甘藍型油菜橘紅花瓣轉(zhuǎn)錄組分析及花青素代謝途徑相關基因研究
發(fā)布時間:2021-11-28 17:18
甘藍型油菜(Brassica napus L.)是世界上第三大油料作物,同時,油菜花期長、花鮮艷,具有較好的觀賞價值。傳統(tǒng)油菜品種一般為鮮黃色花瓣,花色單一,不能滿足開發(fā)油菜花色觀賞旅游的需求。研究人員在油菜育種過程中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)一些花色突變體,如金黃、乳黃、檸檬黃、桔紅、白、乳白、黃白嵌合體和微紫絲白花等,如果能利用這些突變體培育出穩(wěn)定遺傳且不影響產(chǎn)量的多彩油菜花新品種,將有效提升油菜觀光旅游的價值,提高油菜產(chǎn)區(qū)農(nóng)民的收入。然而目前未見油菜花色基因鑒定及其功能分析的研究報道。本研究通過對橘紅花色品系R03與黃色花品系ZS11材料進行轉(zhuǎn)錄組測序分析,篩選到13個與花青素代謝途徑相關的候選基因;對其中7個候選基因進行同源克隆,并對克隆所得序列進行生物信息學分析;最終構建了這些候選基因的6個超量表達載體,通過瞬時表達煙草葉片與轉(zhuǎn)化擬南芥植株驗證候選基因的基本生物學功能。主要研究結果如下:1.橘紅/黃色花品系甘藍型油菜轉(zhuǎn)錄組學分析對橘紅花品系R03與黃色花品系ZS11材料變色前(S1)與變色后(S2)兩個時期的花瓣進行轉(zhuǎn)錄組測序。在閾值參數(shù)P-value≤0.001、差異倍數(shù)|log2(Fold...
【文章來源】:西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
禹式三角所示的6個蕓苔屬物種間的細胞遺傳學關系
第1章文獻綜述5生物堿包括甜菜堿、罌粟堿和小檗堿等,含有負氧化態(tài)氮原子,環(huán)狀結構,是氨基酸次生代謝產(chǎn)物,屬水溶性吡啶衍生物(吳壽金等,2002)。甜菜堿分布在除石竹科(Caryophyllaceae)和栗米草科(Molluginacea)以外的石竹目(Cryophyllales)植物中,如仙人掌科(Cactaceae)和商陸科(Phytolaccaceae)等植物(何小玲等,1998),在石竹目植物中,甜菜堿和花青素不同時存在(Tanakaetal.2008);罌粟屬(Papaver)和綠絨蒿屬(Meconopsis)植物中,在罌粟堿的作用下使其花器官呈現(xiàn)為黃色;小檗堿即黃連素,使小檗屬(Berberis)的花器官呈現(xiàn)為深澄色或黃色(何小玲等,1998;Tanakaetal.1998;鄭志亮,1994;張石寶等,2001)。1.2.3花青素代謝通路1.2.3.1花青素的結構花青素以3,5,7-三羥基-2-苯基苯(并)吡喃钅羊鹽(三羥基黃钅羊鹽,trihydroxyflavylium)為基本骨架(圖1-2)。花青素苷元主由兩個芳香環(huán)(A環(huán)和B環(huán))和一個雜環(huán)(C環(huán))相連而成。母核苯環(huán)B環(huán)上羥基的種類(如羥基、甲氧基)、數(shù)目及取代位置不同,形成的花青素種類不同,導致最終呈色不同,如羥基數(shù)目越多,則呈現(xiàn)的顏色越向藍色偏移(Hondaetal.2002)。而A、C環(huán)的基本結構一致,均具有3,5,7-三羥基-2-苯基苯并芘,由于氧上面帶有的質(zhì)子增加了整個結構的不穩(wěn)定性,故需修飾以增強其穩(wěn)定性。而修飾作用、溶液環(huán)境和花青素二維堆積均會導致花青素顏色的變化(謝燁等,2013)。由于花青素含有較多羥基數(shù)目,使其具有良好的水溶性,所以很多植物中含水較多的組織(花、果實)中會富含花青素而表現(xiàn)為深紅色、橘紅色、紫色以及藍色。圖1-23,5,7-三羥基-2-苯基苯(并)吡喃钅羊鹽Figure1-23,5,7-trihydroxy-2-phenylbenz-opyrylium
第1章文獻綜述7(Leucoanthocyanidinoxygenase/Anthocyanidinsynthase,LDOX/ANS)的氧化形成共軛結構,形成有顏色的花青素。圖1-3花青素生物合成途徑(Holton,1995;賈趙東等,2014)Figure1-3BiosynthesispathwayofAnthocyanin(Holton,1995;Jiaetal.2014)1.2.3.4花青素的轉(zhuǎn)運花青素作為類黃酮糖苷的一部分,一般在細胞質(zhì)內(nèi)合成,通過合成相關的酶利用蛋白-蛋白之間相互作用,形成大分子復合物錨定在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)膜上(Grotewold,2006)。隨后在類黃酮3-O-糖苷轉(zhuǎn)移酶(Flavonoid3-O-glucosyltransferase,UFGT)的作用下,進一步進行甲基化、糖苷化和;揎棧纬筛鼜碗s的結構,經(jīng)修飾之后轉(zhuǎn)運到液泡內(nèi);ㄇ嗨氐霓D(zhuǎn)運機制一般有四種:(1)依賴谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶(GlutathioneS-Transferase,GST)與液泡膜上的多重藥物耐藥抗性聯(lián)結相關蛋白(Multidrugresistance-associated
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀、潛力及對策[J]. 劉成,馮中朝,肖唐華,馬曉敏,周廣生,黃鳳洪,李加納,王漢中. 中國油料作物學報. 2019(04)
[2]基于銀耳轉(zhuǎn)錄組測序的多糖代謝途徑分析[J]. 王東,牛蓓,宋君,趙樹海,雷紹榮,郭靈安,張富麗,劉文娟,常麗娟,趙黎明. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2019(06)
[3]甘藍型油菜桔黃花色基因的QTL-seq遺傳分析及InDel分子標記開發(fā)[J]. 丁戈,陳倫林,鄒小云,李書宇,熊潔,鄒曉芬,宋來強. 分子植物育種. 2019(12)
[4]彩花油菜的創(chuàng)建及遺傳育種進展[J]. 陳道宗,劉鎰,付文芹,葛賢宏,李再云. 中國油料作物學報. 2019(03)
[5]“十三五”以來中國油料及食用植物油供需形勢分析與展望[J]. 張雯麗. 農(nóng)業(yè)展望. 2018(11)
[6]油菜收獲指數(shù)研究進展[J]. 李加納,盧坤,薦紅舉,梁穎,陸軍花,彭柳,申鴿子,張燁,張超,楊博,張莉. 中國油料作物學報. 2018(05)
[7]以新需求為導向的油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略[J]. 王漢中. 中國油料作物學報. 2018(05)
[8]大豆市場政策干預對大豆國際價格的影響[J]. 王文亭,衛(wèi)龍寶,王倩倩. 中國農(nóng)村經(jīng)濟. 2018(09)
[9]甘藍型油菜種子發(fā)育灌漿后期的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 熊輝巖,段瑞君,王瑞生,孟慶志. 分子植物育種. 2018(15)
[10]甘藍型油菜白花性狀的遺傳規(guī)律[J]. 黃萌,張建棟,陳培峰,宋英,孫華. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(20)
博士論文
[1]甘藍型油菜種皮顏色基因的精細定位與種皮轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 洪美艷.華中農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]紅花草莓種質(zhì)創(chuàng)新及花色形成機理研究[D]. 薛莉.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]甘藍型油菜導入系構建、重要農(nóng)藝性狀QTL分析和白花基因克隆[D]. 張豹.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[4]中國油菜產(chǎn)業(yè)安全研究[D]. 王璐.華中農(nóng)業(yè)大學 2014
[5]金花茶花色相關基因的克隆及其功能研究[D]. 周興文.中國林業(yè)科學研究院 2012
[6]甘藍型油菜異源白花性狀的遺傳及相關基因的克隆與分析[D]. 田露申.四川農(nóng)業(yè)大學 2011
[7]藍色花形成關鍵基因的分離及其表達分析[D]. 孟麗.北京林業(yè)大學 2006
碩士論文
[1]甘藍型油菜種皮木質(zhì)素合成相關基因的差異表達分析[D]. 丁憶然.西南大學 2019
[2]甘藍型油菜不同花色轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 吳寧柔.湖南農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]大花君子蘭查爾酮合酶和黃烷酮-3-羥化酶基因的克隆及其功能驗證[D]. 敖鋒.東北師范大學 2016
[4]甘藍型油菜桔紅花色基因和心葉紫色基因的初步定位[D]. 淡亞彬.青海大學 2016
[5]紅掌轉(zhuǎn)錄組測序及花青素生物合成途徑差異表達基因的分析[D]. 彭佳佳.寧夏大學 2015
[6]花色基因Delila轉(zhuǎn)化葡萄風信子的研究[D]. 許勝.西北農(nóng)林科技大學 2007
[7]甘藍型油菜及其親本物種TT12基因家族的克隆與比較基因組學研究[D]. 黃華磊.西南大學 2007
本文編號:3524831
【文章來源】:西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
禹式三角所示的6個蕓苔屬物種間的細胞遺傳學關系
第1章文獻綜述5生物堿包括甜菜堿、罌粟堿和小檗堿等,含有負氧化態(tài)氮原子,環(huán)狀結構,是氨基酸次生代謝產(chǎn)物,屬水溶性吡啶衍生物(吳壽金等,2002)。甜菜堿分布在除石竹科(Caryophyllaceae)和栗米草科(Molluginacea)以外的石竹目(Cryophyllales)植物中,如仙人掌科(Cactaceae)和商陸科(Phytolaccaceae)等植物(何小玲等,1998),在石竹目植物中,甜菜堿和花青素不同時存在(Tanakaetal.2008);罌粟屬(Papaver)和綠絨蒿屬(Meconopsis)植物中,在罌粟堿的作用下使其花器官呈現(xiàn)為黃色;小檗堿即黃連素,使小檗屬(Berberis)的花器官呈現(xiàn)為深澄色或黃色(何小玲等,1998;Tanakaetal.1998;鄭志亮,1994;張石寶等,2001)。1.2.3花青素代謝通路1.2.3.1花青素的結構花青素以3,5,7-三羥基-2-苯基苯(并)吡喃钅羊鹽(三羥基黃钅羊鹽,trihydroxyflavylium)為基本骨架(圖1-2)。花青素苷元主由兩個芳香環(huán)(A環(huán)和B環(huán))和一個雜環(huán)(C環(huán))相連而成。母核苯環(huán)B環(huán)上羥基的種類(如羥基、甲氧基)、數(shù)目及取代位置不同,形成的花青素種類不同,導致最終呈色不同,如羥基數(shù)目越多,則呈現(xiàn)的顏色越向藍色偏移(Hondaetal.2002)。而A、C環(huán)的基本結構一致,均具有3,5,7-三羥基-2-苯基苯并芘,由于氧上面帶有的質(zhì)子增加了整個結構的不穩(wěn)定性,故需修飾以增強其穩(wěn)定性。而修飾作用、溶液環(huán)境和花青素二維堆積均會導致花青素顏色的變化(謝燁等,2013)。由于花青素含有較多羥基數(shù)目,使其具有良好的水溶性,所以很多植物中含水較多的組織(花、果實)中會富含花青素而表現(xiàn)為深紅色、橘紅色、紫色以及藍色。圖1-23,5,7-三羥基-2-苯基苯(并)吡喃钅羊鹽Figure1-23,5,7-trihydroxy-2-phenylbenz-opyrylium
第1章文獻綜述7(Leucoanthocyanidinoxygenase/Anthocyanidinsynthase,LDOX/ANS)的氧化形成共軛結構,形成有顏色的花青素。圖1-3花青素生物合成途徑(Holton,1995;賈趙東等,2014)Figure1-3BiosynthesispathwayofAnthocyanin(Holton,1995;Jiaetal.2014)1.2.3.4花青素的轉(zhuǎn)運花青素作為類黃酮糖苷的一部分,一般在細胞質(zhì)內(nèi)合成,通過合成相關的酶利用蛋白-蛋白之間相互作用,形成大分子復合物錨定在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)膜上(Grotewold,2006)。隨后在類黃酮3-O-糖苷轉(zhuǎn)移酶(Flavonoid3-O-glucosyltransferase,UFGT)的作用下,進一步進行甲基化、糖苷化和;揎棧纬筛鼜碗s的結構,經(jīng)修飾之后轉(zhuǎn)運到液泡內(nèi);ㄇ嗨氐霓D(zhuǎn)運機制一般有四種:(1)依賴谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶(GlutathioneS-Transferase,GST)與液泡膜上的多重藥物耐藥抗性聯(lián)結相關蛋白(Multidrugresistance-associated
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀、潛力及對策[J]. 劉成,馮中朝,肖唐華,馬曉敏,周廣生,黃鳳洪,李加納,王漢中. 中國油料作物學報. 2019(04)
[2]基于銀耳轉(zhuǎn)錄組測序的多糖代謝途徑分析[J]. 王東,牛蓓,宋君,趙樹海,雷紹榮,郭靈安,張富麗,劉文娟,常麗娟,趙黎明. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2019(06)
[3]甘藍型油菜桔黃花色基因的QTL-seq遺傳分析及InDel分子標記開發(fā)[J]. 丁戈,陳倫林,鄒小云,李書宇,熊潔,鄒曉芬,宋來強. 分子植物育種. 2019(12)
[4]彩花油菜的創(chuàng)建及遺傳育種進展[J]. 陳道宗,劉鎰,付文芹,葛賢宏,李再云. 中國油料作物學報. 2019(03)
[5]“十三五”以來中國油料及食用植物油供需形勢分析與展望[J]. 張雯麗. 農(nóng)業(yè)展望. 2018(11)
[6]油菜收獲指數(shù)研究進展[J]. 李加納,盧坤,薦紅舉,梁穎,陸軍花,彭柳,申鴿子,張燁,張超,楊博,張莉. 中國油料作物學報. 2018(05)
[7]以新需求為導向的油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略[J]. 王漢中. 中國油料作物學報. 2018(05)
[8]大豆市場政策干預對大豆國際價格的影響[J]. 王文亭,衛(wèi)龍寶,王倩倩. 中國農(nóng)村經(jīng)濟. 2018(09)
[9]甘藍型油菜種子發(fā)育灌漿后期的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 熊輝巖,段瑞君,王瑞生,孟慶志. 分子植物育種. 2018(15)
[10]甘藍型油菜白花性狀的遺傳規(guī)律[J]. 黃萌,張建棟,陳培峰,宋英,孫華. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2017(20)
博士論文
[1]甘藍型油菜種皮顏色基因的精細定位與種皮轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 洪美艷.華中農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]紅花草莓種質(zhì)創(chuàng)新及花色形成機理研究[D]. 薛莉.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]甘藍型油菜導入系構建、重要農(nóng)藝性狀QTL分析和白花基因克隆[D]. 張豹.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[4]中國油菜產(chǎn)業(yè)安全研究[D]. 王璐.華中農(nóng)業(yè)大學 2014
[5]金花茶花色相關基因的克隆及其功能研究[D]. 周興文.中國林業(yè)科學研究院 2012
[6]甘藍型油菜異源白花性狀的遺傳及相關基因的克隆與分析[D]. 田露申.四川農(nóng)業(yè)大學 2011
[7]藍色花形成關鍵基因的分離及其表達分析[D]. 孟麗.北京林業(yè)大學 2006
碩士論文
[1]甘藍型油菜種皮木質(zhì)素合成相關基因的差異表達分析[D]. 丁憶然.西南大學 2019
[2]甘藍型油菜不同花色轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 吳寧柔.湖南農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]大花君子蘭查爾酮合酶和黃烷酮-3-羥化酶基因的克隆及其功能驗證[D]. 敖鋒.東北師范大學 2016
[4]甘藍型油菜桔紅花色基因和心葉紫色基因的初步定位[D]. 淡亞彬.青海大學 2016
[5]紅掌轉(zhuǎn)錄組測序及花青素生物合成途徑差異表達基因的分析[D]. 彭佳佳.寧夏大學 2015
[6]花色基因Delila轉(zhuǎn)化葡萄風信子的研究[D]. 許勝.西北農(nóng)林科技大學 2007
[7]甘藍型油菜及其親本物種TT12基因家族的克隆與比較基因組學研究[D]. 黃華磊.西南大學 2007
本文編號:3524831
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