紅花草莓花青素苷合成結(jié)構(gòu)基因FpDFR、FpANS及啟動子的克隆與分析
發(fā)布時間:2021-12-22 21:25
紅花草莓(red-flowered strawberry)是由開白花的栽培草莓(Fragaria×ananassa)與開紅花的沼委陵菜(Potentilla palustris)通過遠(yuǎn)緣雜交方法育成的屬間雜種,是草莓家族的新成員,具有很高的觀賞價值,同時果實(shí)亦可食用,具有很好的發(fā)展空間與前景。近幾年以來,隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,可以為紅花草莓花瓣呈色的研究機(jī)理提供新的思路。紅花草莓雜交后代花瓣發(fā)生顯著的性狀分離,后代的花色從白色一直變化到紅色,本文以轉(zhuǎn)錄組測序分析等手段,以紅花草莓品種‘四季紅’雜交后代的紅色花瓣和白色花瓣為試材,期望從轉(zhuǎn)錄水平分析花色的差異。基于前期的研究基礎(chǔ),克隆紅花草莓花瓣花青素苷合成途徑中關(guān)鍵結(jié)構(gòu)基因和啟動子序列,分析不同花色的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),這對進(jìn)一步了解紅花草莓花色調(diào)控機(jī)制具有重要意義。主要研究結(jié)果如下:以紅花草莓品種‘四季紅’為試材,選取其花瓣發(fā)育過程中具有明顯顏色變化的三個發(fā)育時期,即蕾期(PFL)、轉(zhuǎn)色期(PFZ)、大蕾期(PFD)的花瓣樣品,進(jìn)行高通量測序。通過基因功能注釋,篩選花青素苷合...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
紅花草莓花瓣不同的發(fā)育階段
結(jié)果與分析183結(jié)果與分析3.1紅花草莓轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)篩選為了明確紅花草莓花青苷合成途徑的調(diào)控機(jī)理,本課題組前期對紅花草莓三個時期花蕾花瓣進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序,挑選出在紅花草莓花色合成途徑中行使相應(yīng)功能的結(jié)構(gòu)基因DFR與ANS,基于前人實(shí)驗結(jié)果(薛莉,2016)與紅花草莓轉(zhuǎn)錄組文庫中花青苷合成途徑中結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)量等數(shù)據(jù),如表5所示,篩選得到表達(dá)差異顯著的3個DFR與1個ANS下游結(jié)構(gòu)基因。表5基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)所選基因Table5Selectedgenesbasedontranscriptomedata基因IDGeneID長度Length蕾期平均值TPM(L)轉(zhuǎn)色期平均值TPM(Z)大蕾期平均值TPM(D)log2FC值log2FCDFR1TRINITY_DN14121_c0_g210380.070.452.253.32DFR2TRINITY_DN14121_c0_g313110.92103.80570.706.10DFR3TRINITY_DN16693_c0_g120413.713.405.620.47ANS1TRINITY_DN20632_c0_g114863.13234.10835.945.493.2紅花草莓花青素苷合成途徑中結(jié)構(gòu)基因FpDFR和FpANS的生物信息學(xué)分析以紅花草莓莓品種‘四季紅’和雜交后代白花‘B1’的盛花期花瓣為材料,提取RNA,克隆4個結(jié)構(gòu)基因分別名為FpDFR1、FpDFR2、FpDFR3、FpANS1(圖2)。圖2結(jié)構(gòu)基因克隆產(chǎn)物凝膠電泳的檢測注:數(shù)字1-4分別為FpDFR1、FpDFR2、FpDFR3和FpANS1結(jié)構(gòu)基因克隆產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果Fig.2DetectionofstructuralgenecloneproductsbyagarosegelelectrophoresisNote:Numbers1-4aretheagarosegelelectrophoresisresultsofcloneproductsfromstructuralgenesFpDFR1,FpDFR2,FpDFR3andFpANS1respectively
KKeEEmMMgGGfFFeEEfFFkKKhHHsSSlLLeEEdDDmMMfFFtTTgGGaAAvVVdDDaAAcCCrRReEEkKKgGGlLLlLLpPPlLLpPPqQQeEEeEEeEEaAAeEEkKKrRRrRRaAA圖3結(jié)構(gòu)基因FpDFR1在紅色和白色花瓣中的克隆結(jié)果比較Fig.3ComparisonofcloningresultsofstructuregeneFpDFR1inredandwhitepetals圖4結(jié)構(gòu)基因FpDFR1在紅白花草莓中的克隆結(jié)果與其他物種序列比較Fig.4ComparisonofcloneresultsofstructuregeneFpDFR1inred-andwhite-floweredstrawberryandotherspecies
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葡萄風(fēng)信子MaHY5基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 曹詩夢,劉雅莉. 西北植物學(xué)報. 2019(07)
[2]葡萄風(fēng)信子MaGT1基因的克隆及其表達(dá)分析[J]. 梁沛雯,婁倩,劉雅莉. 西北植物學(xué)報. 2019(06)
[3]紅花草莓粉佳人與俏佳人雜交后代花與果實(shí)性狀調(diào)查分析[J]. 薛莉,劉玉,吳雪,王晨,何靜娟,岳靜宇,雷家軍. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(02)
[4]紅花草莓與栽培品種雜交后代花及果實(shí)性狀調(diào)查[J]. 王沖,李迎薪,李向輝,岳靜宇,李文清,雷家軍. 北方園藝. 2019(01)
[5]毛白楊花青素合酶基因的克隆與特性分析[J]. 姚建忠. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2018(03)
[6]二氫黃酮醇-4-還原酶在花青素合成中的功能及調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 李亞麗,李欣,肖婕,李瑞玲,楊華麗,孫勃,湯浩茹. 西北植物學(xué)報. 2018(01)
[7]紅花草莓‘俏佳人’與白花品種‘佐賀清香’雜交后代性狀調(diào)查[J]. 張屹,趙琳,赫嵩,雷家軍,薛莉. 園藝與種苗. 2018(01)
[8]黑果枸杞WD40編碼基因LrAN11的克隆及表達(dá)分析[J]. 嚴(yán)莉,陳建偉,王翠平,喬改霞,李健. 核農(nóng)學(xué)報. 2017(11)
[9]紅花草莓新品種‘紫金紅’[J]. 王慶蓮,趙密珍,王壯偉,吳偉民,錢亞明. 園藝學(xué)報. 2017(12)
[10]百脈根花青素合酶基因(LcANS)的克隆及表達(dá)分析[J]. 馬蘭. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(07)
博士論文
[1]藍(lán)色花葡萄風(fēng)信子關(guān)鍵基因DFR和FLS調(diào)控花青苷積累的功能研究[D]. 劉紅利.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]丹參類黃酮合成途徑關(guān)鍵酶基因的克隆與功能分析[D]. 李紅艷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[3]紅花草莓花瓣呈色相關(guān)基因表達(dá)分析及花色分子標(biāo)記[D]. 丁言.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]野鳶尾與射干種間雜交后代遺傳變異及花色形成機(jī)理研究[D]. 徐文姬.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[5]葡萄風(fēng)信子MYB和bHLH轉(zhuǎn)錄因子對花青苷合成的調(diào)控研究[D]. 陳凱利.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[6]玫瑰類黃酮合成相關(guān)基因的克隆和功能解析[D]. 羅平.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[7]紅花草莓種質(zhì)創(chuàng)新及花色形成機(jī)理研究[D]. 薛莉.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[8]玉米萜類合成酶基因TPS10表達(dá)調(diào)控的研究[D]. 李圣彥.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]‘澳洲青蘋’蘋果套袋處理后果實(shí)著色相關(guān)基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 張小軍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[10]浙江紅山茶花青素和脂肪酸合成相關(guān)基因克隆與表達(dá)分析[D]. 王仲偉.南京林業(yè)大學(xué) 2013
碩士論文
[1]紅花草莓花色相關(guān)miRNA的鑒定與分析[D]. 王海峰.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]桑樹花青素生物合成相關(guān)基因及其與桑椹花青素含量的關(guān)系研究[D]. 王如鳳.江蘇科技大學(xué) 2019
[3]玫瑰3個WD40轉(zhuǎn)錄因子的克隆與表達(dá)分析[D]. 王燁楠.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]藥西瓜UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶基因克隆與原核表達(dá)分析[D]. 劉月.延邊大學(xué) 2018
[5]羽衣甘藍(lán)粉色葉相關(guān)基因DFR的克隆及表達(dá)載體構(gòu)建[D]. 田振東.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[6]紅花草莓花色對溫度的響應(yīng)及花色相關(guān)基因表達(dá)分析[D]. 梁吉昌.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[7]蘋果MdARF3基因克隆及功能分析[D]. 田家瑞.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[8]十倍體紅花草莓雜交后代植物學(xué)性狀觀察及抗寒性評價研究[D]. 常雯青.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[9]刺梨GGP基因啟動子的克隆、分析及其功能驗證[D]. 張書軒.貴州大學(xué) 2018
[10]玫瑰RrSLF基因的克隆、表達(dá)分析及亞細(xì)胞定位[D]. 李康.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號:3547120
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
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【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
紅花草莓花瓣不同的發(fā)育階段
結(jié)果與分析183結(jié)果與分析3.1紅花草莓轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)篩選為了明確紅花草莓花青苷合成途徑的調(diào)控機(jī)理,本課題組前期對紅花草莓三個時期花蕾花瓣進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序,挑選出在紅花草莓花色合成途徑中行使相應(yīng)功能的結(jié)構(gòu)基因DFR與ANS,基于前人實(shí)驗結(jié)果(薛莉,2016)與紅花草莓轉(zhuǎn)錄組文庫中花青苷合成途徑中結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)量等數(shù)據(jù),如表5所示,篩選得到表達(dá)差異顯著的3個DFR與1個ANS下游結(jié)構(gòu)基因。表5基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)所選基因Table5Selectedgenesbasedontranscriptomedata基因IDGeneID長度Length蕾期平均值TPM(L)轉(zhuǎn)色期平均值TPM(Z)大蕾期平均值TPM(D)log2FC值log2FCDFR1TRINITY_DN14121_c0_g210380.070.452.253.32DFR2TRINITY_DN14121_c0_g313110.92103.80570.706.10DFR3TRINITY_DN16693_c0_g120413.713.405.620.47ANS1TRINITY_DN20632_c0_g114863.13234.10835.945.493.2紅花草莓花青素苷合成途徑中結(jié)構(gòu)基因FpDFR和FpANS的生物信息學(xué)分析以紅花草莓莓品種‘四季紅’和雜交后代白花‘B1’的盛花期花瓣為材料,提取RNA,克隆4個結(jié)構(gòu)基因分別名為FpDFR1、FpDFR2、FpDFR3、FpANS1(圖2)。圖2結(jié)構(gòu)基因克隆產(chǎn)物凝膠電泳的檢測注:數(shù)字1-4分別為FpDFR1、FpDFR2、FpDFR3和FpANS1結(jié)構(gòu)基因克隆產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果Fig.2DetectionofstructuralgenecloneproductsbyagarosegelelectrophoresisNote:Numbers1-4aretheagarosegelelectrophoresisresultsofcloneproductsfromstructuralgenesFpDFR1,FpDFR2,FpDFR3andFpANS1respectively
KKeEEmMMgGGfFFeEEfFFkKKhHHsSSlLLeEEdDDmMMfFFtTTgGGaAAvVVdDDaAAcCCrRReEEkKKgGGlLLlLLpPPlLLpPPqQQeEEeEEeEEaAAeEEkKKrRRrRRaAA圖3結(jié)構(gòu)基因FpDFR1在紅色和白色花瓣中的克隆結(jié)果比較Fig.3ComparisonofcloningresultsofstructuregeneFpDFR1inredandwhitepetals圖4結(jié)構(gòu)基因FpDFR1在紅白花草莓中的克隆結(jié)果與其他物種序列比較Fig.4ComparisonofcloneresultsofstructuregeneFpDFR1inred-andwhite-floweredstrawberryandotherspecies
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葡萄風(fēng)信子MaHY5基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 曹詩夢,劉雅莉. 西北植物學(xué)報. 2019(07)
[2]葡萄風(fēng)信子MaGT1基因的克隆及其表達(dá)分析[J]. 梁沛雯,婁倩,劉雅莉. 西北植物學(xué)報. 2019(06)
[3]紅花草莓粉佳人與俏佳人雜交后代花與果實(shí)性狀調(diào)查分析[J]. 薛莉,劉玉,吳雪,王晨,何靜娟,岳靜宇,雷家軍. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(02)
[4]紅花草莓與栽培品種雜交后代花及果實(shí)性狀調(diào)查[J]. 王沖,李迎薪,李向輝,岳靜宇,李文清,雷家軍. 北方園藝. 2019(01)
[5]毛白楊花青素合酶基因的克隆與特性分析[J]. 姚建忠. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2018(03)
[6]二氫黃酮醇-4-還原酶在花青素合成中的功能及調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 李亞麗,李欣,肖婕,李瑞玲,楊華麗,孫勃,湯浩茹. 西北植物學(xué)報. 2018(01)
[7]紅花草莓‘俏佳人’與白花品種‘佐賀清香’雜交后代性狀調(diào)查[J]. 張屹,趙琳,赫嵩,雷家軍,薛莉. 園藝與種苗. 2018(01)
[8]黑果枸杞WD40編碼基因LrAN11的克隆及表達(dá)分析[J]. 嚴(yán)莉,陳建偉,王翠平,喬改霞,李健. 核農(nóng)學(xué)報. 2017(11)
[9]紅花草莓新品種‘紫金紅’[J]. 王慶蓮,趙密珍,王壯偉,吳偉民,錢亞明. 園藝學(xué)報. 2017(12)
[10]百脈根花青素合酶基因(LcANS)的克隆及表達(dá)分析[J]. 馬蘭. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(07)
博士論文
[1]藍(lán)色花葡萄風(fēng)信子關(guān)鍵基因DFR和FLS調(diào)控花青苷積累的功能研究[D]. 劉紅利.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]丹參類黃酮合成途徑關(guān)鍵酶基因的克隆與功能分析[D]. 李紅艷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[3]紅花草莓花瓣呈色相關(guān)基因表達(dá)分析及花色分子標(biāo)記[D]. 丁言.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]野鳶尾與射干種間雜交后代遺傳變異及花色形成機(jī)理研究[D]. 徐文姬.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[5]葡萄風(fēng)信子MYB和bHLH轉(zhuǎn)錄因子對花青苷合成的調(diào)控研究[D]. 陳凱利.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[6]玫瑰類黃酮合成相關(guān)基因的克隆和功能解析[D]. 羅平.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[7]紅花草莓種質(zhì)創(chuàng)新及花色形成機(jī)理研究[D]. 薛莉.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[8]玉米萜類合成酶基因TPS10表達(dá)調(diào)控的研究[D]. 李圣彥.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]‘澳洲青蘋’蘋果套袋處理后果實(shí)著色相關(guān)基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 張小軍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[10]浙江紅山茶花青素和脂肪酸合成相關(guān)基因克隆與表達(dá)分析[D]. 王仲偉.南京林業(yè)大學(xué) 2013
碩士論文
[1]紅花草莓花色相關(guān)miRNA的鑒定與分析[D]. 王海峰.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]桑樹花青素生物合成相關(guān)基因及其與桑椹花青素含量的關(guān)系研究[D]. 王如鳳.江蘇科技大學(xué) 2019
[3]玫瑰3個WD40轉(zhuǎn)錄因子的克隆與表達(dá)分析[D]. 王燁楠.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[4]藥西瓜UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶基因克隆與原核表達(dá)分析[D]. 劉月.延邊大學(xué) 2018
[5]羽衣甘藍(lán)粉色葉相關(guān)基因DFR的克隆及表達(dá)載體構(gòu)建[D]. 田振東.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[6]紅花草莓花色對溫度的響應(yīng)及花色相關(guān)基因表達(dá)分析[D]. 梁吉昌.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
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[10]玫瑰RrSLF基因的克隆、表達(dá)分析及亞細(xì)胞定位[D]. 李康.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號:3547120
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