核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶（Rubisco）是植物光合作用的關(guān)鍵酶.利用生物信息學(xué)對糠椴Rubisco基因進(jìn)行開放閱讀框、氨基酸組成、跨膜結(jié)構(gòu)域、亞細(xì)胞定位和結(jié)合區(qū)分析,預(yù)測糠椴Rubisco的親/疏水性和二級結(jié)構(gòu),通過同源建模構(gòu)建糠椴Rubisco的三維結(jié)構(gòu).結(jié)果表明:糠椴Rubisco基因共有5個開放閱讀框,其中最長的開放閱讀框?yàn)? 454 bp;糠椴Rubisco為親水蛋白,共有12個蛋白結(jié)合區(qū),含有20種氨基酸,由34.92%的α螺旋、11.36%的β折疊和53.72%的無規(guī)則卷曲組成.該結(jié)果可為研究糠椴Rubisco基因結(jié)構(gòu)和功能提供參考. 

【文章來源】：北華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,21(04)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

糠椴Rubisco基因的開放閱讀框

糠椴Rubisco的氨基酸組成

跨膜蛋白在細(xì)胞增殖和分化、能量轉(zhuǎn)換、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及物質(zhì)運(yùn)輸?shù)确矫婢哂兄匾饔茫墙閷?dǎo)細(xì)胞間物質(zhì)和能量信號的傳遞者[23]．通過TMHMM分析糠椴Rubisco的跨膜區(qū)發(fā)現(xiàn)，糠椴Rubisco在膜內(nèi)的概率為0，在膜外的概率為100%(圖4)，說明糠椴Rubisco不存在跨膜結(jié)構(gòu)域．圖4 糠椴Rubisco的跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]蒙古櫟-糠椴天然混交林空間格局研究[J]. 李艷麗,楊華,鄧華鋒.  北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]遮光下糠椴幼苗的適應(yīng)性研究[J]. 劉興,趙丹,楊曉,金夢然,史寶勝.  新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(02)
[3]糠椴花揮發(fā)性成分HS-SPME-GCMS分析[J]. 王建剛,趙軼博,羅航.  山東化工. 2018(24)
[4]常綠杜鵑組植物Rubisco大亞基（RbcL）的生物信息學(xué)預(yù)測及分析[J]. 周曉馥,陳思霖,武慧,徐洪偉.  北方園藝. 2016(23)
[5]香蕉1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶小亞基克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 魏軍亞,劉德兵,陳業(yè)淵,魏守興,謝子四,劉國銀.  中國園藝文摘. 2015(01)
[6]毛果楊HDAC基因家族序列及其表達(dá)分析[J]. 李淑娟,張超,張彥妮,董亞茹,馬旭俊.  西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(03)
[7]植物基因組上游開放閱讀框的挖掘方法及其翻譯調(diào)控[J]. 王庭璋,胡望雄,徐建紅,薛慶中.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(16)
[8]糠椴和紫椴木質(zhì)部比較研究[J]. 倪福太,馬冰,李長有,王占武,劉強(qiáng).  吉林師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(03)
[9]椴屬資源的現(xiàn)狀與發(fā)展對策研究[J]. 龍作義,胡玉琴.  中國林副特產(chǎn). 2013(03)
[10]蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法的評價(jià)[J]. 孟翔燕,孟軍,葛家麒.  生物信息學(xué). 2010(03)

碩士論文
[1]兩種忍冬屬植物和糠椴的傳粉生物學(xué)觀察[D]. 李宇艷.東北師范大學(xué) 2010



本文編號：3618822