油茶果實發(fā)育相關(guān)基因SPATULA/ALCATRAZ的鑒別
發(fā)布時間:2021-12-17 18:44
擬南芥(Arabidopsis thaliana)SPATULA/ALCATRAZ是與果實發(fā)育和果實大小有關(guān)的基因。對普通油茶(Camellia oleifera)幼葉、未成熟種仁、花蕾的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘,得到2條油茶SPATULA基因序列和1條油茶ALCATRAZ基因序列;從油茶基因組三代測序數(shù)據(jù)中鑒別出含有前述3條序列的基因組DNA序列;最后,得到3條油茶SPATULA/ALCATRAZ基因全長CDS序列,分別命名為CoSPT1、CoSPT2、CoALC。用基部被子植物無油樟(Amborella trichopoda)的SPATULA及核心真雙子葉植物53個SPATULA/ALCATRAZ蛋白質(zhì)序列構(gòu)建進(jìn)化樹,結(jié)果表明,CoALC與擬南芥AtALC分布在不同的亞支,CoALC在油茶中的功能可能與AtALC不同,油茶蒴果的開裂機制可能與擬南芥不同;CoSPT1和CoSPT2的序列相似度只有54.57%,并且與CacuaSPT在同一個亞支,CoSPT1和CoSPT2可能是72.9~101.4百萬年前Ad-β全基因組復(fù)制的產(chǎn)物。
【文章來源】:南方林業(yè)科學(xué). 2020,48(05)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
核心真雙子葉植物SPATULA/ALCATRAZ蛋白質(zhì)系統(tǒng)進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]普通油茶INDEHISCENT同源基因的鑒別[J]. 趙松子. 南方林業(yè)科學(xué). 2020(01)
[2]果實起源與多樣化的進(jìn)化發(fā)育機制[J]. 賀超英,王麗,嚴(yán)立新,李巧茹,雍斌,朱韋韋. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2019(04)
[3]油茶基因組SMRT數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析[J]. 趙松子. 南方林業(yè)科學(xué). 2018(02)
[4]油茶氧化鯊烯環(huán)化酶基因序列分析[J]. 趙松子,黃建建,高偉. 江西林業(yè)科技. 2014(01)
[5]普通油茶與茶比較基因組學(xué)和進(jìn)化分析[J]. 趙松子,龔春,幸偉年. 江西林業(yè)科技. 2013(04)
[6]贛油茶25個優(yōu)良無性系品質(zhì)評價[J]. 左繼林,龔春,汪建平,周文才,溫強,徐林初. 浙江林學(xué)院學(xué)報. 2008(05)
本文編號:3540716
【文章來源】:南方林業(yè)科學(xué). 2020,48(05)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
核心真雙子葉植物SPATULA/ALCATRAZ蛋白質(zhì)系統(tǒng)進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]普通油茶INDEHISCENT同源基因的鑒別[J]. 趙松子. 南方林業(yè)科學(xué). 2020(01)
[2]果實起源與多樣化的進(jìn)化發(fā)育機制[J]. 賀超英,王麗,嚴(yán)立新,李巧茹,雍斌,朱韋韋. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2019(04)
[3]油茶基因組SMRT數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析[J]. 趙松子. 南方林業(yè)科學(xué). 2018(02)
[4]油茶氧化鯊烯環(huán)化酶基因序列分析[J]. 趙松子,黃建建,高偉. 江西林業(yè)科技. 2014(01)
[5]普通油茶與茶比較基因組學(xué)和進(jìn)化分析[J]. 趙松子,龔春,幸偉年. 江西林業(yè)科技. 2013(04)
[6]贛油茶25個優(yōu)良無性系品質(zhì)評價[J]. 左繼林,龔春,汪建平,周文才,溫強,徐林初. 浙江林學(xué)院學(xué)報. 2008(05)
本文編號:3540716
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