WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物所特有的一個(gè)超級(jí)基因家族,能調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程及逆境反應(yīng)。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的EST序列設(shè)計(jì)引物,利用RT-PCR及RACE技術(shù)克隆了甘藍(lán)型油菜WRKY30基因cDNA全長(zhǎng)序列,并運(yùn)用生物信息學(xué)手段對(duì)序列進(jìn)行了分析及預(yù)測(cè)。結(jié)果表明:BnaWRKY30-like基因全長(zhǎng)cDNA序列中包含102 bp的5′-UTR序列,188 bp的3′-UTR序列以及942 bp的完整ORF,編碼313個(gè)氨基酸。該轉(zhuǎn)錄因子蛋白相對(duì)分子量為35 319.85D,等電點(diǎn)為6.22,基本氨基酸中含量最高的絲氨酸（Ser）,313個(gè)氨基酸中含有41個(gè)酸性氨基酸,34個(gè)堿性氨基酸,在121～182區(qū)域含有一個(gè)典型的WRKY結(jié)構(gòu)域。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)該轉(zhuǎn)錄因子定位于細(xì)胞核的可能性最高。蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)表明共有α-螺旋占26.20%,延伸鏈占10.54%,β-轉(zhuǎn)角占4.47%,無(wú)規(guī)則卷曲占58.79%。BnaWRKY30-like基因編碼的蛋白具有典型的WRKY轉(zhuǎn)錄因子特征,與擬南芥WRKY30基因親緣關(guān)系近,可能在油菜早期生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程及鹽脅迫中的發(fā)揮調(diào)控作用。 

【文章來(lái)源】：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,47(05)CSCD

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【部分圖文】：

油菜BnaWRKY30-like基因的RACE擴(kuò)增結(jié)果

利用NCBI blast程序比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)其與Brassica napus WRKY30(Accession:XP＿013643451.1）、Brassica oleracea WRKY30(Accession:XP＿013596670.1）和Brassica rapa WRKY30(Accession:NP＿001288989.1）轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸序列相似性最高，即命名為BnaWRKY30-like。利用DNAMAN8.0軟件將BnaWRKY30-like與Brassica napus WRKY30、Brassica oleraceaWRKY30、Brassica rapaWRKY30進(jìn)行多序列比對(duì)結(jié)果如圖2所示。這4個(gè)轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列高度相似，但均在不同的位置存在少數(shù)氨基酸差異。圖3 BnaWRKY30-like蛋白氨基酸序列保守結(jié)構(gòu)域檢索

BnaWRKY30-like蛋白氨基酸序列保守結(jié)構(gòu)域檢索

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3556973