小麥粒重QTL側(cè)翼標(biāo)記開發(fā)和粒型同源基因GLW7的結(jié)構(gòu)和表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-29 03:19
千粒重(Thousand Grain Weigh,TGW)是構(gòu)成小麥產(chǎn)量的三因素之一。本課題組先前利用西藏半野生小麥Q(jìng)1028(Q1028)和鄭麥9023(ZM9023)構(gòu)建的重組自交系(RIL)群體,鑒定出一個(gè)位于小麥2D染色體上控制千粒重的主效數(shù)量性狀基因座(Quantitative Trait Locus,QTL)(QTgw.sau-2D),該QTL的加性效應(yīng)來自鄭麥9023。本研究利用比較基因組學(xué)對(duì)QTgw.sau-2DQTL進(jìn)行分子標(biāo)記的開發(fā)和驗(yàn)證以及遺傳圖譜的密化,為QTL的精細(xì)定位及其分子輔助育種奠定了基礎(chǔ)。OsGLW7是在水稻中正向調(diào)節(jié)籽粒大小和粒重的重要基因。而我們對(duì)其在小麥中的同源基因TaGLW7知之甚少。本研究對(duì)TaGLW7基因進(jìn)行了基因結(jié)構(gòu)分析、蛋白結(jié)構(gòu)分析、進(jìn)化分析、啟動(dòng)子區(qū)域分析以及表達(dá)模式分析。此外,本研究對(duì)大麥(Hordeum vulgare,HvGLW7)、水稻(Oryza sativa,OsGLW7)、短柄草(Brachypodium distachyon,BdGLW7)、野生二粒小麥(Triticum turgidum,TtGLW7)、烏拉爾圖小麥...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
本實(shí)驗(yàn)用到的材料Fig.2-1Thematerialsusedinthisexperiment
確定千粒重的目標(biāo)區(qū)間在 478111860~585677005 范圍內(nèi),并且在目標(biāo)間內(nèi)總共檢測(cè)到 100 個(gè)基因(圖 2-2,附表 2-1)。經(jīng)過進(jìn)一步的篩選,得到了 32 個(gè)單拷貝基因用于檢測(cè) Q1028 和 ZM023 之間存在的多態(tài)性(圖 2-2;附表 2-2)。由于啟動(dòng)子序列多態(tài)性往往較高,本試驗(yàn)在各個(gè)基因編碼序列起始密碼子的 5’端前選擇了 1500bp 啟動(dòng)子序列來檢測(cè) 32 個(gè)基因在 Q1028 和 ZM9023 親本之間的多態(tài)性。最后選取了 11 個(gè)在“中國(guó)春”小麥的 2A、2B、2D 三條同源染色體中同源性較高的基因。
19圖2-3SCAR標(biāo)記的PCR的檢測(cè),“M”表示Maker,紅色框內(nèi)為目的片段Fig.2-3DetectionofSCARmarkersbyPCR,“M”standsforMaker,andtheredframeisthetargetsegment.2.3.3開發(fā)的HRM標(biāo)記本實(shí)驗(yàn)經(jīng)過對(duì)11個(gè)同源性較好的基因進(jìn)行克隆測(cè)序后發(fā)現(xiàn)3個(gè)基因具有多態(tài)性,總共檢測(cè)到了11個(gè)SNP(表2-2;圖2-3)。我們根據(jù)這些SNP設(shè)計(jì)了11對(duì)HRM引物(表S4),其中兩對(duì)引物(0C98-411、09AE-590)在Q1028和ZM9023兩個(gè)親本中檢測(cè)到了多態(tài)性(表2-3)。再利用這兩對(duì)HRM引物進(jìn)一步對(duì)Q1028和ZM9023的RIL群體進(jìn)行基因分型以構(gòu)建完整的遺傳圖譜。最終0C98-411標(biāo)記成功連鎖到了遺傳圖譜上(圖2-3)。
本文編號(hào):3463857
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
本實(shí)驗(yàn)用到的材料Fig.2-1Thematerialsusedinthisexperiment
確定千粒重的目標(biāo)區(qū)間在 478111860~585677005 范圍內(nèi),并且在目標(biāo)間內(nèi)總共檢測(cè)到 100 個(gè)基因(圖 2-2,附表 2-1)。經(jīng)過進(jìn)一步的篩選,得到了 32 個(gè)單拷貝基因用于檢測(cè) Q1028 和 ZM023 之間存在的多態(tài)性(圖 2-2;附表 2-2)。由于啟動(dòng)子序列多態(tài)性往往較高,本試驗(yàn)在各個(gè)基因編碼序列起始密碼子的 5’端前選擇了 1500bp 啟動(dòng)子序列來檢測(cè) 32 個(gè)基因在 Q1028 和 ZM9023 親本之間的多態(tài)性。最后選取了 11 個(gè)在“中國(guó)春”小麥的 2A、2B、2D 三條同源染色體中同源性較高的基因。
19圖2-3SCAR標(biāo)記的PCR的檢測(cè),“M”表示Maker,紅色框內(nèi)為目的片段Fig.2-3DetectionofSCARmarkersbyPCR,“M”standsforMaker,andtheredframeisthetargetsegment.2.3.3開發(fā)的HRM標(biāo)記本實(shí)驗(yàn)經(jīng)過對(duì)11個(gè)同源性較好的基因進(jìn)行克隆測(cè)序后發(fā)現(xiàn)3個(gè)基因具有多態(tài)性,總共檢測(cè)到了11個(gè)SNP(表2-2;圖2-3)。我們根據(jù)這些SNP設(shè)計(jì)了11對(duì)HRM引物(表S4),其中兩對(duì)引物(0C98-411、09AE-590)在Q1028和ZM9023兩個(gè)親本中檢測(cè)到了多態(tài)性(表2-3)。再利用這兩對(duì)HRM引物進(jìn)一步對(duì)Q1028和ZM9023的RIL群體進(jìn)行基因分型以構(gòu)建完整的遺傳圖譜。最終0C98-411標(biāo)記成功連鎖到了遺傳圖譜上(圖2-3)。
本文編號(hào):3463857
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