番茄果實硬度基因FIS1的圖位克隆及功能分析
發(fā)布時間:2021-12-09 23:58
果實硬度是番茄重要的品質(zhì)性狀,與果實耐壓、耐裂、耐儲性密切相關(guān)。果實硬度作為復(fù)雜的數(shù)量性狀,受到多種因素的影響。盡管已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)十個果實硬度QTLs,但鮮有果實硬度基因被克隆。雖然生產(chǎn)中利用番茄成熟突變體可以通過延遲果實成熟提高果實硬度,但極大地損害了番茄口感和風(fēng)味。因此,克隆控制果實硬度的基因?qū)τ诟哂捕确训挠N選擇和改良利用具有重要意義。本研究以栽培番茄Moneymaker(MM)和櫻桃番茄LA1310(CC)為親本構(gòu)建的RILs群體為材料,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析,挖掘了一個控制番茄果實硬度的關(guān)鍵QTL,qFIRM SKIN 1(qFIS1)。通過近等基因系(Near-isogenic Lines,NILs),發(fā)現(xiàn)qFIS1通過影響果皮角質(zhì)層的厚度來調(diào)控果實硬度,對果實發(fā)育和成熟進程以及糖、酸等風(fēng)味物質(zhì)的積累都沒有影響。利用近等基因系群體,將該位點定位于第10號染色體17.8kb的區(qū)間內(nèi),Solyc10g007570為果實硬度基因FIS1的候選基因。在MM中,該基因外顯子上一個堿基的插入,導(dǎo)致其編碼蛋白提前終止。利用CRISPR/Cas9獲得的該基因的突變株系和互補轉(zhuǎn)基因株系證明了該...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
番茄果實發(fā)育過程(GIOVANNONI,2004)
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文第一章緒論3木葡聚糖由木葡聚糖轉(zhuǎn)糖基酶(XETs)催化β-1,4-糖苷鍵斷裂,使木葡聚糖鏈縮短,使半纖維素解聚,細胞壁變保圖1-2細胞壁降解示意圖(PIRRELLOetal.,2009)Fig.1-2Schematicrepresentationofthecellwalldegradation(PIRRELLO,etal.,2009)多聚半乳糖醛酸酶(PG)是水解果膠的關(guān)鍵酶之一。PG將多聚α-1,4-半乳糖醛酸聚糖水解,引起果膠分子的多糖主鏈斷裂,可溶性果膠含量增加。前人已經(jīng)在番茄、草莓、香蕉等多種水果和蔬菜的果實中檢測到PG的活性,且發(fā)現(xiàn)這些果實的軟化均與PG活性呈正相關(guān)(XUEetal.,2006;葉志彪等.,1994;莊軍平等.,2009)。番茄正常成熟時硬度迅速下降,而PG活性迅速上升,而在番茄果實成熟突變體nor中,在果實成熟階段并未檢測到PG活性(KUMARetal.,2018)。研究發(fā)現(xiàn),番茄果實中有三種PG的同工酶,其中PG1在果實成熟早期起主要作用,而PG2a和PG2b在果實成熟后期發(fā)揮關(guān)鍵作用。果膠甲酯酶(PME)的作用是水解果膠分子上修飾半乳糖醛酸的甲基,同時釋放出H+,降低了局部微環(huán)境的pH,激發(fā)多種細胞壁水解酶的活性,從而增加果膠分子的溶解度。有研究指出,PME的催化作用為PG發(fā)揮作用的前提。PME的活性隨著果實的成熟而有所增加(WANG,etal.,2018)。果膠裂解酶(PL)能切斷α-1,4-糖苷鍵使果膠大分子降解,此外,果膠裂解酶還可以使多聚半乳糖醛酸降解(MARIN-RODRIGUEZetal.,2002;WILLATS,etal.,2001)。果膠裂解酶(PL)首先在微生物中被發(fā)現(xiàn),植物中最早在花粉中發(fā)現(xiàn)了PL的活性。PL能使花粉管細胞壁疏松,促進花粉萌發(fā)(TANIGUCHIetal.,1995;WINGetal.,1990)。目前在多種水果果實成熟過程中發(fā)現(xiàn)了PL酶活性。芒果中的PL特異的在成熟果實中表達,而在其他組織中不表達(CHOURASIAetal.,
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文第一章緒論5醇形成途徑被修飾成初級醇和蠟質(zhì)酯。烷烴可進一步被中鏈烷烴羥化酶(MAH1/CYP96A15)催化,該酶可以氧化烷烴生成仲醇和酮(GREERetal.,2007)。角質(zhì)層組分在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(Endoplasmicreticulum,ER)上被合成后需要轉(zhuǎn)運至質(zhì)膜(plasmamembrane,PM)上,再通過質(zhì)膜和細胞壁到達植物表面。角質(zhì)層組分穿過質(zhì)膜可以通過兩種機制:(1)通過質(zhì)膜上的轉(zhuǎn)運子CER5/ABCG12和ABCG11形成的同源或異源二聚體;(2)通過胞吐作用(KUNSTandSAMUELS,2003)。近年來研究發(fā)現(xiàn)位于PM上的糖基磷脂酰肌醇(GPI)-錨定脂質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白LTPG1和LTPG2參與角質(zhì)層蠟質(zhì)的分泌(KIMetal.,2012;KUNSTandSAMUELS,2003),但是其分子機理仍不清楚。圖1-3果實表皮角質(zhì)單體和蠟質(zhì)組分的生物合成途徑(YEATSandROSE,2013)Fig.1-3Biosyntheticpathwaysforcutinmonomersandwaxconstituentsinthefruitepidermis(YEATSandROSE,2013)1.2.2.3番茄果實成熟過程中角質(zhì)層的變化角質(zhì)層的結(jié)構(gòu)和組分在番茄果實成熟過程中是不斷變化和積累的(圖1-4)。從番茄綠熟期到紅熟期過程中,盡管構(gòu)成角質(zhì)的長鏈脂肪酸含量會減少,但三萜類物質(zhì)的增加彌補了這種減少,使得角質(zhì)含量基本不變。而蠟質(zhì)的含量在不斷積累,栽培番茄‘MicoTom’從綠熟期到紅熟期,蠟質(zhì)含量會不斷增加(LEIDEetal.,2007a)。角質(zhì)和蠟質(zhì)組分和含量的改變,最終影響了角質(zhì)層的結(jié)構(gòu)和厚度,從而影響果實硬度。此外,番茄果實成熟過程中多種類黃酮化合物在外果皮積累(VERHOEYENetal.,2002),其中最主要的是柚皮苷查爾酮,大約占紅熟期外果皮干重的1%(MUIRetal.,2001)。柚皮苷查爾酮不僅使角質(zhì)層呈現(xiàn)橙色,而且賦予了角質(zhì)層一定的機械強度和韌性(ESPANAetal.,2014)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]新中國成立70年來植物激素研究進展[J]. 黎家,李傳友. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2019(10)
[2]利用Solanum pennellii LA0716漸滲系群體初步定位番茄果實硬度QTL[J]. 劉磊,宋燕,鄭崢,李君明. 植物遺傳資源學(xué)報. 2015(02)
[3]采前噴布水楊酸(SA)和赤霉素(GA3)對采后貢柑果實生理及貯藏效果的影響[J]. 馬培恰,吳文,唐小浪,黃永敬,魏岳榮. 果樹學(xué)報. 2009(06)
[4]香蕉果實后熟過程中果肉軟化差異的研究[J]. 莊軍平,李雪萍,陳維信. 西北植物學(xué)報. 2009(05)
[5]番茄不成熟基因nor的AFLP分子標記研究進展[J]. 田波濤,李景富,許向陽. 中國瓜菜. 2009(03)
[6]赤霉素處理促進白菜開花的效應(yīng)分析[J]. 侯雷平,王麗,李梅蘭. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2009(06)
[7]草莓果實發(fā)育成熟過程中糖苷酶和纖維素酶活性及細胞壁組成變化[J]. 薛炳燁,毛志泉,束懷瑞. 植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報. 2006(03)
[8]赤霉素在蔬菜生產(chǎn)上的應(yīng)用[J]. 喬廣海,劉洪錄,高富. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2005(04)
[9]番茄成熟突變體果實貯藏過程中細胞超微結(jié)構(gòu)的變化[J]. 張玉,許向陽,李景富. 園藝學(xué)報. 2005(04)
[10]GA3處理對番茄采后耐貯性及品質(zhì)的影響[J]. 周會玲,李維. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2002(03)
本文編號:3531544
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
番茄果實發(fā)育過程(GIOVANNONI,2004)
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文第一章緒論3木葡聚糖由木葡聚糖轉(zhuǎn)糖基酶(XETs)催化β-1,4-糖苷鍵斷裂,使木葡聚糖鏈縮短,使半纖維素解聚,細胞壁變保圖1-2細胞壁降解示意圖(PIRRELLOetal.,2009)Fig.1-2Schematicrepresentationofthecellwalldegradation(PIRRELLO,etal.,2009)多聚半乳糖醛酸酶(PG)是水解果膠的關(guān)鍵酶之一。PG將多聚α-1,4-半乳糖醛酸聚糖水解,引起果膠分子的多糖主鏈斷裂,可溶性果膠含量增加。前人已經(jīng)在番茄、草莓、香蕉等多種水果和蔬菜的果實中檢測到PG的活性,且發(fā)現(xiàn)這些果實的軟化均與PG活性呈正相關(guān)(XUEetal.,2006;葉志彪等.,1994;莊軍平等.,2009)。番茄正常成熟時硬度迅速下降,而PG活性迅速上升,而在番茄果實成熟突變體nor中,在果實成熟階段并未檢測到PG活性(KUMARetal.,2018)。研究發(fā)現(xiàn),番茄果實中有三種PG的同工酶,其中PG1在果實成熟早期起主要作用,而PG2a和PG2b在果實成熟后期發(fā)揮關(guān)鍵作用。果膠甲酯酶(PME)的作用是水解果膠分子上修飾半乳糖醛酸的甲基,同時釋放出H+,降低了局部微環(huán)境的pH,激發(fā)多種細胞壁水解酶的活性,從而增加果膠分子的溶解度。有研究指出,PME的催化作用為PG發(fā)揮作用的前提。PME的活性隨著果實的成熟而有所增加(WANG,etal.,2018)。果膠裂解酶(PL)能切斷α-1,4-糖苷鍵使果膠大分子降解,此外,果膠裂解酶還可以使多聚半乳糖醛酸降解(MARIN-RODRIGUEZetal.,2002;WILLATS,etal.,2001)。果膠裂解酶(PL)首先在微生物中被發(fā)現(xiàn),植物中最早在花粉中發(fā)現(xiàn)了PL的活性。PL能使花粉管細胞壁疏松,促進花粉萌發(fā)(TANIGUCHIetal.,1995;WINGetal.,1990)。目前在多種水果果實成熟過程中發(fā)現(xiàn)了PL酶活性。芒果中的PL特異的在成熟果實中表達,而在其他組織中不表達(CHOURASIAetal.,
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文第一章緒論5醇形成途徑被修飾成初級醇和蠟質(zhì)酯。烷烴可進一步被中鏈烷烴羥化酶(MAH1/CYP96A15)催化,該酶可以氧化烷烴生成仲醇和酮(GREERetal.,2007)。角質(zhì)層組分在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(Endoplasmicreticulum,ER)上被合成后需要轉(zhuǎn)運至質(zhì)膜(plasmamembrane,PM)上,再通過質(zhì)膜和細胞壁到達植物表面。角質(zhì)層組分穿過質(zhì)膜可以通過兩種機制:(1)通過質(zhì)膜上的轉(zhuǎn)運子CER5/ABCG12和ABCG11形成的同源或異源二聚體;(2)通過胞吐作用(KUNSTandSAMUELS,2003)。近年來研究發(fā)現(xiàn)位于PM上的糖基磷脂酰肌醇(GPI)-錨定脂質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白LTPG1和LTPG2參與角質(zhì)層蠟質(zhì)的分泌(KIMetal.,2012;KUNSTandSAMUELS,2003),但是其分子機理仍不清楚。圖1-3果實表皮角質(zhì)單體和蠟質(zhì)組分的生物合成途徑(YEATSandROSE,2013)Fig.1-3Biosyntheticpathwaysforcutinmonomersandwaxconstituentsinthefruitepidermis(YEATSandROSE,2013)1.2.2.3番茄果實成熟過程中角質(zhì)層的變化角質(zhì)層的結(jié)構(gòu)和組分在番茄果實成熟過程中是不斷變化和積累的(圖1-4)。從番茄綠熟期到紅熟期過程中,盡管構(gòu)成角質(zhì)的長鏈脂肪酸含量會減少,但三萜類物質(zhì)的增加彌補了這種減少,使得角質(zhì)含量基本不變。而蠟質(zhì)的含量在不斷積累,栽培番茄‘MicoTom’從綠熟期到紅熟期,蠟質(zhì)含量會不斷增加(LEIDEetal.,2007a)。角質(zhì)和蠟質(zhì)組分和含量的改變,最終影響了角質(zhì)層的結(jié)構(gòu)和厚度,從而影響果實硬度。此外,番茄果實成熟過程中多種類黃酮化合物在外果皮積累(VERHOEYENetal.,2002),其中最主要的是柚皮苷查爾酮,大約占紅熟期外果皮干重的1%(MUIRetal.,2001)。柚皮苷查爾酮不僅使角質(zhì)層呈現(xiàn)橙色,而且賦予了角質(zhì)層一定的機械強度和韌性(ESPANAetal.,2014)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]新中國成立70年來植物激素研究進展[J]. 黎家,李傳友. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2019(10)
[2]利用Solanum pennellii LA0716漸滲系群體初步定位番茄果實硬度QTL[J]. 劉磊,宋燕,鄭崢,李君明. 植物遺傳資源學(xué)報. 2015(02)
[3]采前噴布水楊酸(SA)和赤霉素(GA3)對采后貢柑果實生理及貯藏效果的影響[J]. 馬培恰,吳文,唐小浪,黃永敬,魏岳榮. 果樹學(xué)報. 2009(06)
[4]香蕉果實后熟過程中果肉軟化差異的研究[J]. 莊軍平,李雪萍,陳維信. 西北植物學(xué)報. 2009(05)
[5]番茄不成熟基因nor的AFLP分子標記研究進展[J]. 田波濤,李景富,許向陽. 中國瓜菜. 2009(03)
[6]赤霉素處理促進白菜開花的效應(yīng)分析[J]. 侯雷平,王麗,李梅蘭. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2009(06)
[7]草莓果實發(fā)育成熟過程中糖苷酶和纖維素酶活性及細胞壁組成變化[J]. 薛炳燁,毛志泉,束懷瑞. 植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報. 2006(03)
[8]赤霉素在蔬菜生產(chǎn)上的應(yīng)用[J]. 喬廣海,劉洪錄,高富. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2005(04)
[9]番茄成熟突變體果實貯藏過程中細胞超微結(jié)構(gòu)的變化[J]. 張玉,許向陽,李景富. 園藝學(xué)報. 2005(04)
[10]GA3處理對番茄采后耐貯性及品質(zhì)的影響[J]. 周會玲,李維. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2002(03)
本文編號:3531544
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