驅(qū)動(dòng)蛋白家族成員2C(KIF2C)基因?qū)Ω伟┘?xì)胞株SMMC-7721生物學(xué)行為影響的研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-12 21:29
第一部分目的:探討KIF2C基因?qū)υl(fā)性肝細(xì)胞癌患者預(yù)后的影響方法:首先我們通過(guò)從高通量表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)Gene Expression Omnibus(GEO)中根據(jù)入組標(biāo)準(zhǔn)(1)原發(fā)性肝細(xì)胞癌,(2)擁有完整的生存資料,(3)擁有完整的基因表達(dá)量數(shù)據(jù)。篩選得到GSE14520數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集更新至2017年4月5日,并于2017年12月15日通過(guò)驗(yàn)證。下載數(shù)據(jù)并從中獲得原發(fā)性肝細(xì)胞癌的基因表達(dá)數(shù)據(jù)集,從中篩選得到KIF2C的基因表達(dá)量,進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,將一般臨床資料進(jìn)行單因素分析,并將有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的指標(biāo)(P<0.05)納入多因素分析。同時(shí)使用Kaplan-Meier方法繪制生存分析曲線圖,探討KIF2C的表達(dá)量與乙肝相關(guān)性原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者的預(yù)后關(guān)系。而后我們通過(guò)The Cancer Genome Atlas(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者的臨床信息和基因表達(dá)譜,下載數(shù)據(jù)并根據(jù)相同的入組標(biāo)準(zhǔn)篩選得到370例原發(fā)性肝癌患者的資料與基因表達(dá)譜,進(jìn)行單因素并將有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的指標(biāo)(P<0.05)納入多因素分析。同時(shí)使用Kaplan-Meier方法繪制生存分析曲線圖。結(jié)果:GEO數(shù)...
【文章來(lái)源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:100 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
GEO數(shù)據(jù)庫(kù)GSE14520數(shù)據(jù)集肝細(xì)胞癌患者生存曲線圖
圖 1-2 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)肝細(xì)胞癌患者生存曲線Figure1-2 TCGA database for patients with hepatocellular carcinoma論目前己經(jīng)證實(shí) HCC 的發(fā)生與多種癌基因與抑癌基因異常表達(dá)有關(guān)實(shí)質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)化為惡性細(xì)胞的過(guò)程中,涉及到多種不同基因的改變種由多基因調(diào)控的多階段的生物學(xué)行為,盡管在醫(yī)學(xué)技術(shù)的快速HCC 的治療和診斷都有著不斷的突破,但是肝癌的易轉(zhuǎn)移,易復(fù)使得患者的生存率仍然不理想。因此,尋找特異性的 HCC 有效的成為了我們急需完成的目標(biāo)。目前,已有大量的關(guān)于 HCC 的基因方面的研究,例如 Rao 等的綜述通過(guò)回顧 HCC 相關(guān)的研究,總結(jié)
)使用 GraphPad Prism 7.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)圖形制作,采軟件進(jìn)行蛋白印跡法條帶的光密度分析。熒光定量 PCR 技術(shù)測(cè)量肝癌細(xì)胞株中 KIF2C 的表達(dá)量分實(shí)驗(yàn)我們檢測(cè)了常見(jiàn)人肝癌細(xì)胞株 MHCC-97H、SM4、BEL-7403、SK-Hep-1、Hep-G2、QGY-7703,及正常IF2C 基因 mRNA 的相對(duì)表達(dá)量,其結(jié)果如圖 2-1 所示F2C 相對(duì)表達(dá)量居中且細(xì)胞狀態(tài)良好的的肝癌細(xì)胞株 細(xì)胞來(lái)進(jìn)行 KIF2C 基因沉默過(guò)表達(dá)對(duì)于肝癌細(xì)胞株生。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]使用GEO數(shù)據(jù)集分析驅(qū)動(dòng)蛋白KIF2C在膀胱癌中的表達(dá)及臨床意義[J]. 馮雨嘉,蔣佳志,晏鑫,郭梓鑫,李勝,孟詳喻,陳松. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2019(01)
[2]結(jié)腸癌驅(qū)動(dòng)蛋白超家族kif14表達(dá)及其與預(yù)后相關(guān)性研究[J]. 王立,謝鵬,周建平. 臨床軍醫(yī)雜志. 2018(10)
[3]結(jié)腸癌細(xì)胞裂解物致敏的樹(shù)突狀細(xì)胞-細(xì)胞因子誘導(dǎo)殺傷細(xì)胞抗自體結(jié)腸癌細(xì)胞效應(yīng)研究[J]. 朱克祥,王錦明,袁得峰,張正聰,呂鵬飛,白小平,李汛,潘藤. 臨床軍醫(yī)雜志. 2018(08)
[4]肝細(xì)胞癌中KIF2C的表達(dá)水平及臨床意義[J]. 趙娟,谷雪,劉建生. 海南醫(yī)學(xué). 2018(11)
[5]未分化甲狀腺癌相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析[J]. 趙靜,張家明,杜雅瑩,李興睿. 山東醫(yī)藥. 2018(09)
[6]氟尿嘧啶聯(lián)合姜黃素納米劑型抑制肝癌細(xì)胞的研究[J]. 董偉,劉福晨,倪俊聲,李鵬鵬,郭興剛,劉輝. 中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2016(09)
[7]Mechanisms of hepatocellular carcinoma and challenges and opportunities for molecular targeted therapy[J]. Chuan Chen,Ge Wang. World Journal of Hepatology. 2015(15)
本文編號(hào):3585477
【文章來(lái)源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:100 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
GEO數(shù)據(jù)庫(kù)GSE14520數(shù)據(jù)集肝細(xì)胞癌患者生存曲線圖
圖 1-2 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)肝細(xì)胞癌患者生存曲線Figure1-2 TCGA database for patients with hepatocellular carcinoma論目前己經(jīng)證實(shí) HCC 的發(fā)生與多種癌基因與抑癌基因異常表達(dá)有關(guān)實(shí)質(zhì)細(xì)胞轉(zhuǎn)化為惡性細(xì)胞的過(guò)程中,涉及到多種不同基因的改變種由多基因調(diào)控的多階段的生物學(xué)行為,盡管在醫(yī)學(xué)技術(shù)的快速HCC 的治療和診斷都有著不斷的突破,但是肝癌的易轉(zhuǎn)移,易復(fù)使得患者的生存率仍然不理想。因此,尋找特異性的 HCC 有效的成為了我們急需完成的目標(biāo)。目前,已有大量的關(guān)于 HCC 的基因方面的研究,例如 Rao 等的綜述通過(guò)回顧 HCC 相關(guān)的研究,總結(jié)
)使用 GraphPad Prism 7.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)圖形制作,采軟件進(jìn)行蛋白印跡法條帶的光密度分析。熒光定量 PCR 技術(shù)測(cè)量肝癌細(xì)胞株中 KIF2C 的表達(dá)量分實(shí)驗(yàn)我們檢測(cè)了常見(jiàn)人肝癌細(xì)胞株 MHCC-97H、SM4、BEL-7403、SK-Hep-1、Hep-G2、QGY-7703,及正常IF2C 基因 mRNA 的相對(duì)表達(dá)量,其結(jié)果如圖 2-1 所示F2C 相對(duì)表達(dá)量居中且細(xì)胞狀態(tài)良好的的肝癌細(xì)胞株 細(xì)胞來(lái)進(jìn)行 KIF2C 基因沉默過(guò)表達(dá)對(duì)于肝癌細(xì)胞株生。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]使用GEO數(shù)據(jù)集分析驅(qū)動(dòng)蛋白KIF2C在膀胱癌中的表達(dá)及臨床意義[J]. 馮雨嘉,蔣佳志,晏鑫,郭梓鑫,李勝,孟詳喻,陳松. 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2019(01)
[2]結(jié)腸癌驅(qū)動(dòng)蛋白超家族kif14表達(dá)及其與預(yù)后相關(guān)性研究[J]. 王立,謝鵬,周建平. 臨床軍醫(yī)雜志. 2018(10)
[3]結(jié)腸癌細(xì)胞裂解物致敏的樹(shù)突狀細(xì)胞-細(xì)胞因子誘導(dǎo)殺傷細(xì)胞抗自體結(jié)腸癌細(xì)胞效應(yīng)研究[J]. 朱克祥,王錦明,袁得峰,張正聰,呂鵬飛,白小平,李汛,潘藤. 臨床軍醫(yī)雜志. 2018(08)
[4]肝細(xì)胞癌中KIF2C的表達(dá)水平及臨床意義[J]. 趙娟,谷雪,劉建生. 海南醫(yī)學(xué). 2018(11)
[5]未分化甲狀腺癌相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析[J]. 趙靜,張家明,杜雅瑩,李興睿. 山東醫(yī)藥. 2018(09)
[6]氟尿嘧啶聯(lián)合姜黃素納米劑型抑制肝癌細(xì)胞的研究[J]. 董偉,劉福晨,倪俊聲,李鵬鵬,郭興剛,劉輝. 中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2016(09)
[7]Mechanisms of hepatocellular carcinoma and challenges and opportunities for molecular targeted therapy[J]. Chuan Chen,Ge Wang. World Journal of Hepatology. 2015(15)
本文編號(hào):3585477
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