研究目的mTOR復(fù)合物（mTORC1和mTORC2）中基因的單核苷酸多態(tài)性與胃惡性腫瘤的遺傳易感性的關(guān)系。研究方法通過全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）數(shù)據(jù)庫來評估m(xù)TOR復(fù)合物（mTORC1和mTORC2）中的9個候選基因的單核苷酸多態(tài)性（SNPs）與胃癌風(fēng)險的關(guān)系,并采用logistic回歸模型計算SNPs對胃癌易感性的相關(guān)性。結(jié)合表達量性狀位點（eQTL）分析,篩選出候選SNP。通過不同的模型分層分析候選SNP在不同亞組中胃癌風(fēng)險之間的相關(guān)性。在PubMed、萬方數(shù)據(jù)、中國知網(wǎng)數(shù)據(jù)庫、維普數(shù)據(jù)庫上搜索關(guān)于候選靶基因與消化道腫瘤的有關(guān)文獻,并使用STATA12.0等軟件進行Meta分析,評估候選靶基因表達量與消化道腫瘤臨床及預(yù)后的關(guān)聯(lián)性,通過下載公共數(shù)據(jù)庫TCGA（The Cancer Genome Atlas）中數(shù)據(jù),分析候選靶基因在胃癌中表達水平以及與胃癌臨床及預(yù)后的關(guān)系,并在GEO（Gene Expression Omnibus）數(shù)據(jù)庫中驗證靶基因在胃癌中表達情況。采用雙熒光素酶報告基因?qū)嶒?探討靶結(jié)合區(qū)域SNP的生物學(xué)功能。研究結(jié)果通過使用全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）數(shù)據(jù)庫來評估... 

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
中英文主要縮略詞對照
緒論
    1.1 胃癌的流行病學(xué)
    1.2 胃癌的發(fā)病因素與機制研究
    1.3 GWAS數(shù)據(jù)庫概述及在胃癌中的應(yīng)用
    1.4 mTOR復(fù)合體的概述
    1.5 研究方法及目的
第二章 基于GWAS數(shù)據(jù)庫篩選mTOR復(fù)合體中與胃癌相關(guān)SNPs
    2.1 研究對象
    2.2 選點策略
    2.3 候選SNP與胃癌相關(guān)性的分層分析
    2.4 統(tǒng)計學(xué)方法
    2.5 結(jié)果
        2.5.1 mTOC1/2 復(fù)合物的候選基因確定
        2.5.2 候選SNPs的篩選與確定
        2.5.3 候選SNPs的功能性研究
        2.5.4 候選SNP在 GTEx數(shù)據(jù)集中驗證
        2.5.5 rs4871819 與胃癌相關(guān)性的分層分析
    2.6 討論
第三章 DEPTOR在消化道腫瘤中的薈萃分析
    3.1 資料的搜集與納入
    3.2 數(shù)據(jù)整理與質(zhì)量評估
    3.3 統(tǒng)計學(xué)方法
    3.4 結(jié)果
        3.4.1 DEPTOR表達與消化道腫瘤患者LNM,臨床分期相關(guān)性分析
        3.4.2 DEPTOR表達與消化道腫瘤患者預(yù)后相關(guān)性分析
    3.5 討論
第四章 DEPTOR的表達與胃癌的相關(guān)性研究
    4.1 公共數(shù)據(jù)庫下載和使用
        4.1.1 TCGA(The Cancer Genome Atlas)數(shù)據(jù)庫使用
        4.1.2 GEO(Gene Expression Omnibus)數(shù)據(jù)庫使用
    4.2 統(tǒng)計學(xué)方法
    4.3 結(jié)果
        4.3.1 DEPTOR在胃癌中及正常組織中的表達情況
        4.3.2 DEPTOR的表達水平與胃癌患者臨床分期及預(yù)后的相關(guān)性分析
    4.4 討論
第五章 rs4871819 位點的不同等位基因在胃癌細(xì)胞中的活性檢測
    5.1 主要實驗儀器和試劑
        5.1.1 主要實驗儀器和設(shè)備
        5.1.2 主要實驗試劑
        5.1.3 實驗材料
    5.2 實驗方法
        5.2.1 試劑配制
        5.2.2 細(xì)胞培養(yǎng)
        5.2.3 細(xì)胞的瞬時轉(zhuǎn)染
        5.2.4 熒光素酶活性的檢測
    5.3 統(tǒng)計分析
    5.4 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灲Y(jié)果
    5.5 討論
第六章 全文小結(jié)
參考文獻
綜述
    參考文獻
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
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