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玉米JAZ基因家族的生物信息學分析

發(fā)布時間:2022-05-08 08:44
  基于已發(fā)布的玉米全基因組數據,利用系列生物信息學分析軟件對玉米JAZ基因家族進行了氨基酸組成及其理化性質、蛋白質親疏水性、磷酸化位點、二級結構元件和含量、跨膜結構域、信號肽、蛋白質亞細胞定位、功能結構域預測和分析。結果表明,玉米JAZ蛋白的氨基酸殘基數目介于110~426個,相對分子質量介于11 834.49~30 494.24,理論等電點介于4.89~10.18,玉米JAZ蛋白的主要氨基酸為丙氨酸、脯氨酸、精氨酸等。穩(wěn)定性預測結果表明,玉米JAZ蛋白均為非穩(wěn)定性蛋白質;信號肽和跨膜結構域預測結果顯示,這些蛋白質均為非分泌蛋白質,不具有信號肽,且沒有明顯的跨膜結構域。JAZ蛋白二級結構元件主要為不規(guī)則卷曲、α-螺旋和延伸鏈。亞細胞定位預測結果顯示,JAZ蛋白質主要定位于細胞核;結構域預測結果表明,JAZ蛋白均含有JAZ蛋白家族典型的TIFY和CCT-2功能結構域。研究結果可為玉米JAZ基因功能研究和玉米性狀定向改良奠定理論基礎。 

【文章頁數】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料和方法
    1.1 JAZ基因堿基序列
    1.2 試驗方法
2 結果與分析
    2.1 玉米JAZ蛋白的氨基酸組成及理化性質分析
    2.2 玉米JAZ蛋白磷酸化位點預測及分析
    2.3 玉米JAZ蛋白信號肽和跨膜結構的預測分析
    2.4 玉米JAZ蛋白的二級結構及各元件含量預測
    2.5 玉米JAZ蛋白亞細胞定位預測和分析
    2.6 玉米JAZ蛋白功能結構域的預測和分析
3 結論與討論


【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3651324

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