葡萄（Vitis vinifera）是我國(guó),也是世界上廣泛栽培的具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的果樹。葡萄在生長(zhǎng)過程中容易遭受各種非生物脅迫,如炎熱、干旱、寒冷、高鹽等。此外,葡萄果實(shí)成熟過程受到諸多因素調(diào)控,并且其成熟過程對(duì)葡萄及葡萄酒品質(zhì)至關(guān)重要。泛素化是真核生物中一種普遍存在的蛋白質(zhì)修飾途徑。泛素結(jié)合酶E2是泛素化過程中的一個(gè)重要參與者,其典型特征是含有UBC結(jié)構(gòu)域。本研究在葡萄全基因組（PN40024）測(cè)序完成的基礎(chǔ)上,對(duì)泛素結(jié)合酶E2基因家族進(jìn)行了全基因組鑒定與功能結(jié)構(gòu)分析,并對(duì)其在葡萄果實(shí)成熟過程中及非生物脅迫下的表達(dá)模式進(jìn)行了探究,以期為研究泛素結(jié)合酶E2在葡萄生長(zhǎng)發(fā)育中的功能奠定基礎(chǔ),主要研究成果如下:1、通過BLAST比對(duì),結(jié)合HMM模型檢索及保守結(jié)構(gòu)域鑒定,在葡萄的全基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定出43個(gè)泛素結(jié)合酶E2基因家族成員。將葡萄與番茄中的E2基因家族成員構(gòu)建進(jìn)化樹,依據(jù)進(jìn)化樹將葡萄中的泛素結(jié)合酶E2分為5個(gè)亞家族,并根據(jù)進(jìn)化樹上的位置關(guān)系將葡萄E2家族命名為VvUBC1a–VvUBC52。2、根據(jù)UBC結(jié)構(gòu)域之外有無蛋白延長(zhǎng),將VvUBCs分為四類:Class I只包含UBC結(jié)構(gòu)域... 

【文章來源】：中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院武漢植物園)湖北省

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

乙烯的生物合成及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)圖解（Gapperetal.,2013）

第 2 章 葡萄泛素結(jié)合酶 E2 基因家族鑒定及生物信息學(xué)分析交到 Pfam 和 NCBI-CDD 數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證，最終 43 個(gè)基因符合 HMUBC 結(jié)構(gòu)域，被確定為葡萄泛素結(jié)合酶 E2 基因家族成員。這的 41 條（Kraft et al., 2005）、水稻的 37 條（Zhiguo et al., 20152 條（Wang et al., 2014）、玉米的 75 條（Dengwei et al., 2015）到基因 ID、每個(gè)基因在染色體上的位置、蛋白及基因序列長(zhǎng)度 1.1。萄泛素結(jié)合酶 E2 基因的進(jìn)化樹構(gòu)建與命名

不同的亞家族之間用不同的顏色區(qū)分。不同顏色的矩形代表了一個(gè) motif 的圖例見附圖 2。Figure 2.3 The conserved motifs analysis of 43 VvUBC members. group was indicated by different color. Different motif was represented by b

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3586870