紫娟茶樹miR828a靶基因WER的克隆及生物信息學分析
發(fā)布時間:2021-12-28 02:28
為進一步了解mi R828a靶基因WER的功能及生物學特性,通過RACE方法對紫娟茶樹WER基因進行克隆,并使用生物信息學Protparam、Signal P、SWISS-Mo DEL等工具對其序列進行分析。結(jié)果表明,WER基因全長885 bp,含有一條276 bp的完整開放閱讀框,編碼92個氨基酸,與番櫻桃So MYB114具有較高的親緣性;WER屬于不穩(wěn)定親水蛋白,具有跨膜結(jié)構(gòu)域,亞細胞定位于質(zhì)膜和線粒體上,推測WER蛋白在質(zhì)膜和線粒體上發(fā)揮信號轉(zhuǎn)導的作用。
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)科學. 2020,48(11)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
1.2.1 RNA提取及c DNA的合成
1.2.2 WER基因的克隆
1.2.3 WER基因的生物信息學分析
2 結(jié)果與分析
2.1 茶樹WER基因的序列分析
2.2 WER系統(tǒng)進化分析
2.3 WER蛋白疏水性分析
2.4 WER蛋白跨膜區(qū)預測
2.5 WER蛋白亞細胞定位預測
2.6 WER蛋白三維結(jié)構(gòu)預測
3 結(jié)論與討論
本文編號:3553221
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)科學. 2020,48(11)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
1.2.1 RNA提取及c DNA的合成
1.2.2 WER基因的克隆
1.2.3 WER基因的生物信息學分析
2 結(jié)果與分析
2.1 茶樹WER基因的序列分析
2.2 WER系統(tǒng)進化分析
2.3 WER蛋白疏水性分析
2.4 WER蛋白跨膜區(qū)預測
2.5 WER蛋白亞細胞定位預測
2.6 WER蛋白三維結(jié)構(gòu)預測
3 結(jié)論與討論
本文編號:3553221
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