擬南芥（Arabidopsis thaliana）SPATULA/ALCATRAZ是與果實發(fā)育和果實大小有關的基因。對普通油茶（Camellia oleifera）幼葉、未成熟種仁、花蕾的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行挖掘,得到2條油茶SPATULA基因序列和1條油茶ALCATRAZ基因序列;從油茶基因組三代測序數(shù)據(jù)中鑒別出含有前述3條序列的基因組DNA序列;最后,得到3條油茶SPATULA/ALCATRAZ基因全長CDS序列,分別命名為CoSPT1、CoSPT2、CoALC。用基部被子植物無油樟（Amborella trichopoda）的SPATULA及核心真雙子葉植物53個SPATULA/ALCATRAZ蛋白質(zhì)序列構(gòu)建進化樹,結(jié)果表明,CoALC與擬南芥AtALC分布在不同的亞支,CoALC在油茶中的功能可能與AtALC不同,油茶蒴果的開裂機制可能與擬南芥不同;CoSPT1和CoSPT2的序列相似度只有54.57%,并且與CacuaSPT在同一個亞支,CoSPT1和CoSPT2可能是72.9～101.4百萬年前Ad-β全基因組復制的產(chǎn)物。 

【文章來源】：南方林業(yè)科學. 2020,48(05)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

核心真雙子葉植物SPATULA/ALCATRAZ蛋白質(zhì)系統(tǒng)進化樹

【參考文獻】：
期刊論文
[1]普通油茶INDEHISCENT同源基因的鑒別[J]. 趙松子.  南方林業(yè)科學. 2020(01)
[2]果實起源與多樣化的進化發(fā)育機制[J]. 賀超英,王麗,嚴立新,李巧茹,雍斌,朱韋韋.  中國科學:生命科學. 2019(04)
[3]油茶基因組SMRT數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析[J]. 趙松子.  南方林業(yè)科學. 2018(02)
[4]油茶氧化鯊烯環(huán)化酶基因序列分析[J]. 趙松子,黃建建,高偉.  江西林業(yè)科技. 2014(01)
[5]普通油茶與茶比較基因組學和進化分析[J]. 趙松子,龔春,幸偉年.  江西林業(yè)科技. 2013(04)
[6]贛油茶25個優(yōu)良無性系品質(zhì)評價[J]. 左繼林,龔春,汪建平,周文才,溫強,徐林初.  浙江林學院學報. 2008(05)



本文編號：3540716