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松材線蟲Bxy012009、Bxy005783和Bxy003854表達(dá)特性與功能分析

發(fā)布時(shí)間:2022-02-08 13:04
  松材線蟲。≒ine wilt disease)是由松材線蟲(Bursaphelenchus xylophilus)引起的毀滅性的松屬植物流行性病害。松材線蟲病常年在我國(guó)多個(gè)省市發(fā)生,造成嚴(yán)重?fù)p失。近來研究發(fā)現(xiàn)松材線蟲作為外來入侵物種其入侵性與其繁殖率有密切聯(lián)系,且種群性比是影響繁殖率的重要因素,但目前對(duì)于松材線蟲性別決定和分化機(jī)制尚不清楚。另一方面,松材線蟲dauer幼蟲階段具有較強(qiáng)適應(yīng)不良環(huán)境的能力,且dauer幼蟲能借由天牛的取食活動(dòng)進(jìn)行擴(kuò)散,但對(duì)于松材線蟲dauer幼蟲的形成機(jī)制尚未明確。深入研究松材線蟲性別決定和dauer幼蟲形成機(jī)制問題有利于發(fā)展新的松材線蟲病防控策略。本研究本研究參考秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans)性別決定基因fem-1和fem-2,以及與dauer幼蟲形成基因daf-12,克隆松材線蟲中同源基因?寺~@得松材線蟲Bxy012009、Bxy005783和Bxy003854片段后,采用實(shí)時(shí)定量PCR、原位雜交、RNA干擾等技術(shù),探究其時(shí)空動(dòng)態(tài)表達(dá)特性和調(diào)控功能。具體研究結(jié)果如下:一、實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果表明,Bxy012009和Bx... 

【文章來源】:浙江農(nóng)林大學(xué)浙江省

【文章頁數(shù)】:65 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

松材線蟲Bxy012009、Bxy005783和Bxy003854表達(dá)特性與功能分析


秀麗隱桿線蟲性別決定信號(hào)通路[51]

模型圖,模型,受體,途徑


1文獻(xiàn)綜述9圖1.4dauer形成調(diào)控模型[70]Figure1.4AmodelfortheregulatoryplasticityofdauerformationTGF-β途徑是調(diào)節(jié)dauer形成的主要內(nèi)分泌途徑之一[75]。通過遺傳分組,daf-1和daf-4,daf-7,daf-8和daf-14突變體(均為Daf-c)都可以被daf-3和daf-5(均為Daf-d)有效抑制[76]。這些Daf-c基因型還顯示出對(duì)取食和覓食的影響,增加脂肪沉積和卵子滯留。這些基因確定了TGF-β信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的核心成分:daf-7基因編碼TGF-β,daf-1和daf-4分別編碼I型和II型TGF-β受體[77-78]。daf-3,daf-8和daf-14編碼SMAD,是該途徑的核效應(yīng)子[79-80]。最后,daf-5編碼轉(zhuǎn)錄因子SNO/SKI,與SMAD相互作用[81]。daf-7/TGF-β僅在ASI神經(jīng)感覺細(xì)胞中表達(dá),而下游受體和轉(zhuǎn)錄因子則廣泛表達(dá)[82-83]。正如遺傳學(xué)所預(yù)測(cè)的那樣,daf-7/TGF-β在神經(jīng)細(xì)胞中特異表達(dá),其表達(dá)受到食物的正向調(diào)節(jié),并受到dauer信息素和高溫的抑制[82,84]。在有利的條件下,高水平分泌的daf-7/TGF-β結(jié)合并激活靶組織中的DAF-1/4受體激酶。這些受體被認(rèn)為會(huì)磷酸化daf-8和daf-14編碼的SMAD,從而導(dǎo)致其活化,從而抑制和daf-5/SNOSKI形成復(fù)合物,并促進(jìn)能量代謝和生殖生長(zhǎng)。在不利的條件下,減少daf-7/TGF-β的表達(dá),daf-5/SNOSK與daf-3/SMAD形成復(fù)合體,抑制daf-9基因的表達(dá),使得線蟲進(jìn)入dauer期[85-86]。且有研究表

序列,基因,序列,蛋白


松材線蟲Bxy012009、Bxy005783和Bxy003854表達(dá)特性與功能分析263結(jié)果與分析3.1松材線蟲Bxy012009、Bxy005783和Bxy003854基因生物信息學(xué)分析3.1.1松材線蟲Bxy012009基因生物信息學(xué)分析以松材線蟲cDNA為模板,用特異性引物PCR擴(kuò)增后得到一條約856bp的Bxy012009基因片段。利用NCBI的ORFfinder進(jìn)行開放閱讀框搜索,發(fā)現(xiàn)Bxy012009包含一個(gè)681bp的完整ORF,編碼226個(gè)氨基酸,且對(duì)序列進(jìn)行分析顯示與fem-1基因高度同源。通過蛋白質(zhì)序列理化參數(shù)計(jì)算軟件ExPASyProtParamtool獲得了fem-1基因蛋白的分子式為:C1100H1756N296O351S14,分子量為25.19kDa,全長(zhǎng)蛋白的理論等電點(diǎn)pI值為4.8。推測(cè)其體外半衰期為30h,不穩(wěn)定指數(shù)(II)為26.14,是一類較穩(wěn)定的蛋白。TMHMM預(yù)測(cè)結(jié)果顯示該蛋白不含有跨膜結(jié)構(gòu)域;SignalP3.0Server預(yù)測(cè)結(jié)果顯示該蛋白不具有N端的信號(hào)肽序列,表明蛋白可能定位在細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)或細(xì)胞器。利用DNAMAN多序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),Bxy012009編碼的蛋白與多個(gè)物種的錨蛋白重復(fù)序列具有較高一致性(如圖3.1A),表明該蛋白屬于含有ANK重復(fù)序列的一類蛋白。利用MEGA7對(duì)不同物種的fem-1蛋白序列做系統(tǒng)發(fā)育分析,結(jié)果顯示,松材線蟲Bxy012009與秀麗隱桿線蟲位于同一分支,并與其它物種區(qū)分開來(圖3.1B)。注:A蛋白序列比對(duì);B進(jìn)化分析圖3.1Bxy012009基因序列比對(duì)與發(fā)育進(jìn)化分析Figure3.1SequencealignmentandphylogeneticanalysisofBxy012009

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3615116

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