油菜是世界四大油料作物之一,廣泛種植世界各處。油菜籽具有高含油量的特點,多用于菜籽油加工,其主要品質(zhì)包括含油量、脂肪酸構成和硫代葡萄糖苷含量（簡稱硫苷）。其中,硫苷是十字花科植物特有的一種次級代謝產(chǎn)物,具備多種生理功能,其代謝與生長素合成密切相關。另外,油菜種子幾乎不具有初生休眠能力,但具有不同程度的次生休眠能力。次生休眠指原來未休眠或解除休眠后的種子由于干旱等不適宜環(huán)境條件的影響而誘發(fā)的休眠,其主要危害是使油菜種子產(chǎn)生大量自生苗,繼而出現(xiàn)品質(zhì)下降、基因漂流、生物安全等問題。挖掘與主要品質(zhì)相關的次生休眠相關基因,可以為自生苗的減少尤其為轉基因油菜基因漂流引發(fā)的食品安全提供解決方案。本研究使用聚乙二醇（PEG）誘導法篩選到油菜品種V（次生休眠率>90%）和品種H（次生休眠率<5%）。之后利用強弱次生休眠品種（Vb和Hb）及其PEG誘導后的樣本（Va和Ha）進行了 RNA-seq測序,分離出了 998個差異表達基因,它們主要參與次級代謝、轉錄調(diào)控、蛋白修飾、信號轉導、氧化還原反應等過程。GO分析和KEGG通路分析發(fā)現(xiàn),在強休眠品種中,硫代謝、吲哚-硫苷合成、色氨酸代謝途徑明顯富... 

【文章來源】：揚州大學江蘇省

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－４利用ＭａｐＭａｎ軟件分析檢測到的基因參與的代謝（Ａ）及調(diào)控（Ｂ）途徑??彩色條表示Ｖａｖｓ?Ｈａ的丨ｏｇ２ＦＣ的平均數(shù)

和Ｖａ?ｖｓ?Ｈａ交集部分的差異基因，即在強次生休眠品種誘導前后和強弱品種誘導后均存在??明顯差異的基因為次生休眠相關的候選基因。由韋恩圖可見，該交集區(qū)域被分為四個小區(qū)??域（Ｉ－ＩＶ），分別包含４２８，?５丨３，?４３０和１２８３個基因（圖２－６）。但是，Ｉ，?ＩＩ區(qū)域中Ｈａ?ｖｓ?Ｈｂ基因??也存在明顯變化，所以對于這兩部分區(qū)域，我們關注Ｈａ?ｖｓ?Ｈｂ與Ｖａ?ｖｓ?Ｖｂ變化趨勢相反??的基因；ＩＩ丨和丨Ｖ區(qū)域中我們關注｜丨ｏｇ２（ＶａｖｓＶｂ）－丨ｏｇ２（ＨａｖｓＨｂ）丨２ｌ的基因．因此，經(jīng)過??第二輪篩選，該交集區(qū)域分別包含２５，?４４，丨１４和８１５個基因，總共９９８個差異基因（圖２－６?Ｂ）．??

２２３個基因下調(diào)�；冢梗梗競�差異基因表達模式的相似性和差異，我們對篩選出的??差異基因進行了聚類分析。熱圖清晰地展示了差異表達基因的聚類情況：上調(diào)表達的基因??聚類在熱圖下部，約是聚類在熱圖上部的下調(diào)表達基因的３倍（圖２－６?Ｃ）。綜上結果表明，??與弱休眠種子誘導后和強休眠種子處理前相比，在強休眠種子中，絕大多數(shù)基因是被誘導??表達的。??Ａ?Ｖａ?ｖｓ?Ｖｂ?ＶｂｖｓＨｂ?Ｂ?Ｖａ?ｖｓ?Ｖｂ?ＶｂｖｓＨｂ?＾??＾?ｍ?■??■??圖２－６次生休眠候選基因分離??（Ａ）基于標準丨ｌｏｇ２ＦＣ丨２ｌ且ｐ＿ｖａｌｕｅ５０．００１的韋恩圖展示次生休眠候選基因；（Ｂ）在第一輪篩選標準基??礎上，基于標準丨１〇§２（＼＾乂５＼＾））－１〇幻（１４３￥５冊）丨２１的韋恩圖展示次生休眠候選基因；（（］：）熱圖展示差??異表達基因的聚類情況。??Ｆｉｇｕｒｅ?２－６?Ｓｅｐａｒａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?ｄｏｒｍａｎｃｙ?ｃａｎｄｉｄａｔｅ?ｇｅｎｅｓ??（Ａ）?Ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ｔｈｅ?ｓｔａｎｄａｒｄ?｜ｌｏｇ２ＦＣ｜?＞?１?ａｎｄ?ｐ?ｖａｌｕｅ?＜?０．００１，?ｔｈｅ?Ｗａｙｎｅ?ｄｉａｇｒａｍ?ｓｈｏｗｓ?ｔｈｅ?ｓｅｃｏｎｄａｒｙ??ｄｏｒｍａｎｃｙ?ｃａｎｄｉｄａｔｅ?ｇｅｎｅ；?（Ｂ）?Ｂａｓｅｄ?ｏｎ?ｔｈｅ?ｆｉｒｓｔ?ｒｏｕｎｄ?ｏｆ?ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ?ｃｒｉｔｅｒｉａ

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]油菜和擬南芥中幾個硫代葡萄糖苷合成及調(diào)控基因的功能分析[D]. 張園園.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
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碩士論文
[1]油菜次生休眠特性與含油量、脂肪酸、硫苷的相關性研究[D]. 顧思凱.揚州大學 2017
[2]芝麻菜種子中硫代葡萄糖苷（Glucoerucin）的分離純化工藝研究[D]. 吳建朋.北京化工大學 2013
[3]ABS用抗氧劑乳液的制備及凝聚工藝研究[D]. 周一瓊.復旦大學 2013
[4]油料作物含油量差異原因的初步分析[D]. 王志慧.中南民族大學 2013
[5]延緩菜籽油儲存品質(zhì)劣變的技術研究[D]. 陳謹華.南京農(nóng)業(yè)大學 2012
[6]生物表面活性劑 NaDC 與其它表面活性劑相互作用的研究[D]. 吳同浩.山東師范大學 2011
[7]氨基酸對芥藍硫代葡萄糖苷組分及含量的影響[D]. 宋敏.南京農(nóng)業(yè)大學 2007



本文編號：3524652