基因芯片應(yīng)用效果評(píng)價(jià)及耐藥基因突變與治療結(jié)局關(guān)聯(lián)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-05 15:28
研究背景與目的中國(guó)是全球30個(gè)結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國(guó)家之一,據(jù)WHO最新報(bào)告結(jié)果顯示結(jié)核病估算新發(fā)病人數(shù)為88.9萬(wàn),發(fā)病人數(shù)位于高負(fù)擔(dān)國(guó)家的第二位。2017年,全球有近60萬(wàn)利福平耐藥/耐多藥患者(RR/MDR-TB),其中MDR-TB 45.7萬(wàn)例,MDR-TB已成為控制結(jié)核病流行的主要難點(diǎn)之一。根據(jù)WHO公布數(shù)據(jù)2017年中國(guó)估算新發(fā)MDR/RR-TB患者7.3萬(wàn)人,僅次于印度,位居全球第二,約占到全球估算總數(shù)的13.1%。但是我國(guó)的RR/MDR-TB患者登記數(shù)只有近1萬(wàn)人,僅占估算數(shù)的17%,在金磚五國(guó)中排末位,中國(guó)極低的MDR-TB發(fā)現(xiàn)率已成為MDR-TB疫情居高不下的關(guān)鍵因素。傳統(tǒng)藥敏耗時(shí)較長(zhǎng),靈敏度和時(shí)效性較差,嚴(yán)重影響了 MDR-TB的早期發(fā)現(xiàn)。為了提高耐藥診斷速度,世界衛(wèi)生組織2007-2015年陸續(xù)推薦了多種基因檢測(cè)技術(shù)。基因芯片技術(shù)是基于多重PCR并結(jié)合反向雜交的耐多藥基因檢測(cè)試劑盒,該技術(shù)能根據(jù)檢測(cè)位點(diǎn)的突變情況快速檢測(cè)出利福平與異煙肼耐藥結(jié)果,并判斷結(jié)核分枝桿菌耐多藥情況,既往研究顯示該方法的靈敏度和特異度都很高。根據(jù)國(guó)家結(jié)核病“十三五”規(guī)劃要求,全國(guó)將逐步推廣MDR...
【文章來源】:東南大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1?rpoB基因片段的PCR擴(kuò)增部分電泳圖??條帶從下分別為?1500、1000、900、800、700、600、500、400、300、200、??
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?東南大領(lǐng)士學(xué)位論文???(2)異煙肼耐藥基因測(cè)序結(jié)果??異煙肼的耐藥基因譜廣泛,本次僅對(duì)異煙肼的耐藥基因katG以及InhA啟動(dòng)??子區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,還可對(duì)異煙肼的其他耐藥基因,如oxyR、oxyR-ahpC基因間??區(qū)等進(jìn)行篩查PI??異煙肼耐藥基囡katG突變50例,突變率70.4%?(50/71)?a沒有發(fā)生任意位??點(diǎn)的聯(lián)合突變,也均為單堿基突變《突變率最高的位點(diǎn)是katG315,在該位點(diǎn)突??變47例(94%,47/50),最重要的檢測(cè)耐多藥患者的高頻位點(diǎn)(見圖2-3、表6)。??異煙肼耐藥基因InhA突變8例,突變形式主要為ACGInhA-15ATG,其中有3??例聯(lián)合katG315突變。katG與InhA共檢測(cè)出耐異煙肼患者55例(77.46%,55/71?),??聯(lián)合rpoB基國(guó)共檢測(cè)出53例耐多藥患者,基囡型檢測(cè)與表型耐藥鑒定在異煙肼??耐藥性方面的一致率達(dá)74.6%?(見圖2-4、表7)。??V?K?jy?j?TS?V?Tl?V?V?V?IS??401?>AACCGGTAAGGACGCGATCACC^^GCATCGAGGTCGTATGGACGAACACCCCGACGAaATGGGACAACAGTTTCCTCGAGATCCTGTAC??87<AACCGGTAAGGACGCGATCACCAgcGGCATCGAGGTCGTATGGACGAACACCCCGACGAAATGGGACAACAGTTTCCTCGAGATCCT???86<AACCGGTAAGGACGCGATCACG?CGGaiTCGAGGTCGTATGGACGAACACCCCGACGAAATGGGACAACAGTTTCCTCGftG
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基因芯片技術(shù)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌利福平和異煙肼耐藥性臨床應(yīng)用評(píng)價(jià)[J]. 許榕青,李丹,林銀霞,黃明翔,陳新朝. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2017(01)
[2]耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因突變特征分析[J]. 孟慶琳,王玉峰,逄宇,趙雁林. 中國(guó)防癆雜志. 2016 (02)
[3]我國(guó)耐多藥結(jié)核病控制策略概述[J]. 徐彩紅,王黎霞,李仁忠,阮云洲,蘇偉,富韻婷,陳明亭. 中國(guó)防癆雜志. 2015 (11)
[4]結(jié)核分枝桿菌對(duì)抗結(jié)核藥物耐受機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 張俊仙,吳雪瓊. 中國(guó)防癆雜志. 2015 (11)
[5]復(fù)治耐多藥肺結(jié)核患者臨床治療效果分析[J]. 陶滿意,張雷,杜鳳華,李玉勤. 安徽醫(yī)學(xué). 2014(03)
[6]基因芯片結(jié)核分枝桿菌耐多藥檢測(cè)在地市級(jí)實(shí)驗(yàn)室的應(yīng)用性評(píng)估[J]. 趙冰,時(shí)金艷,逄宇,夏輝,李強(qiáng),歐喜超,宋媛媛,王玉峰,池俊英,趙雁林. 中國(guó)防癆雜志. 2013(09)
[7]基因芯片檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌異煙肼和利福平耐藥的實(shí)際應(yīng)用效果評(píng)價(jià)[J]. 李衛(wèi)彬,李新旭,張彤群,屈亞虹,馬振亞,李仁忠. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2012(16)
[8]結(jié)核分枝桿菌對(duì)異煙肼和利福平的耐藥水平與其耐藥基因突變的相關(guān)性研究[J]. 李桂蓮,張敬蕊,趙秀芹,楊驁,連璐璐,萬(wàn)康林. 中國(guó)防癆雜志. 2012(06)
[9]基因芯片診斷耐多藥結(jié)核病的臨床多中心研究[J]. 周楊,歐喜超,樂軍,譚耀駒,王勝芬,逄宇,李強(qiáng),姜廣路,趙冰,趙雁林. 中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2011 (09)
[10]結(jié)核分枝桿菌耐藥分子機(jī)制及耐藥基因檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J]. 李國(guó)利. 中國(guó)醫(yī)師雜志. 2002(04)
博士論文
[1]武漢地區(qū)結(jié)核分枝桿菌藥物敏感性及氟喹諾酮耐藥分子機(jī)制研究[D]. 陳軍.華中科技大學(xué) 2011
碩士論文
[1]耐藥結(jié)核快速診斷方法評(píng)價(jià)及治療效果分析[D]. 豐燕.南京醫(yī)科大學(xué) 2014
本文編號(hào):3570599
【文章來源】:東南大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1?rpoB基因片段的PCR擴(kuò)增部分電泳圖??條帶從下分別為?1500、1000、900、800、700、600、500、400、300、200、??
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?東南大領(lǐng)士學(xué)位論文???(2)異煙肼耐藥基因測(cè)序結(jié)果??異煙肼的耐藥基因譜廣泛,本次僅對(duì)異煙肼的耐藥基因katG以及InhA啟動(dòng)??子區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,還可對(duì)異煙肼的其他耐藥基因,如oxyR、oxyR-ahpC基因間??區(qū)等進(jìn)行篩查PI??異煙肼耐藥基囡katG突變50例,突變率70.4%?(50/71)?a沒有發(fā)生任意位??點(diǎn)的聯(lián)合突變,也均為單堿基突變《突變率最高的位點(diǎn)是katG315,在該位點(diǎn)突??變47例(94%,47/50),最重要的檢測(cè)耐多藥患者的高頻位點(diǎn)(見圖2-3、表6)。??異煙肼耐藥基因InhA突變8例,突變形式主要為ACGInhA-15ATG,其中有3??例聯(lián)合katG315突變。katG與InhA共檢測(cè)出耐異煙肼患者55例(77.46%,55/71?),??聯(lián)合rpoB基國(guó)共檢測(cè)出53例耐多藥患者,基囡型檢測(cè)與表型耐藥鑒定在異煙肼??耐藥性方面的一致率達(dá)74.6%?(見圖2-4、表7)。??V?K?jy?j?TS?V?Tl?V?V?V?IS??401?>AACCGGTAAGGACGCGATCACC^^GCATCGAGGTCGTATGGACGAACACCCCGACGAaATGGGACAACAGTTTCCTCGAGATCCTGTAC??87<AACCGGTAAGGACGCGATCACCAgcGGCATCGAGGTCGTATGGACGAACACCCCGACGAAATGGGACAACAGTTTCCTCGAGATCCT???86<AACCGGTAAGGACGCGATCACG?CGGaiTCGAGGTCGTATGGACGAACACCCCGACGAAATGGGACAACAGTTTCCTCGftG
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基因芯片技術(shù)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌利福平和異煙肼耐藥性臨床應(yīng)用評(píng)價(jià)[J]. 許榕青,李丹,林銀霞,黃明翔,陳新朝. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2017(01)
[2]耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因突變特征分析[J]. 孟慶琳,王玉峰,逄宇,趙雁林. 中國(guó)防癆雜志. 2016 (02)
[3]我國(guó)耐多藥結(jié)核病控制策略概述[J]. 徐彩紅,王黎霞,李仁忠,阮云洲,蘇偉,富韻婷,陳明亭. 中國(guó)防癆雜志. 2015 (11)
[4]結(jié)核分枝桿菌對(duì)抗結(jié)核藥物耐受機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 張俊仙,吳雪瓊. 中國(guó)防癆雜志. 2015 (11)
[5]復(fù)治耐多藥肺結(jié)核患者臨床治療效果分析[J]. 陶滿意,張雷,杜鳳華,李玉勤. 安徽醫(yī)學(xué). 2014(03)
[6]基因芯片結(jié)核分枝桿菌耐多藥檢測(cè)在地市級(jí)實(shí)驗(yàn)室的應(yīng)用性評(píng)估[J]. 趙冰,時(shí)金艷,逄宇,夏輝,李強(qiáng),歐喜超,宋媛媛,王玉峰,池俊英,趙雁林. 中國(guó)防癆雜志. 2013(09)
[7]基因芯片檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌異煙肼和利福平耐藥的實(shí)際應(yīng)用效果評(píng)價(jià)[J]. 李衛(wèi)彬,李新旭,張彤群,屈亞虹,馬振亞,李仁忠. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2012(16)
[8]結(jié)核分枝桿菌對(duì)異煙肼和利福平的耐藥水平與其耐藥基因突變的相關(guān)性研究[J]. 李桂蓮,張敬蕊,趙秀芹,楊驁,連璐璐,萬(wàn)康林. 中國(guó)防癆雜志. 2012(06)
[9]基因芯片診斷耐多藥結(jié)核病的臨床多中心研究[J]. 周楊,歐喜超,樂軍,譚耀駒,王勝芬,逄宇,李強(qiáng),姜廣路,趙冰,趙雁林. 中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2011 (09)
[10]結(jié)核分枝桿菌耐藥分子機(jī)制及耐藥基因檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J]. 李國(guó)利. 中國(guó)醫(yī)師雜志. 2002(04)
博士論文
[1]武漢地區(qū)結(jié)核分枝桿菌藥物敏感性及氟喹諾酮耐藥分子機(jī)制研究[D]. 陳軍.華中科技大學(xué) 2011
碩士論文
[1]耐藥結(jié)核快速診斷方法評(píng)價(jià)及治療效果分析[D]. 豐燕.南京醫(yī)科大學(xué) 2014
本文編號(hào):3570599
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