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細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)3-羥基;-CoA脫氫酶基因的克隆及在其不同階段的差異表達(dá)和生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-01-12 03:55
  目的研究細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)3-羥基;-CoA脫氫酶分子特性及其在細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)不同發(fā)育階段的表達(dá)差異。方法通過(guò)分析細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)原頭蚴高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文庫(kù)對(duì)Unigene進(jìn)行KEGG通路分析,篩選出一個(gè)脂肪酸代謝酶通路及該通路的一個(gè)主要調(diào)控基因3-羥基酰基-CoA脫氫酶基因。PCR擴(kuò)增3-羥基;-CoA脫氫酶基因,分析其核苷酸序列及其編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能;通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析蟲(chóng)體的原頭蚴、成蟲(chóng)發(fā)育階段的mRNA的轉(zhuǎn)錄情況。結(jié)果細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)3-羥基;-CoA脫氫酶基因具有完整的開(kāi)放閱讀框,cDNA全長(zhǎng)為822bp,編碼274個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)預(yù)測(cè)3-羥基;-CoA脫氫酶蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量及等電點(diǎn)分別為32.98×105和8.87。該蛋白無(wú)跨膜螺旋區(qū),具有親水性,且具有多個(gè)潛在的優(yōu)勢(shì)抗原表位。氨基酸序列多重比對(duì)分析顯示其與多房棘球絳蟲(chóng)親緣關(guān)系較近。實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)對(duì)該基因在原頭蚴和成蟲(chóng)期均有表達(dá),以成蟲(chóng)階段表達(dá)量更高。結(jié)論細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)3-羥基;-CoA脫氫酶基因在原頭蚴和成蟲(chóng)期高表達(dá),其編碼蛋白具有潛在的優(yōu)勢(shì)抗原表位該基因可作為細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)終末宿主抗原候選基因。 

【文章來(lái)源】:中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2020,15(11)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)

【部分圖文】:

細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)3-羥基;-CoA脫氫酶基因的克隆及在其不同階段的差異表達(dá)和生物信息學(xué)分析


3-羥基;-CoA脫氫酶CDNA PCR擴(kuò)增

酰基,脫氫酶,羥基,結(jié)構(gòu)域


利用NCBI的Conserved Domain和在線網(wǎng)站(ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)預(yù)測(cè)3-羥基;-CoA脫氫酶蛋白含有保守結(jié)構(gòu)域,具有完整的開(kāi)放閱讀框,屬于腺嘌呤黃素家族(圖2)。圖3 3-羥基;-CoA脫氫酶蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

;,脫氫酶,羥基,結(jié)構(gòu)域


3-羥基;-CoA脫氫酶蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]線蟲(chóng)脂肪酸代謝與性別決定研究[D]. 唐鴻云.浙江大學(xué) 2014

碩士論文
[1]地塞米松對(duì)弓形蟲(chóng)RH株增殖及宿主與弓形蟲(chóng)多不飽和脂肪酸代謝的影響[D]. 張爽.重慶醫(yī)科大學(xué) 2017
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本文編號(hào):3584051

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