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紅花草莓花青素苷合成結構基因FpDFR、FpANS及啟動子的克隆與分析

發(fā)布時間:2021-12-22 21:25
  紅花草莓(red-flowered strawberry)是由開白花的栽培草莓(Fragaria×ananassa)與開紅花的沼委陵菜(Potentilla palustris)通過遠緣雜交方法育成的屬間雜種,是草莓家族的新成員,具有很高的觀賞價值,同時果實亦可食用,具有很好的發(fā)展空間與前景。近幾年以來,隨著高通量測序技術的發(fā)展,可以為紅花草莓花瓣呈色的研究機理提供新的思路。紅花草莓雜交后代花瓣發(fā)生顯著的性狀分離,后代的花色從白色一直變化到紅色,本文以轉錄組測序分析等手段,以紅花草莓品種‘四季紅’雜交后代的紅色花瓣和白色花瓣為試材,期望從轉錄水平分析花色的差異;谇捌诘难芯炕A,克隆紅花草莓花瓣花青素苷合成途徑中關鍵結構基因和啟動子序列,分析不同花色的結構特點,這對進一步了解紅花草莓花色調控機制具有重要意義。主要研究結果如下:以紅花草莓品種‘四季紅’為試材,選取其花瓣發(fā)育過程中具有明顯顏色變化的三個發(fā)育時期,即蕾期(PFL)、轉色期(PFZ)、大蕾期(PFD)的花瓣樣品,進行高通量測序。通過基因功能注釋,篩選花青素苷合... 

【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

紅花草莓花青素苷合成結構基因FpDFR、FpANS及啟動子的克隆與分析


紅花草莓花瓣不同的發(fā)育階段

結構基因,凝膠電泳,紅花草,產(chǎn)物


結果與分析183結果與分析3.1紅花草莓轉錄組數(shù)據(jù)篩選為了明確紅花草莓花青苷合成途徑的調控機理,本課題組前期對紅花草莓三個時期花蕾花瓣進行了轉錄組測序,挑選出在紅花草莓花色合成途徑中行使相應功能的結構基因DFR與ANS,基于前人實驗結果(薛莉,2016)與紅花草莓轉錄組文庫中花青苷合成途徑中結構基因的表達量等數(shù)據(jù),如表5所示,篩選得到表達差異顯著的3個DFR與1個ANS下游結構基因。表5基于轉錄組數(shù)據(jù)所選基因Table5Selectedgenesbasedontranscriptomedata基因IDGeneID長度Length蕾期平均值TPM(L)轉色期平均值TPM(Z)大蕾期平均值TPM(D)log2FC值log2FCDFR1TRINITY_DN14121_c0_g210380.070.452.253.32DFR2TRINITY_DN14121_c0_g313110.92103.80570.706.10DFR3TRINITY_DN16693_c0_g120413.713.405.620.47ANS1TRINITY_DN20632_c0_g114863.13234.10835.945.493.2紅花草莓花青素苷合成途徑中結構基因FpDFR和FpANS的生物信息學分析以紅花草莓莓品種‘四季紅’和雜交后代白花‘B1’的盛花期花瓣為材料,提取RNA,克隆4個結構基因分別名為FpDFR1、FpDFR2、FpDFR3、FpANS1(圖2)。圖2結構基因克隆產(chǎn)物凝膠電泳的檢測注:數(shù)字1-4分別為FpDFR1、FpDFR2、FpDFR3和FpANS1結構基因克隆產(chǎn)物凝膠電泳結果Fig.2DetectionofstructuralgenecloneproductsbyagarosegelelectrophoresisNote:Numbers1-4aretheagarosegelelectrophoresisresultsofcloneproductsfromstructuralgenesFpDFR1,FpDFR2,FpDFR3andFpANS1respectively

序列,結構基因,草莓,物種


KKeEEmMMgGGfFFeEEfFFkKKhHHsSSlLLeEEdDDmMMfFFtTTgGGaAAvVVdDDaAAcCCrRReEEkKKgGGlLLlLLpPPlLLpPPqQQeEEeEEeEEaAAeEEkKKrRRrRRaAA圖3結構基因FpDFR1在紅色和白色花瓣中的克隆結果比較Fig.3ComparisonofcloningresultsofstructuregeneFpDFR1inredandwhitepetals圖4結構基因FpDFR1在紅白花草莓中的克隆結果與其他物種序列比較Fig.4ComparisonofcloneresultsofstructuregeneFpDFR1inred-andwhite-floweredstrawberryandotherspecies

【參考文獻】:
期刊論文
[1]葡萄風信子MaHY5基因的克隆與表達分析[J]. 曹詩夢,劉雅莉.  西北植物學報. 2019(07)
[2]葡萄風信子MaGT1基因的克隆及其表達分析[J]. 梁沛雯,婁倩,劉雅莉.  西北植物學報. 2019(06)
[3]紅花草莓粉佳人與俏佳人雜交后代花與果實性狀調查分析[J]. 薛莉,劉玉,吳雪,王晨,何靜娟,岳靜宇,雷家軍.  沈陽農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(02)
[4]紅花草莓與栽培品種雜交后代花及果實性狀調查[J]. 王沖,李迎薪,李向輝,岳靜宇,李文清,雷家軍.  北方園藝. 2019(01)
[5]毛白楊花青素合酶基因的克隆與特性分析[J]. 姚建忠.  中國細胞生物學學報. 2018(03)
[6]二氫黃酮醇-4-還原酶在花青素合成中的功能及調控研究進展[J]. 李亞麗,李欣,肖婕,李瑞玲,楊華麗,孫勃,湯浩茹.  西北植物學報. 2018(01)
[7]紅花草莓‘俏佳人’與白花品種‘佐賀清香’雜交后代性狀調查[J]. 張屹,趙琳,赫嵩,雷家軍,薛莉.  園藝與種苗. 2018(01)
[8]黑果枸杞WD40編碼基因LrAN11的克隆及表達分析[J]. 嚴莉,陳建偉,王翠平,喬改霞,李健.  核農(nóng)學報. 2017(11)
[9]紅花草莓新品種‘紫金紅’[J]. 王慶蓮,趙密珍,王壯偉,吳偉民,錢亞明.  園藝學報. 2017(12)
[10]百脈根花青素合酶基因(LcANS)的克隆及表達分析[J]. 馬蘭.  基因組學與應用生物學. 2017(07)

博士論文
[1]藍色花葡萄風信子關鍵基因DFR和FLS調控花青苷積累的功能研究[D]. 劉紅利.西北農(nóng)林科技大學 2019
[2]丹參類黃酮合成途徑關鍵酶基因的克隆與功能分析[D]. 李紅艷.西北農(nóng)林科技大學 2019
[3]紅花草莓花瓣呈色相關基因表達分析及花色分子標記[D]. 丁言.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2019
[4]野鳶尾與射干種間雜交后代遺傳變異及花色形成機理研究[D]. 徐文姬.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2018
[5]葡萄風信子MYB和bHLH轉錄因子對花青苷合成的調控研究[D]. 陳凱利.西北農(nóng)林科技大學 2017
[6]玫瑰類黃酮合成相關基因的克隆和功能解析[D]. 羅平.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
[7]紅花草莓種質創(chuàng)新及花色形成機理研究[D]. 薛莉.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2016
[8]玉米萜類合成酶基因TPS10表達調控的研究[D]. 李圣彥.中國農(nóng)業(yè)大學 2015
[9]‘澳洲青蘋’蘋果套袋處理后果實著色相關基因的克隆及表達分析[D]. 張小軍.西北農(nóng)林科技大學 2013
[10]浙江紅山茶花青素和脂肪酸合成相關基因克隆與表達分析[D]. 王仲偉.南京林業(yè)大學 2013

碩士論文
[1]紅花草莓花色相關miRNA的鑒定與分析[D]. 王海峰.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2019
[2]桑樹花青素生物合成相關基因及其與桑椹花青素含量的關系研究[D]. 王如鳳.江蘇科技大學 2019
[3]玫瑰3個WD40轉錄因子的克隆與表達分析[D]. 王燁楠.山東農(nóng)業(yè)大學 2019
[4]藥西瓜UDP-糖基轉移酶基因克隆與原核表達分析[D]. 劉月.延邊大學 2018
[5]羽衣甘藍粉色葉相關基因DFR的克隆及表達載體構建[D]. 田振東.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2018
[6]紅花草莓花色對溫度的響應及花色相關基因表達分析[D]. 梁吉昌.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2018
[7]蘋果MdARF3基因克隆及功能分析[D]. 田家瑞.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2018
[8]十倍體紅花草莓雜交后代植物學性狀觀察及抗寒性評價研究[D]. 常雯青.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2018
[9]刺梨GGP基因啟動子的克隆、分析及其功能驗證[D]. 張書軒.貴州大學 2018
[10]玫瑰RrSLF基因的克隆、表達分析及亞細胞定位[D]. 李康.山東農(nóng)業(yè)大學 2018



本文編號:3547120

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