葡萄（Vitis vinifera）是我國,也是世界上廣泛栽培的具有重要經(jīng)濟價值的果樹。葡萄在生長過程中容易遭受各種非生物脅迫,如炎熱、干旱、寒冷、高鹽等。此外,葡萄果實成熟過程受到諸多因素調(diào)控,并且其成熟過程對葡萄及葡萄酒品質至關重要。泛素化是真核生物中一種普遍存在的蛋白質修飾途徑。泛素結合酶E2是泛素化過程中的一個重要參與者,其典型特征是含有UBC結構域。本研究在葡萄全基因組（PN40024）測序完成的基礎上,對泛素結合酶E2基因家族進行了全基因組鑒定與功能結構分析,并對其在葡萄果實成熟過程中及非生物脅迫下的表達模式進行了探究,以期為研究泛素結合酶E2在葡萄生長發(fā)育中的功能奠定基礎,主要研究成果如下:1、通過BLAST比對,結合HMM模型檢索及保守結構域鑒定,在葡萄的全基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定出43個泛素結合酶E2基因家族成員。將葡萄與番茄中的E2基因家族成員構建進化樹,依據(jù)進化樹將葡萄中的泛素結合酶E2分為5個亞家族,并根據(jù)進化樹上的位置關系將葡萄E2家族命名為VvUBC1a–VvUBC52。2、根據(jù)UBC結構域之外有無蛋白延長,將VvUBCs分為四類:Class I只包含UBC結構域... 

【文章來源】：中國科學院大學(中國科學院武漢植物園)湖北省

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

乙烯的生物合成及信號轉導圖解（Gapperetal.,2013）

第 2 章 葡萄泛素結合酶 E2 基因家族鑒定及生物信息學分析交到 Pfam 和 NCBI-CDD 數(shù)據(jù)庫驗證，最終 43 個基因符合 HMUBC 結構域，被確定為葡萄泛素結合酶 E2 基因家族成員。這的 41 條（Kraft et al., 2005）、水稻的 37 條（Zhiguo et al., 20152 條（Wang et al., 2014）、玉米的 75 條（Dengwei et al., 2015）到基因 ID、每個基因在染色體上的位置、蛋白及基因序列長度 1.1。萄泛素結合酶 E2 基因的進化樹構建與命名

不同的亞家族之間用不同的顏色區(qū)分。不同顏色的矩形代表了一個 motif 的圖例見附圖 2。Figure 2.3 The conserved motifs analysis of 43 VvUBC members. group was indicated by different color. Different motif was represented by b

【參考文獻】：
期刊論文
[1]園藝作物基因組測序研究進展[J]. 倪曉鵬,高志紅.  江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2016(02)
[2]生長素合成途徑的研究進展[J]. 王家利,劉冬成,郭小麗,張愛民.  植物學報. 2012(03)



本文編號：3586870