黃毛草莓FnMYB24轉(zhuǎn)錄因子基因和啟動(dòng)子的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-24 05:23
該研究以黃毛草莓(Fragaria nilgerrensis Schltdl.)為材料,采用RT-PCR技術(shù)克隆了黃毛草莓FnMYB24基因的cDNA和啟動(dòng)子序列。生物信息學(xué)分析表明,FnMYB24的cDNA序列長(zhǎng)為1 033 bp(GenBank登錄號(hào)為MN879283),其開(kāi)放閱讀框(ORF)長(zhǎng)為609 bp,編碼202個(gè)氨基酸,含有1個(gè)保守的MYBDNA-binding結(jié)構(gòu)域。同源分析結(jié)果顯示,黃毛草莓FnMYB24基因編碼的氨基酸序列與森林草莓(Fragaria vesca)編碼的氨基酸相似性較高;同時(shí)進(jìn)一步克隆了該基因編碼起始位點(diǎn)上游長(zhǎng)度為718 bp啟動(dòng)子序列(GenBank登錄號(hào)為MN879285),預(yù)測(cè)該序列包含激素響應(yīng)元件、光調(diào)控元件等多個(gè)順式作用元件。通過(guò)構(gòu)建pFnMYB24∷GUS表達(dá)載體進(jìn)行煙草瞬時(shí)轉(zhuǎn)化,發(fā)現(xiàn)pFnMYB24啟動(dòng)子具有轉(zhuǎn)錄活性且能夠驅(qū)動(dòng)FnMYB24基因表達(dá)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示:抗病品種黃毛草莓和易感病栽培品種‘妙香3號(hào)’的葉片接種膠孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)后MYB24...
【文章來(lái)源】:西北植物學(xué)報(bào). 2020,40(10)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
黃毛草莓FnMYB24基因的PCR擴(kuò)增及檢測(cè)
從黃毛草莓中克隆并測(cè)序了FnMYB24的上游718 bp的啟動(dòng)子序列(圖5),命名為pFnMYB24(GenBank登錄號(hào)為MN879285),利用PlantCare在線(xiàn)軟件對(duì)啟動(dòng)子的順式作用元件進(jìn)行預(yù)測(cè)(圖6),結(jié)果顯示:FnMYB24啟動(dòng)子基因組序列上除TATA-box(轉(zhuǎn)錄起始-30核心啟動(dòng)子元件)、CAAT-box(啟動(dòng)子和增強(qiáng)子區(qū)的一般順式作用元件)等基本順式作用元件之外,還存在逆境誘導(dǎo)位點(diǎn)的TCA元件、應(yīng)激反應(yīng)元件STRE、參與光反應(yīng)的G-Box元件以及參與損傷與防御反應(yīng)元件WRE3。這些元件的存在表明黃毛草莓FnMYB24啟動(dòng)子可能響應(yīng)多種生物及非生物脅迫。圖4 黃毛草莓FnMYB24氨基酸序列和其他植物
黃毛草莓FnMYB24氨基酸序列和其他植物
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃毛草莓編碼NB-ARC結(jié)構(gòu)域的FnCN基因和啟動(dòng)子克隆及FnCN基因表達(dá)分析[J]. 胡玉慈,姚立萍,張童,何淑敏,唐鑫彪,陳清西,文志豐. 植物資源與環(huán)境學(xué)報(bào). 2020(04)
[2]柑橘R2R3-MYB類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子CitMYB20的克隆與表達(dá)分析[J]. 范海芳,彭蘊(yùn),張慶雯,何永睿,鄒修平,李強(qiáng),彭愛(ài)紅,許蘭珍,雷天剛,陳善春,姚利曉. 分子植物育種. 2019(10)
[3]馬鈴薯R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子的克隆及植物表達(dá)載體的構(gòu)建[J]. 楊奕琦,徐佳妮,秦玉芝,熊興耀,周倩. 分子植物育種. 2018(18)
[4]黃毛草莓和五葉草莓的耐熱性及其對(duì)高溫的響應(yīng)[J]. 郭玲玲,李鈞敏,閆明. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(09)
[5]水楊酸對(duì)草莓炭疽病響應(yīng)基因FaNBS20表達(dá)的影響[J]. 張慶雨,劉芳春,段可,王飛,王延秀,高清華. 園藝學(xué)報(bào). 2014(01)
[6]華東葡萄抗白粉病VpMYBR1基因表達(dá)與功能分析[J]. 侯鴻敏,王浩,殷向靜,閆琴,王躍進(jìn),王西平. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(07)
[7]MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物抗逆脅迫中的作用及其分子機(jī)理[J]. 劉蕾,杜海,唐曉鳳,吳燕民,黃玉碧,唐益雄. 遺傳. 2008(10)
[8]中國(guó)草莓屬(Fragaria)植物的分類(lèi)研究[J]. 雷家軍,代漢萍,譚昌華,鄧明琴,趙密珍,錢(qián)亞明. 園藝學(xué)報(bào). 2006(01)
博士論文
[1]擬南芥轉(zhuǎn)錄因子MYB73抗核盤(pán)菌的分子機(jī)制研究[D]. 賈嬌.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]小麥MYB轉(zhuǎn)錄因子TaMYB86和TaRIM1的分子特征與防御功能分析[D]. 單天雷.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]轉(zhuǎn)錄因子AtMYB44促進(jìn)擬南芥抗病耐熱及抑制開(kāi)花的作用[D]. 田雙梅.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]中國(guó)草莓屬野生資源及白草莓育種初探[D]. 明曉.北京林業(yè)大學(xué) 2012
[4]野生草莓種質(zhì)資源對(duì)膠孢炭疽菌的抗性研究[D]. 黃金鳳.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3605941
【文章來(lái)源】:西北植物學(xué)報(bào). 2020,40(10)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
黃毛草莓FnMYB24基因的PCR擴(kuò)增及檢測(cè)
從黃毛草莓中克隆并測(cè)序了FnMYB24的上游718 bp的啟動(dòng)子序列(圖5),命名為pFnMYB24(GenBank登錄號(hào)為MN879285),利用PlantCare在線(xiàn)軟件對(duì)啟動(dòng)子的順式作用元件進(jìn)行預(yù)測(cè)(圖6),結(jié)果顯示:FnMYB24啟動(dòng)子基因組序列上除TATA-box(轉(zhuǎn)錄起始-30核心啟動(dòng)子元件)、CAAT-box(啟動(dòng)子和增強(qiáng)子區(qū)的一般順式作用元件)等基本順式作用元件之外,還存在逆境誘導(dǎo)位點(diǎn)的TCA元件、應(yīng)激反應(yīng)元件STRE、參與光反應(yīng)的G-Box元件以及參與損傷與防御反應(yīng)元件WRE3。這些元件的存在表明黃毛草莓FnMYB24啟動(dòng)子可能響應(yīng)多種生物及非生物脅迫。圖4 黃毛草莓FnMYB24氨基酸序列和其他植物
黃毛草莓FnMYB24氨基酸序列和其他植物
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃毛草莓編碼NB-ARC結(jié)構(gòu)域的FnCN基因和啟動(dòng)子克隆及FnCN基因表達(dá)分析[J]. 胡玉慈,姚立萍,張童,何淑敏,唐鑫彪,陳清西,文志豐. 植物資源與環(huán)境學(xué)報(bào). 2020(04)
[2]柑橘R2R3-MYB類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子CitMYB20的克隆與表達(dá)分析[J]. 范海芳,彭蘊(yùn),張慶雯,何永睿,鄒修平,李強(qiáng),彭愛(ài)紅,許蘭珍,雷天剛,陳善春,姚利曉. 分子植物育種. 2019(10)
[3]馬鈴薯R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子的克隆及植物表達(dá)載體的構(gòu)建[J]. 楊奕琦,徐佳妮,秦玉芝,熊興耀,周倩. 分子植物育種. 2018(18)
[4]黃毛草莓和五葉草莓的耐熱性及其對(duì)高溫的響應(yīng)[J]. 郭玲玲,李鈞敏,閆明. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(09)
[5]水楊酸對(duì)草莓炭疽病響應(yīng)基因FaNBS20表達(dá)的影響[J]. 張慶雨,劉芳春,段可,王飛,王延秀,高清華. 園藝學(xué)報(bào). 2014(01)
[6]華東葡萄抗白粉病VpMYBR1基因表達(dá)與功能分析[J]. 侯鴻敏,王浩,殷向靜,閆琴,王躍進(jìn),王西平. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(07)
[7]MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物抗逆脅迫中的作用及其分子機(jī)理[J]. 劉蕾,杜海,唐曉鳳,吳燕民,黃玉碧,唐益雄. 遺傳. 2008(10)
[8]中國(guó)草莓屬(Fragaria)植物的分類(lèi)研究[J]. 雷家軍,代漢萍,譚昌華,鄧明琴,趙密珍,錢(qián)亞明. 園藝學(xué)報(bào). 2006(01)
博士論文
[1]擬南芥轉(zhuǎn)錄因子MYB73抗核盤(pán)菌的分子機(jī)制研究[D]. 賈嬌.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]小麥MYB轉(zhuǎn)錄因子TaMYB86和TaRIM1的分子特征與防御功能分析[D]. 單天雷.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]轉(zhuǎn)錄因子AtMYB44促進(jìn)擬南芥抗病耐熱及抑制開(kāi)花的作用[D]. 田雙梅.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]中國(guó)草莓屬野生資源及白草莓育種初探[D]. 明曉.北京林業(yè)大學(xué) 2012
[4]野生草莓種質(zhì)資源對(duì)膠孢炭疽菌的抗性研究[D]. 黃金鳳.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3605941
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