【目的】探知小麥基因組序列中肌醇磷脂依賴的磷脂酶C（PLC）的編碼基因,解析小麥中PLC基因的結(jié)構(gòu)與進(jìn)化特征,揭示Ta PLC基因在小麥各組織中的表達(dá)模式及其響應(yīng)鹽脅迫和干旱脅迫過(guò)程中的表達(dá)規(guī)律,以便深入分析小麥Ta PLC基因調(diào)節(jié)小麥應(yīng)答鹽或干旱脅迫中的生理作用�！痉椒ā炕贓nsembl Plants全基因組數(shù)據(jù)庫(kù),以水稻和擬南芥PLC基因?yàn)閰⒖夹蛄?檢索小麥Ta PLC基因家族（http://plants.ensembl.org/index.html）,并利用在線蛋白結(jié)構(gòu)分析工具（Pfam、CDD和SMART）對(duì)TaPLC基因進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析和鑒定;運(yùn)用ExPASy（http://cn.expasy.org/tools）分析Ta PLC基因的分子和生化特征;使用Wo LF PSORT（https://www.genscript.com/wolf-psort.html）預(yù)測(cè)Ta PLC基因的亞細(xì)胞定位;運(yùn)用MEGA 7.0軟件進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析;并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析Ta PLC基因在不同組織以及幼苗期在鹽或干旱脅迫下的表達(dá)特征。【結(jié)果】在小麥基因組中鑒定了11個(gè)Ta PLC基因... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,53(24)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：68 頁(yè)

【部分圖文】：

小麥TaPLC蛋白質(zhì)的功能結(jié)構(gòu)域分析

為了進(jìn)一步了解TaPLC基因的發(fā)育關(guān)系，分析比較TaPLC基因的DNA序列和氨基酸序列的結(jié)構(gòu)，及其外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)。發(fā)現(xiàn)同一組的基因（如TaPLC2A/TaPLC2B/TaPLC2D）彼此之間不僅核酸序列和氨基酸序列相似性都達(dá)到98%以上（電子附表1），而且外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)也具有高度同一性（圖3),表明小麥TaPLC基因每組的部分同源基因是經(jīng)歷了基因復(fù)制而形成的。TaPLC2組的3個(gè)基因均有8個(gè)外顯子和7個(gè)內(nèi)含子，其他組的基因均有9個(gè)外顯子和8個(gè)內(nèi)含子，與目前發(fā)現(xiàn)的其他植物的PLC基因有著相似的剪接方式。圖3 TaPLC基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)和基序

圖2 PLC基因家族蛋白的系統(tǒng)發(fā)育分析利用MEME，在Ta PLC基因家族中找到了14個(gè)不同的motif（圖3-C）。親緣關(guān)系較近的成員具有相似的motif組合。Ta PLC基因共同具有10個(gè)motif,Ta PLC1A/Ta PLC1D特有motif 13,Ta PLC3A/Ta PLC3B/TaPLC3D特有motif 12,Ta PLC4A/TaPLC4B/TaPLC4D特有motif 13。14個(gè)motif的圖示和序列在電子附表3和電子附圖2中列出。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]水稻磷脂酰肌醇特異性磷脂酶C4（OsPLC4）調(diào)節(jié)水稻滲透脅迫響應(yīng)及生長(zhǎng)發(fā)育[D]. 鄧先俊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018



本文編號(hào)：3524227