魔芋expansin基因的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-19 09:28
魔芋(Amorphophallus)是目前唯一能大量合成葡甘露聚糖的經(jīng)濟(jì)作物,而且葡甘露聚糖主要貯藏于地下球莖中。Expansin是對(duì)植物生長發(fā)育具有廣泛效應(yīng)的酶蛋白,其家族成員眾多,目前已經(jīng)在不同種屬植物中進(jìn)行了大量的基因克隆和功能驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)它們?cè)诟、莖、葉、花、果實(shí)等多個(gè)植物器官生長發(fā)育過程中參與調(diào)控,其在生物工程上的應(yīng)用前景非常廣大。近年來研究證明,Expansin對(duì)植物變態(tài)莖的發(fā)育也有明顯的促進(jìn)作用。因此,對(duì)Expansin基因序列、初步功能及表達(dá)模式的深入研究,可以為其生物應(yīng)用的研究探索提供理論依據(jù)。本研究以白魔芋(Amorphophallus albus,Aa)和花魔芋(Amorphophallus konjac,Ak)的Expansin蛋白編碼基因EXPA家族為切入點(diǎn),并基于花魔芋轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,分別克隆到其4個(gè)家族成員,進(jìn)行了生物信息學(xué)分析和基因表達(dá)分析,得到主要結(jié)果如下:1.通過設(shè)計(jì)保守區(qū)的簡并引物,PCR擴(kuò)增獲得同源基因保守序列,再結(jié)合花魔芋轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,通過手動(dòng)拼接與電子克隆獲得白魔芋和花魔芋EXPA基因家族各4個(gè)成員,分別命名為AaEXPA1、4、8、13與AkE...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
expansin及相關(guān)蛋白結(jié)構(gòu)的分布
圖 1-3 expansin 的作用機(jī)制模型之一Fig. 1-3 The one Model of expansin Mechanism是于 2000 年提出的(圖 1-4),該種模型認(rèn)為,expansin 將的小片段襯質(zhì)多糖暫時(shí)松弛,而細(xì)胞壁水解酶類(如內(nèi)切它們并將其切成更小的片段。此種模型認(rèn)為植物 expansin能使其延展。轉(zhuǎn)糖基酶(如 XET)將細(xì)胞壁內(nèi)小片段襯質(zhì)的 H+-ATPases(星號(hào)表示)降低細(xì)胞壁 pH 值,因此激活酸性環(huán)境下發(fā)揮作用的酶類,鈍化了需要中性條件的酶類(
圖 1-3 expansin 的作用機(jī)制模型之一Fig. 1-3 The one Model of expansin Mechanism種是于 2000 年提出的(圖 1-4),該種模型認(rèn)為,expansin 將結(jié)合在上的小片段襯質(zhì)多糖暫時(shí)松弛,而細(xì)胞壁水解酶類(如內(nèi)切葡聚糖近它們并將其切成更小的片段。此種模型認(rèn)為植物 expansin 可以削不能使其延展。轉(zhuǎn)糖基酶(如 XET)將細(xì)胞壁內(nèi)小片段襯質(zhì)多糖重上的 H+-ATPases(星號(hào)表示)降低細(xì)胞壁 pH 值,因此激活了 ex在酸性環(huán)境下發(fā)揮作用的酶類,鈍化了需要中性條件的酶類(Wue
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番薯屬植物基因組測(cè)序最新進(jìn)展[J]. 楊俊,范維娟,王紅霞,趙姍姍,吳銀亮,張鵬. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(05)
[2]魔芋新品種‘秦魔1號(hào)’[J]. 李川,崔鳴,王顯安,趙興喜,李增義,劉列平. 園藝學(xué)報(bào). 2014(10)
[3]植物基因組測(cè)序的研究進(jìn)展[J]. 陳勇,柳亦松,曾建國. 生命科學(xué)研究. 2014(01)
[4]小麥膨脹素基因TaEXPB8部分同源cDNA序列的克隆、定位及表達(dá)分析[J]. 陳琰,鐘伶桃,姚穎垠,彭惠茹,倪中福,孫其信. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2010(04)
[5]魔芋新品種‘云芋1號(hào)’[J]. 李勇軍,王玲,陳建華,馬繼瓊,尹桂芳,姜德有,徐云. 園藝學(xué)報(bào). 2010(02)
[6]魔芋新品種渝魔1號(hào)[J]. 牛義,張大學(xué),劉海利,王啟軍,劉紅艷,張盛林. 中國蔬菜. 2010(03)
[7]蘿卜擴(kuò)展蛋白基因RsEXPB1克隆與表達(dá)特征分析[J]. 荊贊革,柳李旺,龔義勤,姜立娜,孫新菊,周艷孔. 分子植物育種. 2009(04)
[8]魔芋葡甘聚糖功能特性研究及其在食品工業(yè)中的應(yīng)用[J]. 倪學(xué)文. 中國食物與營養(yǎng). 2007(05)
[9]魔芋種質(zhì)資源的AFLP分析[J]. 滕彩珠,刁英,易繼碧,宗剛瓊,陳永波,韓永華,胡中立. 氨基酸和生物資源. 2006(04)
[10]魔芋葡甘聚糖在環(huán)保、醫(yī)藥及食品中的應(yīng)用[J]. 彭述輝,龐杰. 長江蔬菜. 2006(12)
博士論文
[1]玉米EXPANSIN家族胚乳特異表達(dá)基因鑒定及ZmEXPB13功能分析[D]. 張偉.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]黃梁木α擴(kuò)展蛋白的基因克隆及功能研究[D]. 歐陽昆唏.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[3]花魔芋微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)及魔芋屬植物遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 潘程.武漢大學(xué) 2012
[4]金蕎麥[Fagopyrum dibotrys (D.Don) Hara]類黃酮生物合成途徑重要功能基因的克隆、功能驗(yàn)證及表達(dá)特性分析[D]. 馬婧.西南大學(xué) 2012
[5]蠟梅非特異性脂轉(zhuǎn)移蛋白基因nsLTP家族成員克隆及其抗逆功能分析[D]. 劉群.西南大學(xué) 2009
[6]柿果實(shí)擴(kuò)張蛋白cDNA克隆及其生物活性研究[D]. 童斌.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2003
碩士論文
[1]魔芋內(nèi)參基因篩選及HSFA1基因表達(dá)分析[D]. 王凱.西南大學(xué) 2017
[2]魔芋耐熱性鑒定及熱激蛋白HSP基因的克隆與初步分析[D]. 白立偉.西南大學(xué) 2016
[3]芥菜AGL24基因的啟動(dòng)子克隆與其互作因子SOC1遺傳轉(zhuǎn)化研究[D]. 陳嬌.西南大學(xué) 2016
[4]魔芋源庫關(guān)系研究[D]. 唐繁.西南大學(xué) 2015
[5]魔芋多酚氧化酶基因的克隆與序列分析[D]. 張潔.西南大學(xué) 2014
[6]魔芋種質(zhì)資源形態(tài)多樣性與ISSR分析[D]. 宣慢.西南大學(xué) 2010
[7]病程相關(guān)蛋白基因StPRp27對(duì)魔芋軟腐病抗性研究[D]. 陳偉達(dá).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[8]魔芋轉(zhuǎn)基因體系的建立[D]. 嚴(yán)華兵.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[9]AGP小亞基反義基因?qū)肽в笱芯縖D]. 李貞霞.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2002
本文編號(hào):3596624
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
expansin及相關(guān)蛋白結(jié)構(gòu)的分布
圖 1-3 expansin 的作用機(jī)制模型之一Fig. 1-3 The one Model of expansin Mechanism是于 2000 年提出的(圖 1-4),該種模型認(rèn)為,expansin 將的小片段襯質(zhì)多糖暫時(shí)松弛,而細(xì)胞壁水解酶類(如內(nèi)切它們并將其切成更小的片段。此種模型認(rèn)為植物 expansin能使其延展。轉(zhuǎn)糖基酶(如 XET)將細(xì)胞壁內(nèi)小片段襯質(zhì)的 H+-ATPases(星號(hào)表示)降低細(xì)胞壁 pH 值,因此激活酸性環(huán)境下發(fā)揮作用的酶類,鈍化了需要中性條件的酶類(
圖 1-3 expansin 的作用機(jī)制模型之一Fig. 1-3 The one Model of expansin Mechanism種是于 2000 年提出的(圖 1-4),該種模型認(rèn)為,expansin 將結(jié)合在上的小片段襯質(zhì)多糖暫時(shí)松弛,而細(xì)胞壁水解酶類(如內(nèi)切葡聚糖近它們并將其切成更小的片段。此種模型認(rèn)為植物 expansin 可以削不能使其延展。轉(zhuǎn)糖基酶(如 XET)將細(xì)胞壁內(nèi)小片段襯質(zhì)多糖重上的 H+-ATPases(星號(hào)表示)降低細(xì)胞壁 pH 值,因此激活了 ex在酸性環(huán)境下發(fā)揮作用的酶類,鈍化了需要中性條件的酶類(Wue
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番薯屬植物基因組測(cè)序最新進(jìn)展[J]. 楊俊,范維娟,王紅霞,趙姍姍,吳銀亮,張鵬. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(05)
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[5]魔芋新品種‘云芋1號(hào)’[J]. 李勇軍,王玲,陳建華,馬繼瓊,尹桂芳,姜德有,徐云. 園藝學(xué)報(bào). 2010(02)
[6]魔芋新品種渝魔1號(hào)[J]. 牛義,張大學(xué),劉海利,王啟軍,劉紅艷,張盛林. 中國蔬菜. 2010(03)
[7]蘿卜擴(kuò)展蛋白基因RsEXPB1克隆與表達(dá)特征分析[J]. 荊贊革,柳李旺,龔義勤,姜立娜,孫新菊,周艷孔. 分子植物育種. 2009(04)
[8]魔芋葡甘聚糖功能特性研究及其在食品工業(yè)中的應(yīng)用[J]. 倪學(xué)文. 中國食物與營養(yǎng). 2007(05)
[9]魔芋種質(zhì)資源的AFLP分析[J]. 滕彩珠,刁英,易繼碧,宗剛瓊,陳永波,韓永華,胡中立. 氨基酸和生物資源. 2006(04)
[10]魔芋葡甘聚糖在環(huán)保、醫(yī)藥及食品中的應(yīng)用[J]. 彭述輝,龐杰. 長江蔬菜. 2006(12)
博士論文
[1]玉米EXPANSIN家族胚乳特異表達(dá)基因鑒定及ZmEXPB13功能分析[D]. 張偉.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]黃梁木α擴(kuò)展蛋白的基因克隆及功能研究[D]. 歐陽昆唏.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[3]花魔芋微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)及魔芋屬植物遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 潘程.武漢大學(xué) 2012
[4]金蕎麥[Fagopyrum dibotrys (D.Don) Hara]類黃酮生物合成途徑重要功能基因的克隆、功能驗(yàn)證及表達(dá)特性分析[D]. 馬婧.西南大學(xué) 2012
[5]蠟梅非特異性脂轉(zhuǎn)移蛋白基因nsLTP家族成員克隆及其抗逆功能分析[D]. 劉群.西南大學(xué) 2009
[6]柿果實(shí)擴(kuò)張蛋白cDNA克隆及其生物活性研究[D]. 童斌.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2003
碩士論文
[1]魔芋內(nèi)參基因篩選及HSFA1基因表達(dá)分析[D]. 王凱.西南大學(xué) 2017
[2]魔芋耐熱性鑒定及熱激蛋白HSP基因的克隆與初步分析[D]. 白立偉.西南大學(xué) 2016
[3]芥菜AGL24基因的啟動(dòng)子克隆與其互作因子SOC1遺傳轉(zhuǎn)化研究[D]. 陳嬌.西南大學(xué) 2016
[4]魔芋源庫關(guān)系研究[D]. 唐繁.西南大學(xué) 2015
[5]魔芋多酚氧化酶基因的克隆與序列分析[D]. 張潔.西南大學(xué) 2014
[6]魔芋種質(zhì)資源形態(tài)多樣性與ISSR分析[D]. 宣慢.西南大學(xué) 2010
[7]病程相關(guān)蛋白基因StPRp27對(duì)魔芋軟腐病抗性研究[D]. 陳偉達(dá).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[8]魔芋轉(zhuǎn)基因體系的建立[D]. 嚴(yán)華兵.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[9]AGP小亞基反義基因?qū)肽в笱芯縖D]. 李貞霞.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2002
本文編號(hào):3596624
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