番荔枝中一個(gè)SWEET家族基因的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-17 02:57
以番荔枝不同組織樣品為材料,通過基因文庫(kù)篩選,利用RT-PCR技術(shù)克隆出1個(gè)1227 bp的基因,命名為AT-SWEET16-1,該基因編碼408個(gè)氨基酸,該氨基酸序列在N端以α螺旋形成THB結(jié)構(gòu)域。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,該蛋白分子量為44.8 kDa,等電點(diǎn)為8.87。進(jìn)化分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)其與海棗(Phoenix dactylifera)相類聚。qRT-PCR分析結(jié)果表明,該基因在植株的根、莖、嫩葉、老葉、花蕾、花苞、幼果、成熟果中均有表達(dá),AT-SWEET16-1基因在不同組織中的表達(dá)量依次是:成熟果>莖>根>花蕾>幼果>老葉>嫩葉;該基因在不同果實(shí)發(fā)育階段中的表達(dá)情況為:在果實(shí)不同發(fā)育階段,果柄中的表達(dá)量最高,果肉、果皮中則相對(duì)較低,種子中最低;但果實(shí)成熟期該基因在果柄、果肉中的表達(dá)量最高。原位雜交實(shí)驗(yàn)觀察發(fā)現(xiàn),基因表達(dá)位置為果柄韌皮部、果肉細(xì)胞膜間,結(jié)合基因表達(dá)分析結(jié)果,預(yù)示該基因在植株糖分積累與轉(zhuǎn)運(yùn)等方面起到一定的作用。
【文章來源】:熱帶作物學(xué)報(bào). 2020,41(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
SWEET蛋白與其他物種SWEET蛋白同源序列分析
分析番荔枝AT-SWEET16-1基因在不同組織中的表達(dá)情況,結(jié)果見圖6和圖7,番荔枝AT-SWEET16-1基因在根、莖、嫩葉、老葉、花蕾、幼果、成熟果中均有表達(dá),不同組織間表達(dá)量存在明顯不同,但差異不顯著,在成熟果、莖的表達(dá)量均比其他組織高,其中,在成熟果中的表達(dá)量最高,在嫩葉組織中表達(dá)量最低,成熟果中的表達(dá)量是幼果表達(dá)量的4倍多,是嫩葉表達(dá)量的5倍多。AT-SWEET16-1基因在果實(shí)不同發(fā)育階段不同部位的表達(dá)情況見圖7,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在果實(shí)成熟期果柄的表達(dá)量明顯比其他果實(shí)發(fā)育時(shí)期的其他組織部位高,AT-SWEET16-1基因在花后140 d果實(shí)的果柄表達(dá)量最高,在果實(shí)種子中的最高表達(dá)量是在花后90 d。AT-SWEET16-1基因在番荔枝果實(shí)的不同部位的表達(dá)情況為:果柄>果肉>果皮>種子。
AT-SWEET16-1基因在果實(shí)不同發(fā)育階段不同部位的表達(dá)情況見圖7,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在果實(shí)成熟期果柄的表達(dá)量明顯比其他果實(shí)發(fā)育時(shí)期的其他組織部位高,AT-SWEET16-1基因在花后140 d果實(shí)的果柄表達(dá)量最高,在果實(shí)種子中的最高表達(dá)量是在花后90 d。AT-SWEET16-1基因在番荔枝果實(shí)的不同部位的表達(dá)情況為:果柄>果肉>果皮>種子。2.6 原位雜交
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SWEET轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在作物中的功能研究及前景展望[J]. 李艷嬌,李文才,孫琦,趙勐,李文蘭,于彥麗,孟昭東. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(06)
[2]木薯SWEETs基因家族生物信息學(xué)及表達(dá)特性研究[J]. 薛蓓蓓,覃麗芳,董明右,李有志,樊憲偉. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019(01)
[3]蘋果糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因MdSWEET17的功能鑒定[J]. 楊官顯,許海峰,張靜,王楠,房鴻成,鄒琦,王意程,姜生輝,陳學(xué)森. 植物生理學(xué)報(bào). 2018(11)
[4]番茄果實(shí)成熟過程中SlSWEET7a的功能分析[J]. 程杰,張新圣,李安琪,姜晶. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(15)
[5]鳳梨釋迦總RNA提取方法探究及質(zhì)量分析[J]. 安振宇,方仁,黃偉雄,堯金燕,龍興,張繼,鄧彪,周雙云,唐文忠,何新華. 分子植物育種. 2018(05)
[6]木薯SWEET1基因的分子克隆、亞細(xì)胞定位與功能分析[J]. 劉秦,馬暢,馮世鵬,唐枝娟,陳銀華,羅麗娟,牛曉磊. 分子植物育種. 2017(07)
[7]植物中SWEET基因家族研究進(jìn)展[J]. 劉暢,姜晶,韓曉雪,韓佳軒. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(09)
本文編號(hào):3539283
【文章來源】:熱帶作物學(xué)報(bào). 2020,41(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
SWEET蛋白與其他物種SWEET蛋白同源序列分析
分析番荔枝AT-SWEET16-1基因在不同組織中的表達(dá)情況,結(jié)果見圖6和圖7,番荔枝AT-SWEET16-1基因在根、莖、嫩葉、老葉、花蕾、幼果、成熟果中均有表達(dá),不同組織間表達(dá)量存在明顯不同,但差異不顯著,在成熟果、莖的表達(dá)量均比其他組織高,其中,在成熟果中的表達(dá)量最高,在嫩葉組織中表達(dá)量最低,成熟果中的表達(dá)量是幼果表達(dá)量的4倍多,是嫩葉表達(dá)量的5倍多。AT-SWEET16-1基因在果實(shí)不同發(fā)育階段不同部位的表達(dá)情況見圖7,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在果實(shí)成熟期果柄的表達(dá)量明顯比其他果實(shí)發(fā)育時(shí)期的其他組織部位高,AT-SWEET16-1基因在花后140 d果實(shí)的果柄表達(dá)量最高,在果實(shí)種子中的最高表達(dá)量是在花后90 d。AT-SWEET16-1基因在番荔枝果實(shí)的不同部位的表達(dá)情況為:果柄>果肉>果皮>種子。
AT-SWEET16-1基因在果實(shí)不同發(fā)育階段不同部位的表達(dá)情況見圖7,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在果實(shí)成熟期果柄的表達(dá)量明顯比其他果實(shí)發(fā)育時(shí)期的其他組織部位高,AT-SWEET16-1基因在花后140 d果實(shí)的果柄表達(dá)量最高,在果實(shí)種子中的最高表達(dá)量是在花后90 d。AT-SWEET16-1基因在番荔枝果實(shí)的不同部位的表達(dá)情況為:果柄>果肉>果皮>種子。2.6 原位雜交
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SWEET轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在作物中的功能研究及前景展望[J]. 李艷嬌,李文才,孫琦,趙勐,李文蘭,于彥麗,孟昭東. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(06)
[2]木薯SWEETs基因家族生物信息學(xué)及表達(dá)特性研究[J]. 薛蓓蓓,覃麗芳,董明右,李有志,樊憲偉. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019(01)
[3]蘋果糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因MdSWEET17的功能鑒定[J]. 楊官顯,許海峰,張靜,王楠,房鴻成,鄒琦,王意程,姜生輝,陳學(xué)森. 植物生理學(xué)報(bào). 2018(11)
[4]番茄果實(shí)成熟過程中SlSWEET7a的功能分析[J]. 程杰,張新圣,李安琪,姜晶. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(15)
[5]鳳梨釋迦總RNA提取方法探究及質(zhì)量分析[J]. 安振宇,方仁,黃偉雄,堯金燕,龍興,張繼,鄧彪,周雙云,唐文忠,何新華. 分子植物育種. 2018(05)
[6]木薯SWEET1基因的分子克隆、亞細(xì)胞定位與功能分析[J]. 劉秦,馬暢,馮世鵬,唐枝娟,陳銀華,羅麗娟,牛曉磊. 分子植物育種. 2017(07)
[7]植物中SWEET基因家族研究進(jìn)展[J]. 劉暢,姜晶,韓曉雪,韓佳軒. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(09)
本文編號(hào):3539283
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