菠蘿（Ananas comosus（L.）Merr.）屬于鳳梨科（Bromeliaceae）,是世界上聞名的熱帶和亞熱帶水果之一,也是我國重要的經濟作物。菠蘿果實含糖量是決定菠蘿品質和產量的重要因素之一。果實中糖的累積主要通過碳水化合物代謝,光合同化產物主要以蔗糖的形式運輸到庫器官,給庫器官生長發(fā)育提供能量。糖外排轉運蛋白（sugars will eventually be exported transporters,SWEETs）是一組最近確定的植物糖轉運蛋白,在不同的生理過程中發(fā)揮重要作用。然而,目前關于這個基因家族的信息在菠蘿中很少涉及。最近發(fā)布的菠蘿基因組為調查菠蘿SWEET基因在全基因組水平上的組織和進化特征提供了一個很好的機會。本研究利用比較基因組學鑒定出菠蘿基因家族成員,利用一系列的生物信息學方法提供了菠蘿SWEET基因的系統描述,利用轉錄組數據（RNAseq）分析不同基因的表達模式,鑒定了在菠蘿果實發(fā)育方面可能起作用的SWEET基因,以期為菠蘿的分子育種提供依據。主要研究結果如下:（1）以擬南芥SWEET基因為參考,通過比較基因組學確定了SWEET基因在兩個菠蘿栽培品種... 

【文章來源】：山東農業(yè)大學山東省

【文章頁數】：59 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
1 前言
    1.1 菠蘿的概述
    1.2 糖在植物中的作用
    1.3 植物SWEET蛋白的結構與功能
        1.3.1 SWEET蛋白的結構特征
        1.3.2 SWEET蛋白的生物學功能
    1.4 植物SWEET基因家族的進化分析
    1.5 本研究的目的與意義
    1.6 本文的主要研究內容
    1.7 本章小結
2 材料與方法
    2.1 材料概況
    2.2 SWEET基因家族的數據檢索和預測
    2.3 SWEET基因家族的生物信息學分析方法
        2.3.1 SWEET基因家族的跨膜結構域預測
        2.3.2 SWEET基因家族的系統進化樹的構建
        2.3.3 SWEET基因家族的保守基序分析方法
        2.3.4 SWEET基因家族的基因結構預測
        2.3.5 SWEET基因家族的染色體定位與重復事件分析
        2.3.6 計算Ka/Ks值
        2.3.7 SWEET基因家族的表達模式分析
    2.4 軟件與算法
    2.5 本章小結
3 結果與分析
    3.1 SWEET基因家族的鑒定和特征分析
    3.2 SWEET基因家族的系統演化
    3.3 SWEET基因家族的染色體定位和重復事件
    3.4 菠蘿SWEET基因家族的選擇壓力
    3.5 SWEET基因家族的多序列聯配和保守結構域特征
    3.6 SWEET基因家族的結構
    3.7 SWEET基因家族在發(fā)育果實中的表達模式
    3.8 討論與小結
4 結論與展望
參考文獻
致謝
攻讀學位期間發(fā)表論文情況


【參考文獻】：
期刊論文
[1]雷蒙德氏棉SWEET基因家族的全基因組鑒定和進化分析[J]. 陳慧敏,李威,馬雄風,裴小雨,劉艷改,賀昆侖,張飛,張文生,王振玉,楊代剛,胡守林.  中國農學通報. 2017(25)
[2]植物SWEET基因家族結構、功能及調控研究進展[J]. 胡麗萍,張峰,徐惠,劉光敏,王亞欽,何洪巨.  生物技術通報. 2017(04)
[3]SWEET轉運蛋白家族的發(fā)現、結構及功能研究進展[J]. 孫文杰,左開井.  分子植物育種. 2016(04)
[4]擬南芥、水稻和番茄SW EET/MtN3/saliva基因家族的分析[J]. 韓佳軒,姜晶.  分子植物育種. 2015(03)
[5]SWEET蛋白家族研究進展[J]. 玄元虎,朱毅勇,胡一兵.  中國科學:生命科學. 2014(07)
[6]Rice MtN3/saliva/SWEET gene family: Evolution,expression profiling, and sugar transport[J]. Meng Yuan,Junwei Zhao,Renyan Huang,Xianghua Li,Jinghua Xiao,Shiping Wang.  Journal of Integrative Plant Biology. 2014(06)



本文編號：3546687