發(fā)布時(shí)間：2022-01-11 09:11

　　森林草莓（Fragaria vesca）,是繼葡萄、蘋(píng)果后第三類(lèi)完成基因組測(cè)序的果樹(shù)。其基因組（2 n=14,240 MB）較小,生長(zhǎng)周期短,植株體型較小,栽培管理相對(duì)容易,因而替代八倍體栽培草莓成為草莓研究常用的模式植物。Zinc finger Homeodomain（ZF-HD）轉(zhuǎn)錄因子是植物中所特有的一類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子,由zinc finger（ZF）結(jié)構(gòu)域以及homeodomain（HD）結(jié)構(gòu)域組成。其中ZF代表半胱氨酸和/或組氨酸結(jié)合鋅原子形成的具有特定功能的局部多肽結(jié)構(gòu),HD是由長(zhǎng)度為60的氨基酸組成的DNA結(jié)合域。ZF-HD轉(zhuǎn)錄因子在植物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中扮演著重要的角色,例如響應(yīng)逆境脅迫,調(diào)控花的發(fā)育,調(diào)控種子壽命等。目前關(guān)于ZF-HD轉(zhuǎn)錄因子的研究多集中在擬南芥,水稻,番茄等植物中,但是在草莓中并未見(jiàn)過(guò)相關(guān)報(bào)道。因此挖掘草莓中該基因家族的基因,了解該基因的表達(dá)模式及其功能等對(duì)于草莓的生產(chǎn)以及育種來(lái)說(shuō)具有重要意義。本文中以森林草莓Yellow Wonder 5AF（YW）為材料,從森林草莓中分離與鑒定了該基因家族的基因,分析其表達(dá)模式,并進(jìn)行功能驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下:（1）從... 

【文章來(lái)源】：福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁(yè)數(shù)】：69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

植物同源異型盒蛋白超家族中的6個(gè)家族主要結(jié)構(gòu)特點(diǎn)示意圖[42]

森林草莓ZF-HD基因家族的鑒定與功能初步分析15圖2-1森林草莓ZF-HD蛋白保守基序分布Fig.2-1DistributionofconservedmotifofZF-HDproteininFragariavesca2.2.3森林草莓ZF-HD蛋白保守結(jié)構(gòu)域以及進(jìn)化樹(shù)分析從森林草莓基因組數(shù)據(jù)庫(kù)SGR中找出森林草莓ZF-HD家族的10個(gè)基因，通過(guò)序列比對(duì)，保守結(jié)構(gòu)域分析等，發(fā)現(xiàn)該基因家族在森林草莓中存在的10個(gè)基因中有8個(gè)不含內(nèi)含子，且其編碼的蛋白質(zhì)中同時(shí)含有ZF和HD結(jié)構(gòu)域，這八個(gè)基因分別是FvZF-HD1、FvZF-HD2、FvZF-HD4、FvZF-HD6、FvZF-HD7、FvZF-HD8、FvZF-HD9和FvZF-HD10。此外FvZF-HD3，F(xiàn)vZF-HD5基因編碼的蛋白質(zhì)中只含有ZF結(jié)構(gòu)域，其符合MIF基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，且結(jié)合系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明其與擬南芥ZF-HD基因家族中的MIF亞族的基因歸為一類(lèi)，說(shuō)明其為MIF基因。編號(hào)為gene18081的基因既不存在ZF結(jié)構(gòu)域也不存在HD結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)如圖2-3所示，分析表明FvZF-HD3和FvZF-HD5基因與擬南芥ZF-HD基因家族中的MIF亞族歸為一類(lèi)，F(xiàn)vZF-HD1基因單獨(dú)聚類(lèi)，其它7個(gè)基因分別可以歸類(lèi)為ZHDI，ZHDII，ZHDIII，ZHDIV等亞族中。

第二章森林草莓ZF-HD基因家族的鑒定與分析16圖2-2森林草莓和擬南芥ZF-HD家族保守結(jié)構(gòu)域多序列比對(duì)A.ZF結(jié)構(gòu)域的序列比對(duì);B.HD結(jié)構(gòu)域的序列比對(duì)Fig.2-2ThemultiplesequencesalignmentofconserveddomainsofZF-HDfamilyinFragariavescaandArabidopsisA.ThemultiplesequencesalignmentofZFdomain.B.ThemultiplesequencesalignmentofHDdomain圖2-3擬南芥和森林草莓ZF-HD蛋白的進(jìn)化樹(shù)A.擬南芥和森林草莓ZF-HD蛋白全長(zhǎng)進(jìn)化樹(shù);B.森林草莓ZF-HD蛋白HD結(jié)構(gòu)域進(jìn)化樹(shù);C.森林草莓ZF-HD蛋白ZF結(jié)構(gòu)域進(jìn)化樹(shù)Fig.2-3ThephylogenetictreesofZF-HDproteinfromArabidopsisandFragariavesca.A.Thephylogenetictreebyuseofthefull-lengthsequencesofArabidopsisandFragariaAB

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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碩士論文
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[3]草莓離體再生體系的建立及遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 劉振.河北大學(xué) 2017
[4]逆境條件下小麥種子活力與主要相關(guān)酶活性及其基因表達(dá)的關(guān)系[D]. 陳蕾太.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]WOX同源異型盒基因在水稻生長(zhǎng)發(fā)育中的功能鑒定和分析[D]. 黃玉蘭.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015



本文編號(hào)：3582520