沙門(mén)氏菌是一種重要的食源性病原菌,其耐藥性普遍,對(duì)食品安全和人類(lèi)健康造成巨大威脅。采用Illumina Miseq×10平臺(tái)對(duì)一株食源性沙門(mén)氏菌進(jìn)行高通量測(cè)序,利用SOAP denovo2組裝測(cè)序原始序列得到了完整的基因組序列,通過(guò)與6大數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)（EggNOG、GO、KEGG、NR、Pfam、Swiss-Prot）,將得到的基因進(jìn)行功能注釋。采用ResFinder3.2軟件篩查耐藥基因,使用PlasmidFinder軟件篩查質(zhì)粒并繪制質(zhì)�；驁D譜和結(jié)構(gòu)圖譜。結(jié)果表明,此株沙門(mén)氏菌攜帶了包括六大類(lèi)抗生素中共計(jì)13種與耐藥相關(guān)的基因,其中合成類(lèi)（喹諾酮類(lèi)）耐藥基因數(shù)量最多。并且篩查到的質(zhì)粒并不含耐藥基因,說(shuō)明該沙門(mén)氏菌的耐藥基因都在染色體上,而不在可移動(dòng)遺傳元件上,屬于固有耐藥。 

【文章來(lái)源】：武漢輕工大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,39(04)

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

質(zhì)粒基因組圖譜

質(zhì)粒結(jié)構(gòu)圖譜

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3626141