森林草莓（Fragaria vesca）,是繼葡萄、蘋果后第三類完成基因組測序的果樹。其基因組（2 n=14,240 MB）較小,生長周期短,植株體型較小,栽培管理相對容易,因而替代八倍體栽培草莓成為草莓研究常用的模式植物。Zinc finger Homeodomain（ZF-HD）轉錄因子是植物中所特有的一類轉錄因子,由zinc finger（ZF）結構域以及homeodomain（HD）結構域組成。其中ZF代表半胱氨酸和/或組氨酸結合鋅原子形成的具有特定功能的局部多肽結構,HD是由長度為60的氨基酸組成的DNA結合域。ZF-HD轉錄因子在植物的生長發(fā)育過程中扮演著重要的角色,例如響應逆境脅迫,調控花的發(fā)育,調控種子壽命等。目前關于ZF-HD轉錄因子的研究多集中在擬南芥,水稻,番茄等植物中,但是在草莓中并未見過相關報道。因此挖掘草莓中該基因家族的基因,了解該基因的表達模式及其功能等對于草莓的生產以及育種來說具有重要意義。本文中以森林草莓Yellow Wonder 5AF（YW）為材料,從森林草莓中分離與鑒定了該基因家族的基因,分析其表達模式,并進行功能驗證。主要研究結果如下:（1）從... 

【文章來源】：福建農林大學福建省

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

植物同源異型盒蛋白超家族中的6個家族主要結構特點示意圖[42]

森林草莓ZF-HD基因家族的鑒定與功能初步分析15圖2-1森林草莓ZF-HD蛋白保守基序分布Fig.2-1DistributionofconservedmotifofZF-HDproteininFragariavesca2.2.3森林草莓ZF-HD蛋白保守結構域以及進化樹分析從森林草莓基因組數(shù)據(jù)庫SGR中找出森林草莓ZF-HD家族的10個基因，通過序列比對，保守結構域分析等，發(fā)現(xiàn)該基因家族在森林草莓中存在的10個基因中有8個不含內含子，且其編碼的蛋白質中同時含有ZF和HD結構域，這八個基因分別是FvZF-HD1、FvZF-HD2、FvZF-HD4、FvZF-HD6、FvZF-HD7、FvZF-HD8、FvZF-HD9和FvZF-HD10。此外FvZF-HD3，F(xiàn)vZF-HD5基因編碼的蛋白質中只含有ZF結構域，其符合MIF基因的結構特點，且結合系統(tǒng)進化樹分析表明其與擬南芥ZF-HD基因家族中的MIF亞族的基因歸為一類，說明其為MIF基因。編號為gene18081的基因既不存在ZF結構域也不存在HD結構域。系統(tǒng)發(fā)育進化樹如圖2-3所示，分析表明FvZF-HD3和FvZF-HD5基因與擬南芥ZF-HD基因家族中的MIF亞族歸為一類，F(xiàn)vZF-HD1基因單獨聚類，其它7個基因分別可以歸類為ZHDI，ZHDII，ZHDIII，ZHDIV等亞族中。

第二章森林草莓ZF-HD基因家族的鑒定與分析16圖2-2森林草莓和擬南芥ZF-HD家族保守結構域多序列比對A.ZF結構域的序列比對;B.HD結構域的序列比對Fig.2-2ThemultiplesequencesalignmentofconserveddomainsofZF-HDfamilyinFragariavescaandArabidopsisA.ThemultiplesequencesalignmentofZFdomain.B.ThemultiplesequencesalignmentofHDdomain圖2-3擬南芥和森林草莓ZF-HD蛋白的進化樹A.擬南芥和森林草莓ZF-HD蛋白全長進化樹;B.森林草莓ZF-HD蛋白HD結構域進化樹;C.森林草莓ZF-HD蛋白ZF結構域進化樹Fig.2-3ThephylogenetictreesofZF-HDproteinfromArabidopsisandFragariavesca.A.Thephylogenetictreebyuseofthefull-lengthsequencesofArabidopsisandFragariaAB

【參考文獻】：
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本文編號：3582520