異胡豆苷合成酶基因STR編碼吲哚類生物堿合成的關鍵酶異胡豆苷合成酶,并參與植物抗逆和花粉發(fā)育等生物過程。本研究通過對鐵皮石斛異胡豆苷合成酶基因DoSTR的結(jié)構(gòu)及特異性表達進行分析,探究其在鐵皮石斛生長發(fā)育中的潛在功能。從鐵皮石斛基因組數(shù)據(jù)中獲得鐵皮石斛異胡豆苷合成酶編碼序列（DoSTRs）,利用ClustalW軟件進行氨基酸序列的比對,利用Gene Structure Display Server 2. 0在線軟件分析基因內(nèi)含子和外顯子結(jié)構(gòu),利用PlantCARE數(shù)據(jù)庫分析基因啟動子區(qū)元件;基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和qRT-PCR對鐵皮石斛根莖葉組織、共生與非共生生長的種子和根、冷誘導和茉莉酸甲酯誘導后葉片中的STR家族基因的表達情況進行檢測和分析,從鐵皮石斛基因組中預測獲得10個STR成員,具有典型的"Str_synth"結(jié)構(gòu)域,且啟動子區(qū)存在大量順式作用元件,涉及到茉莉酸甲酯響應和低溫響應等多個生物學過程;DoSTRs基因家族不同成員表達模式存在較大差異,DoSTR3、DoSTR7、DoSTR10在葉片中的表達量高于莖和根中,DoSTR9和DoSTR2在鐵皮石斛種子萌發(fā)時... 

【文章來源】：生物資源. 2020,42(04)

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

鐵皮石斛DoSTRs蛋白序列與其他植物中STR蛋白序列比對結(jié)果

以四年生鐵皮石斛苗根、莖、葉組織為材料，以18s rDNA為內(nèi)參基因（表3），進行qRT‐PCR試驗，分析DoSTR家族成員在不同組織中的表達情況。試驗結(jié)果如圖6所示，DoSTR3、DoSTR7和DoSTR10基因在葉中的相對表達量較高，DoSTR2和DoSTR5基因在根中的相對表達量較高，DoSTR8基因在莖中的相對表達量較高。圖3 鐵皮石斛STR家族啟動子預測

鐵皮石斛STR家族啟動子預測

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3535571