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中國蓮高密度遺傳圖譜的構(gòu)建及花瓣數(shù)控制基因的定位

發(fā)布時間:2021-12-31 17:41
  蓮(Nelumbo nucifera L.),又名荷花、蓮花、芙蕖等,在中國栽培超過七千年。蓮不僅具有食用、藥用和觀賞等價值,而且還是佛教的象征物。在蓮花的育種研究中,雜交育種依然是培育新品種的主要方法,但是雜交育種無法在短時間內(nèi)將蓮花的各種優(yōu)良性狀集中在一起。培育出具有多種優(yōu)良性狀的新品種是蓮花產(chǎn)業(yè)化的關(guān)鍵,F(xiàn)代分子育種可以結(jié)合分子標(biāo)記輔助育種來提高育種效率,構(gòu)建蓮花極端表型的高密度遺傳圖是挖掘高質(zhì)量分子標(biāo)記的有效方法。第二代測序技術(shù)和生物信息學(xué)的發(fā)展使準(zhǔn)確、高效地挖掘SNPs標(biāo)記成為可能,同時也提高了構(gòu)建遺傳圖譜的效率。本研究主要基于全基因組重測序的方法來構(gòu)建遺傳連鎖圖。為了定位蓮花花瓣數(shù)的調(diào)控基因,本研究以中國蓮多瓣品種“金秋”為父本,中國蓮少瓣品種“白花建蓮”為母本,構(gòu)建了121株花瓣數(shù)量性狀分離良好的F2代群體。利用單核苷酸多態(tài)性分子標(biāo)記構(gòu)建了蓮花的高密度遺傳圖譜,定位到了一些與花瓣數(shù)性狀相關(guān)的候選基因。主要結(jié)果如下:(1)本研究對121個蓮花樣本進行全基因組重測序,得到了704Gb的原始數(shù)據(jù),經(jīng)過篩選而得到636Gb的過濾數(shù)據(jù)。經(jīng)過變異檢測和遺傳作圖。最終構(gòu)建了一個包含19... 

【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】:86 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

中國蓮高密度遺傳圖譜的構(gòu)建及花瓣數(shù)控制基因的定位


基于全基因組重測序的區(qū)間標(biāo)記分型技術(shù)流程

建蓮,花瓣,品種


2.1 材料與實驗方法2.1.1 實驗材料本研究通過觀察蓮花品種花瓣數(shù)量選取中國蓮多瓣品種“金秋”為父本,中國蓮少瓣品種“白花建蓮”為母本雜交。 “金秋”源自 2003 年引自的南京藝蓮苑,中小株型,花瓣數(shù)為 124 瓣左右,為花蓮,只有極少數(shù)雄蕊,雌蕊大都瓣化,雌蕊變成的花瓣多直立成一束,花開繁盛,花色淡雅,是觀賞類的品種!鞍谆ńㄉ彙痹醋 1984 年中科院武漢植物研究所(現(xiàn)武漢植物園)的品種,為子蓮、花蓮兼用品種,大株型,花瓣數(shù)為 16 瓣左右,花托較大,結(jié)實率高。最終在得到 F2 群體中選取 121 株性狀差異較大的個體作為群體樣本來進行后續(xù)研究。兩親本花的形態(tài)如圖 2-1。

分布情況,花瓣,蓮花,群體


.4 結(jié)果.4.1 蓮花花瓣數(shù)統(tǒng)計結(jié)果本研究使用中國蓮“金秋”作為父本,中國蓮“白花建蓮”作為母本雜交得 F1,F(xiàn)1 自交得到 F2,選取 121 株花瓣性狀分離良好的 F2 代樣本作為材,由于親本白花建蓮和金秋的花瓣數(shù)差異較大,在 F2 代中,統(tǒng)計每株蓮上一定數(shù)量的花的花瓣數(shù),取花瓣數(shù)的平均數(shù)作為性狀參考。花瓣數(shù)從 1到 159 瓣分布,有性狀差異。花瓣數(shù)低于 50 的樣本有 89 個,高于 50 的 32 個。詳細分布情況如圖 2-2。經(jīng)卡方檢驗,計算出 X2=0.12,查表可知20.05,1=3.84,X2<X20.05,1,證明表型數(shù)據(jù)符合 3:1 的分離比例。初步推測瓣可能是顯性性狀。詳細花瓣數(shù)據(jù)見附錄 A。

【參考文獻】:
期刊論文
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[3]QTL定位方法的研究進展[J]. 周明亮,納巴他,張顯澤,張清建,楊平貴.  草業(yè)與畜牧. 2012(05)
[4]棉花QTL定位原理、方法及研究進展[J]. 周仲華,陳金湘.  江西農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2005(04)
[5]林木遺傳圖譜構(gòu)建研究進展[J]. 張德強,張志毅.  世界林業(yè)研究. 2002(06)
[6]蓮的栽培史略[J]. 舒迎瀾.  中國農(nóng)史. 1988(01)

博士論文
[1]蓮野生居群遺傳多樣性評價及高密度遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 劉艷玲.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013



本文編號:3560691

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