利用CRISPR/Cas9技術(shù)獲得水稻恢復(fù)系Bsr-d1基因突變體
發(fā)布時間:2022-01-15 23:06
為研究水稻抗稻瘟病基因Bsr-d1在雜交水稻恢復(fù)系中的功能,我們利用CRISPR/Cas9定點基因編輯方法,設(shè)計2個敲除靶標(biāo)位點,構(gòu)建了Bsr-d1基因編輯載體,并通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化水稻恢復(fù)系品種‘GH998’,成功獲得了轉(zhuǎn)基因植株,并在T1代篩選到4個無轉(zhuǎn)基因成分的純合突變株系。純合突變株系有4種突變類型,包括第199號堿基處缺失17個堿基、第212號堿基處缺失4個堿基、第216號堿基處插入1個堿基、第216號堿基處插入2個堿基突變類型。通過蛋白序列分析,發(fā)現(xiàn)純合突變株系都存在移碼現(xiàn)象導(dǎo)致氨基酸變化并提前終止翻譯。本研究成功利用CRISPR/Cas9基因編輯方法敲除水稻恢復(fù)系‘GH998’中Bsr-d1基因,獲得無轉(zhuǎn)基因成分的純合突變株系,為進(jìn)一步研究Bsr-d1基因在雜交水稻上的功能提供了理論依據(jù)和品種資源。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(16)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
Bsr-d1基因結(jié)構(gòu)及g RNA靶點位置
將攜帶Bsr-d1基因2個靶標(biāo)的表達(dá)載體CRIS-PR-Cas9-BSRD1通過農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化恢復(fù)系秈稻‘GH9-98’后,共獲得22株T0代轉(zhuǎn)基因株系。用抗潮霉素基因引物Hyg-F/Hyg-R檢測以篩選轉(zhuǎn)基因陽性植株。結(jié)果發(fā)現(xiàn)22株T0代轉(zhuǎn)基因植株都帶有抗性基因,陽性率為100%。為了分析‘GH998’中Bsr-d1基因的突變情況,用引物BSRD1-F/BSRD1-R擴增基因,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序分析。測序結(jié)果表明,有13株陽性轉(zhuǎn)基因苗在靶標(biāo)2處發(fā)生了突變,突變率為59.1%,其中有4株為純合突變,占30.8%,9株為雜合突變,占69.2%;而在靶標(biāo)1處沒有檢測到有突變的植株。靶標(biāo)2處的突變基因型包括純合突變和雜合突變,突變類型包括堿基插入和缺失,以堿基缺失為主,占61.5%(表2)。
為了分析‘GH998’中Bsr-d1基因的突變情況,用引物BSRD1-F/BSRD1-R擴增基因,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序分析。測序結(jié)果表明,有13株陽性轉(zhuǎn)基因苗在靶標(biāo)2處發(fā)生了突變,突變率為59.1%,其中有4株為純合突變,占30.8%,9株為雜合突變,占69.2%;而在靶標(biāo)1處沒有檢測到有突變的植株。靶標(biāo)2處的突變基因型包括純合突變和雜合突變,突變類型包括堿基插入和缺失,以堿基缺失為主,占61.5%(表2)。圖4 重組質(zhì)粒CRISPR-Cas9-BSRD1的PCR驗證
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)定向改良水稻稻瘟病抗性[J]. 徐鵬,王宏,涂燃冉,劉群恩,吳瑋勛,傅秀民,曹立勇,沈希宏. 中國水稻科學(xué). 2019(04)
[2]Production of Two Elite Glutinous Rice Varieties by Editing Wx Gene[J]. FEI Yunyan,YANG Jie,WANG Fangquan,FAN Fangjun,LI Wenqi,WANG Jun,XU Yang,ZHU Jinyan,ZHONG Weigong. Rice Science. 2019(02)
[3]水稻稻瘟病抗性基因Bsr-d1功能標(biāo)記的開發(fā)和利用[J]. 王軍,趙婕宇,許揚,范方軍,朱金燕,李文奇,王芳權(quán),費云燕,仲維功,楊杰. 作物學(xué)報. 2018(11)
[4]水稻“抗癌”新因子bsr-d1[J]. 李偉滔,朱紫薇,尹俊杰,賀閩,王靜,朱孝波,陳學(xué)偉. 自然雜志. 2018(02)
[5]基于CRISPR/Cas9技術(shù)的水稻pi21基因編輯材料的創(chuàng)制及稻瘟病抗性鑒定[J]. 楊海河,畢冬玲,張玉,鄒小維,高曉慶,袁正杰,曲海艷,何海燕,瞿紹洪. 分子植物育種. 2017(11)
[6]利用CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)獲得水稻OsYUCCA1基因突變體[J]. 何先暢,黃國強,王道洋,常淑偉,張大兵. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(11)
[7]利用CRISPR/Cas9技術(shù)敲除水稻Pi21基因的效率分析[J]. 王芳權(quán),范方軍,李文奇,朱金燕,王軍,仲維功,楊杰. 中國水稻科學(xué). 2016(05)
[8]基于CRISPR/Cas9技術(shù)的水稻千粒重基因tgw6突變體的創(chuàng)建[J]. 王加峰,鄭才敏,劉維,羅文龍,王慧,陳志強,郭濤. 作物學(xué)報. 2016(08)
[9]CRISPR/Cas系統(tǒng)在植物基因組編輯中的應(yīng)用[J]. 瞿禮嘉,郭冬姝,張金喆,秦跟基. 生命科學(xué). 2015(01)
本文編號:3591483
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(16)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
Bsr-d1基因結(jié)構(gòu)及g RNA靶點位置
將攜帶Bsr-d1基因2個靶標(biāo)的表達(dá)載體CRIS-PR-Cas9-BSRD1通過農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化恢復(fù)系秈稻‘GH9-98’后,共獲得22株T0代轉(zhuǎn)基因株系。用抗潮霉素基因引物Hyg-F/Hyg-R檢測以篩選轉(zhuǎn)基因陽性植株。結(jié)果發(fā)現(xiàn)22株T0代轉(zhuǎn)基因植株都帶有抗性基因,陽性率為100%。為了分析‘GH998’中Bsr-d1基因的突變情況,用引物BSRD1-F/BSRD1-R擴增基因,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序分析。測序結(jié)果表明,有13株陽性轉(zhuǎn)基因苗在靶標(biāo)2處發(fā)生了突變,突變率為59.1%,其中有4株為純合突變,占30.8%,9株為雜合突變,占69.2%;而在靶標(biāo)1處沒有檢測到有突變的植株。靶標(biāo)2處的突變基因型包括純合突變和雜合突變,突變類型包括堿基插入和缺失,以堿基缺失為主,占61.5%(表2)。
為了分析‘GH998’中Bsr-d1基因的突變情況,用引物BSRD1-F/BSRD1-R擴增基因,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序分析。測序結(jié)果表明,有13株陽性轉(zhuǎn)基因苗在靶標(biāo)2處發(fā)生了突變,突變率為59.1%,其中有4株為純合突變,占30.8%,9株為雜合突變,占69.2%;而在靶標(biāo)1處沒有檢測到有突變的植株。靶標(biāo)2處的突變基因型包括純合突變和雜合突變,突變類型包括堿基插入和缺失,以堿基缺失為主,占61.5%(表2)。圖4 重組質(zhì)粒CRISPR-Cas9-BSRD1的PCR驗證
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)定向改良水稻稻瘟病抗性[J]. 徐鵬,王宏,涂燃冉,劉群恩,吳瑋勛,傅秀民,曹立勇,沈希宏. 中國水稻科學(xué). 2019(04)
[2]Production of Two Elite Glutinous Rice Varieties by Editing Wx Gene[J]. FEI Yunyan,YANG Jie,WANG Fangquan,FAN Fangjun,LI Wenqi,WANG Jun,XU Yang,ZHU Jinyan,ZHONG Weigong. Rice Science. 2019(02)
[3]水稻稻瘟病抗性基因Bsr-d1功能標(biāo)記的開發(fā)和利用[J]. 王軍,趙婕宇,許揚,范方軍,朱金燕,李文奇,王芳權(quán),費云燕,仲維功,楊杰. 作物學(xué)報. 2018(11)
[4]水稻“抗癌”新因子bsr-d1[J]. 李偉滔,朱紫薇,尹俊杰,賀閩,王靜,朱孝波,陳學(xué)偉. 自然雜志. 2018(02)
[5]基于CRISPR/Cas9技術(shù)的水稻pi21基因編輯材料的創(chuàng)制及稻瘟病抗性鑒定[J]. 楊海河,畢冬玲,張玉,鄒小維,高曉慶,袁正杰,曲海艷,何海燕,瞿紹洪. 分子植物育種. 2017(11)
[6]利用CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)獲得水稻OsYUCCA1基因突變體[J]. 何先暢,黃國強,王道洋,常淑偉,張大兵. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(11)
[7]利用CRISPR/Cas9技術(shù)敲除水稻Pi21基因的效率分析[J]. 王芳權(quán),范方軍,李文奇,朱金燕,王軍,仲維功,楊杰. 中國水稻科學(xué). 2016(05)
[8]基于CRISPR/Cas9技術(shù)的水稻千粒重基因tgw6突變體的創(chuàng)建[J]. 王加峰,鄭才敏,劉維,羅文龍,王慧,陳志強,郭濤. 作物學(xué)報. 2016(08)
[9]CRISPR/Cas系統(tǒng)在植物基因組編輯中的應(yīng)用[J]. 瞿禮嘉,郭冬姝,張金喆,秦跟基. 生命科學(xué). 2015(01)
本文編號:3591483
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