紫娟茶樹miR828a靶基因WER的克隆及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-28 02:28
為進(jìn)一步了解mi R828a靶基因WER的功能及生物學(xué)特性,通過RACE方法對(duì)紫娟茶樹WER基因進(jìn)行克隆,并使用生物信息學(xué)Protparam、Signal P、SWISS-Mo DEL等工具對(duì)其序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明,WER基因全長(zhǎng)885 bp,含有一條276 bp的完整開放閱讀框,編碼92個(gè)氨基酸,與番櫻桃So MYB114具有較高的親緣性;WER屬于不穩(wěn)定親水蛋白,具有跨膜結(jié)構(gòu)域,亞細(xì)胞定位于質(zhì)膜和線粒體上,推測(cè)WER蛋白在質(zhì)膜和線粒體上發(fā)揮信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的作用。
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(11)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 RNA提取及c DNA的合成
1.2.2 WER基因的克隆
1.2.3 WER基因的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 茶樹WER基因的序列分析
2.2 WER系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 WER蛋白疏水性分析
2.4 WER蛋白跨膜區(qū)預(yù)測(cè)
2.5 WER蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
2.6 WER蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3 結(jié)論與討論
本文編號(hào):3553221
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(11)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 RNA提取及c DNA的合成
1.2.2 WER基因的克隆
1.2.3 WER基因的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 茶樹WER基因的序列分析
2.2 WER系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 WER蛋白疏水性分析
2.4 WER蛋白跨膜區(qū)預(yù)測(cè)
2.5 WER蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
2.6 WER蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3 結(jié)論與討論
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