半滑舌鰨des基因的表達(dá)及其啟動(dòng)子功能分析
發(fā)布時(shí)間:2022-02-20 02:34
利用NCBI上已經(jīng)發(fā)表的半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)基因組及轉(zhuǎn)錄組序列,發(fā)現(xiàn)了半滑舌鰨兩個(gè)有結(jié)蛋白(Desmin)基因(des和des-like),且des-like具有兩個(gè)剪切型des-likeX1、des-likeX2。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)及基因結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),半滑舌鰨的des基因和des-like基因分別與硬骨魚(yú)的des基因和des-like基因聚為一支,物種間des和des-like氨基酸序列相似性分別在90%和85%以上。保守性與染色體共線性分析發(fā)現(xiàn),半滑舌鰨的des基因和哺乳動(dòng)物的des基因具有相同的起源,而其des-like基因是通過(guò)硬骨魚(yú)的第三次全基因組復(fù)制獲得的。qRT-PCR的檢測(cè)分析發(fā)現(xiàn),des基因在腸和心臟中表達(dá)量較高,在肌肉中只是痕量表達(dá);而des-like基因則在心臟和肌肉中表達(dá)最高,在腸中痕量表達(dá),說(shuō)明des與des-like已經(jīng)出現(xiàn)了功能的分化而且可能存在功能上的互補(bǔ)效應(yīng)。有趣的是,des-likeX1只在心臟中表達(dá),本研究推測(cè)des-likeX1對(duì)于...
【文章來(lái)源】:中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,50(S1)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 半滑舌鰨des及des-like基因ORF的序列驗(yàn)證
1.3 半滑舌鰨des及des-like序列的生物信息學(xué)分析
1.4 半滑舌鰨des及des-like基因在各組織及胚胎中的表達(dá)量分析
1.5 啟動(dòng)子分析
2 結(jié)果
2.1 des、des-like基因結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2 半滑舌鰨des、des-like基因的保守性及染色體共線性分析
2.3 半滑舌鰨des、des-like基因在各組織及胚胎的表達(dá)分析
2.4 半滑舌鰨des基因的啟動(dòng)子活性分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]結(jié)蛋白對(duì)非洲爪蛙胚胎早期發(fā)育的影響[J]. 袁芳,劉佳,李卉,袁櫟. 南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(04)
[2]牛結(jié)蛋白基因啟動(dòng)子的克隆及功能的初步分析[J]. 杜巍,李樹(shù)峰,佟慧麗,楊翠翠,劉丹,嚴(yán)云勤. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]小鼠骨骼肌Desmin啟動(dòng)子的克隆及表達(dá)活性分析[J]. 薛超,安星蘭,王春生,樸善花,苗向陽(yáng),安鐵洙. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2011(07)
[4]肝再生過(guò)程中腎desmin和GFAP的表達(dá)以及MMPs的變化[J]. 張新勝,程秋妍,杜娟,王雁北,徐存拴. 河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2009(05)
[5]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis Günther)工廠化養(yǎng)殖技術(shù)的初步研究[J]. 黃大宏,余海,孫建璋. 現(xiàn)代漁業(yè)信息. 2007(08)
本文編號(hào):3634133
【文章來(lái)源】:中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,50(S1)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 半滑舌鰨des及des-like基因ORF的序列驗(yàn)證
1.3 半滑舌鰨des及des-like序列的生物信息學(xué)分析
1.4 半滑舌鰨des及des-like基因在各組織及胚胎中的表達(dá)量分析
1.5 啟動(dòng)子分析
2 結(jié)果
2.1 des、des-like基因結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2 半滑舌鰨des、des-like基因的保守性及染色體共線性分析
2.3 半滑舌鰨des、des-like基因在各組織及胚胎的表達(dá)分析
2.4 半滑舌鰨des基因的啟動(dòng)子活性分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]結(jié)蛋白對(duì)非洲爪蛙胚胎早期發(fā)育的影響[J]. 袁芳,劉佳,李卉,袁櫟. 南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(04)
[2]牛結(jié)蛋白基因啟動(dòng)子的克隆及功能的初步分析[J]. 杜巍,李樹(shù)峰,佟慧麗,楊翠翠,劉丹,嚴(yán)云勤. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]小鼠骨骼肌Desmin啟動(dòng)子的克隆及表達(dá)活性分析[J]. 薛超,安星蘭,王春生,樸善花,苗向陽(yáng),安鐵洙. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2011(07)
[4]肝再生過(guò)程中腎desmin和GFAP的表達(dá)以及MMPs的變化[J]. 張新勝,程秋妍,杜娟,王雁北,徐存拴. 河南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2009(05)
[5]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis Günther)工廠化養(yǎng)殖技術(shù)的初步研究[J]. 黃大宏,余海,孫建璋. 現(xiàn)代漁業(yè)信息. 2007(08)
本文編號(hào):3634133
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