(fā)育...
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
中英文縮略詞表
第1章 前言
1.1 昆蟲概述
1.1.1 昆蟲特征
1.1.2 昆蟲分類及進(jìn)化
1.2 昆蟲線粒體基因組
1.2.1 昆蟲線粒體基因組特點(diǎn)
1.2.2 昆蟲線粒體基因組研究進(jìn)展
1.3 密碼子偏好性
1.3.1 密碼子偏好性概述
1.3.2 密碼子偏好性的形成原因
1.3.3 密碼子偏好性的測(cè)量指標(biāo)
1.3.4 密碼子偏好性的演化指數(shù)
1.3.5 密碼子偏好性的研究進(jìn)展
1.4 本文的研究目的及路線
1.4.1 本文的研究目的
1.4.2 本文的研究路線
第2章 基于昆蟲線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析
2.1 材料與方法
2.1.1 數(shù)據(jù)來源
2.1.2 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.3 本章總結(jié)
第3章 昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式
3.1 材料與方法
3.1.1 數(shù)據(jù)來源
3.1.2 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式分析
3.2.2 不同進(jìn)化地位昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式異同分析
3.3 本章總結(jié)
第4章 昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式的形成原因
4.1 材料與方法
4.1.1 數(shù)據(jù)來源
4.1.2 數(shù)據(jù)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式形成原因分析
4.2.2 不同進(jìn)化地位昆蟲mtDNA密碼子偏好模式形成原因的異同
4.3 本章總結(jié)
第5章 總結(jié)與結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]30種半翅目昆蟲線粒體COⅠ基因密碼子偏好性聚類分析[J]. 張玉波,周中艷,王廷慧,鄧娟. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(14)
[2]東亞飛蝗乙酰膽堿酯酶的分離純化與農(nóng)藥活性篩選初步研究[J]. 鄧園杰,張肖肖,高甜甜,陶科,金洪,侯太平. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(03)
[3]直翅目昆蟲線粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)育研究[J]. 趙樂,李雪娟,黃原. 生命科學(xué). 2018(01)
[4]2種果蠅(Drosophila melanogaster與D.sechellia)線粒體及NADH dehydrogenase subunit基因的密碼子偏好性分析[J]. 王鵬飛,高歡歡,蘇玲,蔣錫龍,吳新穎,楊立英,任鳳山,王詠梅. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(01)
[5]油用牡丹脂肪酸脫氫酶基因FAD3的克隆與表達(dá)分析[J]. 黃興琳,陸俊杏,廖冰楠,白輝揚(yáng),管麗,張濤. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(10)
[6]蓼科大黃屬植物CHS基因密碼子偏愛性分析[J]. 馬盛超,余鑫梅,姚慧鵬. 分子植物育種. 2017(06)
[7]香蕉全基因組NBS抗病基因密碼子使用偏好性分析[J]. 方輝,曲俊杰,孫嘉曼,尹玲,黃羽. 分子植物育種. 2017(03)
[8]昆蟲學(xué)研究進(jìn)入基因組學(xué)時(shí)代[J]. 張屾,谷少華,李顯春. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2016(10)
[9]昆蟲學(xué)的基本科學(xué)問題及分子生物學(xué)技術(shù)[J]. 趙小凡. 昆蟲學(xué)報(bào). 2016(08)
[10]昆蟲線粒體基因組重排的研究進(jìn)展[J]. 陳志騰,杜予州. 環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào). 2016(04)
博士論文
[1]蛇類線粒體基因組結(jié)構(gòu)演化研究及原矛頭蝮屬生物地理學(xué)分析[D]. 錢立富.安徽大學(xué) 2018
[2]密碼子及密碼子對(duì)使用偏好性的研究[D]. 譚生軍.南京大學(xué) 2012
[3]膜翅目線粒體基因組的特征與進(jìn)化及其在系統(tǒng)發(fā)育研究中的應(yīng)用[D]. 魏書軍.浙江大學(xué) 2009
[4]昆蟲基因組密碼子使用及進(jìn)化分析[D]. 孫錚.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[5]基于密碼子水平的生物信息學(xué)分析及進(jìn)化研究[D]. 張文娟.復(fù)旦大學(xué) 2006
碩士論文
[1]藍(lán)舌病毒的密碼子偏好性分析及其在系統(tǒng)發(fā)生生物地理學(xué)中的研究[D]. 姚曉婷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]尖尾蟻屬線粒體基因組進(jìn)化及其系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究[D]. 段曉宇.陜西師范大學(xué) 2018
[3]小鯢科線粒體基因組密碼子偏好性及進(jìn)化關(guān)系的分析[D]. 姜艷.陜西師范大學(xué) 2016
[4]直翅目昆蟲線粒體基因組密碼子偏好性及其進(jìn)化分析[D]. 王紅梅.陜西師范大學(xué) 2016
[5]幾種夜蛾科昆蟲翅膀結(jié)構(gòu)和力學(xué)性能研究[D]. 邢振龍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[6]莫名等蜉Isonychia ignota和中國擬短絲蜉Siphluriscus chinensis線粒體基因全序列的測(cè)定[D]. 秦加長(zhǎng).南京師范大學(xué) 2011
本文編號(hào):3659514
【文章頁數(shù)】:115 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
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中英文縮略詞表
第1章 前言
1.1 昆蟲概述
1.1.1 昆蟲特征
1.1.2 昆蟲分類及進(jìn)化
1.2 昆蟲線粒體基因組
1.2.1 昆蟲線粒體基因組特點(diǎn)
1.2.2 昆蟲線粒體基因組研究進(jìn)展
1.3 密碼子偏好性
1.3.1 密碼子偏好性概述
1.3.2 密碼子偏好性的形成原因
1.3.3 密碼子偏好性的測(cè)量指標(biāo)
1.3.4 密碼子偏好性的演化指數(shù)
1.3.5 密碼子偏好性的研究進(jìn)展
1.4 本文的研究目的及路線
1.4.1 本文的研究目的
1.4.2 本文的研究路線
第2章 基于昆蟲線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析
2.1 材料與方法
2.1.1 數(shù)據(jù)來源
2.1.2 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.3 本章總結(jié)
第3章 昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式
3.1 材料與方法
3.1.1 數(shù)據(jù)來源
3.1.2 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式分析
3.2.2 不同進(jìn)化地位昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式異同分析
3.3 本章總結(jié)
第4章 昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式的形成原因
4.1 材料與方法
4.1.1 數(shù)據(jù)來源
4.1.2 數(shù)據(jù)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 昆蟲線粒體基因組密碼子偏好模式形成原因分析
4.2.2 不同進(jìn)化地位昆蟲mtDNA密碼子偏好模式形成原因的異同
4.3 本章總結(jié)
第5章 總結(jié)與結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]30種半翅目昆蟲線粒體COⅠ基因密碼子偏好性聚類分析[J]. 張玉波,周中艷,王廷慧,鄧娟. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(14)
[2]東亞飛蝗乙酰膽堿酯酶的分離純化與農(nóng)藥活性篩選初步研究[J]. 鄧園杰,張肖肖,高甜甜,陶科,金洪,侯太平. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(03)
[3]直翅目昆蟲線粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)育研究[J]. 趙樂,李雪娟,黃原. 生命科學(xué). 2018(01)
[4]2種果蠅(Drosophila melanogaster與D.sechellia)線粒體及NADH dehydrogenase subunit基因的密碼子偏好性分析[J]. 王鵬飛,高歡歡,蘇玲,蔣錫龍,吳新穎,楊立英,任鳳山,王詠梅. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(01)
[5]油用牡丹脂肪酸脫氫酶基因FAD3的克隆與表達(dá)分析[J]. 黃興琳,陸俊杏,廖冰楠,白輝揚(yáng),管麗,張濤. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(10)
[6]蓼科大黃屬植物CHS基因密碼子偏愛性分析[J]. 馬盛超,余鑫梅,姚慧鵬. 分子植物育種. 2017(06)
[7]香蕉全基因組NBS抗病基因密碼子使用偏好性分析[J]. 方輝,曲俊杰,孫嘉曼,尹玲,黃羽. 分子植物育種. 2017(03)
[8]昆蟲學(xué)研究進(jìn)入基因組學(xué)時(shí)代[J]. 張屾,谷少華,李顯春. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2016(10)
[9]昆蟲學(xué)的基本科學(xué)問題及分子生物學(xué)技術(shù)[J]. 趙小凡. 昆蟲學(xué)報(bào). 2016(08)
[10]昆蟲線粒體基因組重排的研究進(jìn)展[J]. 陳志騰,杜予州. 環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào). 2016(04)
博士論文
[1]蛇類線粒體基因組結(jié)構(gòu)演化研究及原矛頭蝮屬生物地理學(xué)分析[D]. 錢立富.安徽大學(xué) 2018
[2]密碼子及密碼子對(duì)使用偏好性的研究[D]. 譚生軍.南京大學(xué) 2012
[3]膜翅目線粒體基因組的特征與進(jìn)化及其在系統(tǒng)發(fā)育研究中的應(yīng)用[D]. 魏書軍.浙江大學(xué) 2009
[4]昆蟲基因組密碼子使用及進(jìn)化分析[D]. 孫錚.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[5]基于密碼子水平的生物信息學(xué)分析及進(jìn)化研究[D]. 張文娟.復(fù)旦大學(xué) 2006
碩士論文
[1]藍(lán)舌病毒的密碼子偏好性分析及其在系統(tǒng)發(fā)生生物地理學(xué)中的研究[D]. 姚曉婷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]尖尾蟻屬線粒體基因組進(jìn)化及其系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究[D]. 段曉宇.陜西師范大學(xué) 2018
[3]小鯢科線粒體基因組密碼子偏好性及進(jìn)化關(guān)系的分析[D]. 姜艷.陜西師范大學(xué) 2016
[4]直翅目昆蟲線粒體基因組密碼子偏好性及其進(jìn)化分析[D]. 王紅梅.陜西師范大學(xué) 2016
[5]幾種夜蛾科昆蟲翅膀結(jié)構(gòu)和力學(xué)性能研究[D]. 邢振龍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[6]莫名等蜉Isonychia ignota和中國擬短絲蜉Siphluriscus chinensis線粒體基因全序列的測(cè)定[D]. 秦加長(zhǎng).南京師范大學(xué) 2011
本文編號(hào):3659514
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3659514.html
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