星豹蛛是農(nóng)業(yè)害蟲的重要捕食性天敵。通過轉(zhuǎn)錄組測序鑒定出66條星豹蛛細(xì)胞色素P450基因,進(jìn)一步篩選分析出5條基因,預(yù)測其與外源物質(zhì)代謝有關(guān)。為進(jìn)一步研究星豹蛛細(xì)胞色素P450功能和代謝機(jī)制,選取其中一條基因進(jìn)行生物信息學(xué)研究。試驗(yàn)通過RT-PCR擴(kuò)增技術(shù),將星豹蛛總RNA反轉(zhuǎn)錄cDNA,后以此為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,回收純化產(chǎn)物完成單克隆并測序,獲取該基因序列信息,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),克隆到CYP3001U15基因ORF序列,該基因開放閱讀框?yàn)? 074 bp,編碼357個(gè)氨基酸,分子質(zhì)量為42 ku,等電點(diǎn)為5.91,原子總數(shù)為5 808,分子式為C₁₈₇₇H₂₈₉₆N₄₉₄O₅₃₁S₁₀;正電荷殘基47個(gè),占氨基酸總數(shù)的13.2%,負(fù)電荷殘基52個(gè),占氨基酸總數(shù)的14.6%;蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果顯示,α螺旋占47.62%,β折疊占8.96%,β轉(zhuǎn)角占4.76%,無規(guī)則卷曲占38.66%;亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果顯示,其定位在細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上;蛋白信號肽預(yù)測結(jié)果顯示,該... 

【文章來源】：山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(06)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 主要試劑
    1.3 試驗(yàn)方法
        1.3.1 星豹蛛總RNA的提取及c DNA的合成
        1.3.2 CYP3001U15基因克隆
        1.3.3 CYP3001U15基因及其編碼產(chǎn)物的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 CYP3001U15基因克隆
    2.2 CYP3001U15編碼的蛋白理化性質(zhì)分析
    2.3 CYP3001U15跨膜預(yù)測、信號肽和亞細(xì)胞定位分析
    2.4 CYP3001U15編碼的蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析
    2.5 CYP3001U15編碼的蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.6 CYP3001U15基因編碼蛋白與其他蛛形綱物種系統(tǒng)發(fā)育樹分析
3 結(jié)論與討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]四環(huán)素類藥物對鯉細(xì)胞色素P450酶系生化指標(biāo)的影響[J]. 李在建,劉文強(qiáng),司振書,朱明霞.  河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(07)
[2]3種重金屬對星豹蛛SOD與CAT活性的影響[J]. 張曉陽,馬敏,李銳,李生才.  內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(06)
[3]昆蟲細(xì)胞色素P450抑制劑及殺蟲劑面臨的挑戰(zhàn)與機(jī)遇[J]. 筱禾.  世界農(nóng)藥. 2015(06)
[4]溫度誘導(dǎo)對星豹蛛熱激蛋白hsp70和hsp90基因表達(dá)的影響[J]. 李銳,劉佳,李薩麗,李娜,李生才,洪堅(jiān)平.  植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(03)
[5]3種殺蟲劑對星豹蛛的室內(nèi)毒力測定[J]. 李娜,李銳,馬敏,李生才.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(09)
[6]低劑量殺蟲劑對星豹蛛捕食效應(yīng)的影響及其機(jī)理[J]. 李銳,李娜,劉佳,李生才,洪堅(jiān)平.  生態(tài)學(xué)報(bào). 2014(10)
[7]云南切梢小蠹細(xì)胞色素P450基因的克隆與分析[J]. 季梅,澤桑梓.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(23)
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[9]野桑蠶抗性基因P450 cDNA片段的克隆[J]. 衛(wèi)正國,沈衛(wèi)德,王文兵,王利群.  江蘇蠶業(yè). 2004(03)
[10]細(xì)胞色素P450介導(dǎo)的昆蟲抗藥性[J]. 邱星輝,何鳳琴,李梅.  生命的化學(xué). 2003(04)

博士論文
[1]柑橘全爪螨細(xì)胞色素P450及其相關(guān)基因的鑒定和表達(dá)模式研究[D]. 丁天波.西南大學(xué) 2014
[2]飛蝗細(xì)胞色素P450基因的分子特性及功能研究[D]. 郭艷瓊.山西大學(xué) 2012

碩士論文
[1]蓮草直胸跳甲細(xì)胞色素P450的生物信息學(xué)分析[D]. 李鑫.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]甘藍(lán)夜蛾細(xì)胞色素P450基因的克隆及功能分析[D]. 周夏.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]飛蝗三個(gè)P450基因的分子特性及功能分析[D]. 于榮榮.山西大學(xué) 2012



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