鈣依賴蛋白激酶（calcium dependent-protein kinase, CDPKs或CPKs）在植物細(xì)胞內(nèi)Ca2+信號(hào)識(shí)別和轉(zhuǎn)導(dǎo)中具有重要作用,參與植物生長(zhǎng)發(fā)育、對(duì)生物脅迫和非生物脅迫的抗性反應(yīng)等。至今尚無(wú)甘蔗屬（Saccharum）植物中CDPK基因的相關(guān)報(bào)道。本研究根據(jù)已公布的甘蔗屬割手密（Saccharum spontaneum）基因組信息,利用生物信息學(xué)方法對(duì)割手密中CDPK基因家族成員進(jìn)行鑒定,共鑒定到90個(gè)SsCDPKs,并對(duì)其生理生化參數(shù)、染色體定位、基因復(fù)制事件、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、保守基序和功能結(jié)構(gòu)域等進(jìn)行分析。共線性分析結(jié)果顯示,有些SsCDPK基因可能與水稻（Oryza sativa）的CDPK基因來(lái)自同一祖先。進(jìn)化選擇壓力分析發(fā)現(xiàn),割手密CDPK基因在進(jìn)化過(guò)程中受正向選擇,可能在植物進(jìn)化中具有重要作用�；谵D(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析SsCDPK表達(dá)特性,發(fā)現(xiàn)SsCDPK表達(dá)具有明顯的組織和發(fā)育時(shí)期特異性,甘蔗栽培品種’粵糖55’（YT55）中部分SsCDPK基因表達(dá)受低氮和低鉀脅迫的調(diào)控。本研究結(jié)果提示,SsCDPKs基因可能參與甘蔗屬植物的生長(zhǎng)發(fā)育和對(duì)營(yíng)養(yǎng)... 

【文章來(lái)源】：農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2020,28(12)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：14 頁(yè)

【部分圖文】：

低鉀脅迫下甘蔗品種YT55根中SsCDPK基因的表達(dá)分析Figure9ExpressionanalysesofSsCDPKsinrootofsugarcanecultivarYT55underlow-potassiumstressCocaM

.273574.561081.261081.255180.247952.055151.262188.352774.760220.360135.260698.849450.760487.557979.664042.462919.157158.657273.657203.697051.151996.958176.757535.06.837.137.546.467.176.887.259.627.257.256.066.426.266.806.356.756.636.635.236.528.359.059.085.695.545.697.489.737.967.95下劃線指示與高粱基因同源的代表性基因TheunderscoresindicaterepresentativegeneshomologoustoSorghumgenes圖1割手密CDPK基因的染色體定位及基因復(fù)制事件Figure1ChromosomallocationsandgeneduplicationofS.spontaneumCDPKgenes綠色：串聯(lián)復(fù)制；黃色：近端復(fù)制；紅色：分散復(fù)制；藍(lán)色：片段復(fù)制Green:Tandemduplication;Yellow:Proximalduplication;Red:Dispersedduplication;Blue:Segmentalduplicationchr1Achr1Bchr1Cchr1Dchr2Achr2Bchr2Cchr2Dchr3Achr3Bchr3Cchr3Dchr4Achr4Bchr4Cchr4Dchr5Achr5Bchr5Cchr5Dchr6Achr6Bchr6Cchr6Dchr7Achr7Bchr7Cchr7Dchr8Achr8C0M100M0M90M10M20M30M40M50M60M70M80M0M100M2156

活動(dòng)的調(diào)控(Morello,2000;Shi,2018)。本研究結(jié)果顯示，與香蕉MaCDPKs、水稻OsCPK23和玉米ZmCPK37一致(Ray,2007;Li,2020)，多個(gè)SsCDPKs的表達(dá)具有顯著的組織和時(shí)空特異性。ZmCPK37在玉米根織中特異表達(dá)且在鹽脅迫處理后其轉(zhuǎn)錄水平顯著上升(Kong,2013)。二穗短柄草中的BdCDPK01和BdCDPK20的轉(zhuǎn)錄水平在冷、熱、H2O2、NaCl和PEG6000處理后均顯著上調(diào)，而B(niǎo)dCDPK09的表達(dá)卻只受熱、H2O2和NaCl脅迫處理影響，不受冷和PEG處理調(diào)控(Wen,2020)。本研究結(jié)果顯圖6割手密CDPKs在不同發(fā)育時(shí)期和不同組織中的表達(dá)分析Figure6ExpressionanalysesofCDPKsindifferenttissuesofS.spontaneumatdifferentdevelopmentstages葉Leaf莖Stem卷葉Leaf-rol莖3Stem3葉Leaf莖6/9Stem6/9莖9/15Stem9/15卷葉Leaf-rol葉Leaf莖3Stem3莖6/9Stem6/9莖9/15Stem9/15幼苗期Seedling成熟前期Pre-mature成熟期Mature割手密CDPK基因家族的鑒定及表達(dá)分析IdentificationandExpressionAnalysisofCDPKGeneFamilyinSaccharumspontaneum2161

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]不同硝態(tài)氮供應(yīng)水平對(duì)平邑甜茶生長(zhǎng)及氮素吸收利用和分配特性的影響[J]. 沙建川,葛順?lè)?豐艷廣,陳建明,姜遠(yuǎn)茂.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2018(03)



本文編號(hào)：3547475