木薯CBL家族基因的克隆與功能分析
發(fā)布時間:2022-01-01 08:23
類似鈣調(diào)磷酸酶B亞基蛋白(Calcineurin B-like proteins,CBLs)是高等植物體內(nèi)主要存在的一類鈣結(jié)合蛋白,它能與絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(CBL-interacting protein kinase,CIPK)互作從而參與到植物的逆境響應(yīng)和生長發(fā)育過程中。木薯是一種耐受非生物脅迫很好的一種材料。目前,人們對擬南芥的CBL基因及CBL-CIPK通路研究甚多,但對木薯CBL基因及其CBL-CIPK通路方面研究知之甚少。本研究從木薯中克隆CBL家族基因,利用生物信息學(xué)分析CBL蛋白的特征,利用熒光定量PCR技術(shù)研究不同脅迫下CBL基因的表達(dá)模式,并對CBL蛋白的功能進行初步研究,主要研究結(jié)果如下:1.以擬南芥的CBL蛋白序列作為query序列,從木薯基因組DNA數(shù)據(jù)庫查找到序列,克隆得到木薯8個CBL基因,根據(jù)其與AtCBLs同源相似性最終分別命名為 MeCBL1、MeCBL2、MeCBL4、MeCBL5、MeCBL6、MeCBL8、MeCBL9、MeCBL10。2.利用ExPASY、CSS-Palm3.0等在線工具,發(fā)現(xiàn)MeCBLs蛋白分子量在24.50~28.74...
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?CBL蛋白結(jié)構(gòu)示意圖(Batistic?et?al.,2008)??Fig.?I?General?composition?of?CBL?protein(Batistic?et?al.,2008)??
圖2擬南芥CBL家族各成員亞細(xì)胞定位模式圖(董連紅等,2015)??Fig.2?Subcellular?localization?pattern?of?Arabidopsis?CBLs??目前,擬南芥CBL家族各成員亞細(xì)胞定位研宄的比較多(圖2)。運用綠色熒光??蛋白(GFP)融合蛋白己經(jīng)發(fā)現(xiàn)具有短的N-末端結(jié)構(gòu)域的CBL蛋白(CBL1、4、5和9)??2??
Fig.3?CIPKs?protein?composition?of?the?general?structure?(Stefan?Weinl?et?al.,2009)??CIPK在其激酶結(jié)構(gòu)域之后具有自抑制結(jié)構(gòu)域(NAF/FISL)?(Hrabaketal.2003)。??如圖3所示,CIPKs也與其他激酶一樣,在活化環(huán)內(nèi)有催化結(jié)構(gòu)域,而它的調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)??域被分成NAF/FISL區(qū)域和蛋白隣酸酶互作區(qū)域(Protein-Phosphatase?interaction,PPI)??(Batisticetal.,2009)。PPI主要負(fù)責(zé)CIPKs與2C型蛋白磷酸酶之間的相互作用。CIPKs??蛋白的自抑制區(qū)域(NAF/FISL),該區(qū)域由24個氨基酸組成,主要結(jié)合CBLs,消除自??身的抑制作用,促使CIPKs與CBLs相互作用(Hrabaketal.,2003),但其序列的可變性??較大,因此也決定了二者之間的特異性互作。NAF具有疏水性,表明CBL蛋白與CIPK??蛋白的互作是靠疏水性作用力實現(xiàn)的(Kim?etal.,2000;?Albrecht?etal.,?2001)。NAF??結(jié)構(gòu)域?qū)Γ茫桑校说鞍椎募っ富钚赃具有抑制作用(Batisticetal.,2004),當(dāng)NAF調(diào)節(jié)??域缺失時
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物CBL基因家族的研究進展[J]. 董連紅,史素娟,S M Nuruzzaman Manik,蘇玉龍,劉朝科,馮祥國,胡曉明,王倩,劉好寶. 核農(nóng)學(xué)報. 2015(05)
[2]植物體內(nèi)鈣信號及其在調(diào)節(jié)干旱脅迫中的作用[J]. 劉小龍,李霞,錢寶云,唐玉婷. 西北植物學(xué)報. 2014(09)
[3]ABA與植物脅迫抗性[J]. 吳耀榮,謝旗. 植物學(xué)通報. 2006(05)
本文編號:3561989
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?CBL蛋白結(jié)構(gòu)示意圖(Batistic?et?al.,2008)??Fig.?I?General?composition?of?CBL?protein(Batistic?et?al.,2008)??
圖2擬南芥CBL家族各成員亞細(xì)胞定位模式圖(董連紅等,2015)??Fig.2?Subcellular?localization?pattern?of?Arabidopsis?CBLs??目前,擬南芥CBL家族各成員亞細(xì)胞定位研宄的比較多(圖2)。運用綠色熒光??蛋白(GFP)融合蛋白己經(jīng)發(fā)現(xiàn)具有短的N-末端結(jié)構(gòu)域的CBL蛋白(CBL1、4、5和9)??2??
Fig.3?CIPKs?protein?composition?of?the?general?structure?(Stefan?Weinl?et?al.,2009)??CIPK在其激酶結(jié)構(gòu)域之后具有自抑制結(jié)構(gòu)域(NAF/FISL)?(Hrabaketal.2003)。??如圖3所示,CIPKs也與其他激酶一樣,在活化環(huán)內(nèi)有催化結(jié)構(gòu)域,而它的調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)??域被分成NAF/FISL區(qū)域和蛋白隣酸酶互作區(qū)域(Protein-Phosphatase?interaction,PPI)??(Batisticetal.,2009)。PPI主要負(fù)責(zé)CIPKs與2C型蛋白磷酸酶之間的相互作用。CIPKs??蛋白的自抑制區(qū)域(NAF/FISL),該區(qū)域由24個氨基酸組成,主要結(jié)合CBLs,消除自??身的抑制作用,促使CIPKs與CBLs相互作用(Hrabaketal.,2003),但其序列的可變性??較大,因此也決定了二者之間的特異性互作。NAF具有疏水性,表明CBL蛋白與CIPK??蛋白的互作是靠疏水性作用力實現(xiàn)的(Kim?etal.,2000;?Albrecht?etal.,?2001)。NAF??結(jié)構(gòu)域?qū)Γ茫桑校说鞍椎募っ富钚赃具有抑制作用(Batisticetal.,2004),當(dāng)NAF調(diào)節(jié)??域缺失時
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物CBL基因家族的研究進展[J]. 董連紅,史素娟,S M Nuruzzaman Manik,蘇玉龍,劉朝科,馮祥國,胡曉明,王倩,劉好寶. 核農(nóng)學(xué)報. 2015(05)
[2]植物體內(nèi)鈣信號及其在調(diào)節(jié)干旱脅迫中的作用[J]. 劉小龍,李霞,錢寶云,唐玉婷. 西北植物學(xué)報. 2014(09)
[3]ABA與植物脅迫抗性[J]. 吳耀榮,謝旗. 植物學(xué)通報. 2006(05)
本文編號:3561989
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