基于毒性相關(guān)基因序列的稻瘟病菌群體遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2021-10-24 19:06
選用16對毒性相關(guān)基因特異性引物對四川和重慶9個縣(市)分離到的200個稻瘟病菌單孢菌株進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并采用最長距離法進(jìn)行聚類分析,結(jié)果顯示各引物均能擴(kuò)增出其目的條帶,多態(tài)位點(diǎn)百分率(P)高達(dá)93.75%,擴(kuò)增頻率差異較大;200個菌株可歸為70個不同的單元型,其中單元型SCH13為優(yōu)勢單元型;在0.86遺傳相似水平上,200個菌株可劃分為27個遺傳宗譜,包括1個優(yōu)勢宗譜,3個亞優(yōu)勢宗譜,14個次要宗譜,9個小宗譜,層次豐富;在群體平均水平上,病菌群體具有豐富的遺傳多樣性(H=0.324 4,I=0.484 2),且群體間差異較大;9個種群在遺傳距離為0.05水平上可分為4個類群,種群遺傳譜系與地理區(qū)域分布呈一定相關(guān)性。同時,該地區(qū)的群體存在一定的遺傳分化(HT=0.320 0),群體內(nèi)多樣性大于群體間多樣性(Hs=0.179 6,Dst=0.140 4),總遺傳變異的56.13%存在于群體內(nèi)(Gst=0.438 7),群體間基因流動性較。∟m=0.639 6)。本研究揭示了四川和重慶部分區(qū)域稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性及其與地理分布之間的關(guān)系,為抗病育種和品種布局奠定了基礎(chǔ)。
【文章來源】:植物病理學(xué)報. 2016,46(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 供試菌株
1.2 菌絲體培養(yǎng)
1.3 病菌基因組DNA提取
1.4 引物的選擇及PCR檢測
1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 供試菌株的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.1.1致病基因特異性引物擴(kuò)增結(jié)果
2.1.2無毒基因特異性引物擴(kuò)增結(jié)果
2.2 稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)
2.2.1稻瘟病菌群體單元型分析
2.2.2稻瘟病菌群體遺傳宗譜分析
2.2.3稻瘟病菌遺傳結(jié)構(gòu)的地理分布特點(diǎn)
2.3 西南地區(qū)稻瘟病菌群體遺傳多樣性分析
2.3.1稻瘟病菌群體遺傳多樣性水平
2.3.2稻瘟病菌群體遺傳分化
2.4 西南地區(qū)稻瘟病菌群體間的聚類分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]遼寧省稻瘟病菌無毒基因型鑒定及分析[J]. 王世維,鄭文靜,趙家銘,魏松紅,王妍,趙寶海,劉志恒. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(03)
[2]研究稻瘟病菌群體遺傳多態(tài)性的分子標(biāo)記方法[J]. 穆慧敏,姜華,王艷麗,孫國昌. 中國水稻科學(xué). 2013(05)
[3]中國稻瘟病菌種群分布及優(yōu)勢生理小種的研究進(jìn)展[J]. 肖丹鳳,張佩勝,王玲,黃世文. 中國水稻科學(xué). 2013(03)
[4]云南省稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J]. 劉振華,李曉菲,王園媛,陳濤,王云月. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2013(01)
[5]黑龍江省稻瘟病菌無毒基因分析及抗病種質(zhì)資源篩選[J]. 李祥曉,王倩,羅生香,何云霞,朱苓華,周永力,黎志康. 作物學(xué)報. 2012(12)
[6]湖南稻瘟病菌遺傳多樣性分析[J]. 童建新,任佐華,劉毅雄,俞海,劉二明. 雜交水稻. 2012(03)
[7]云南省稻瘟病菌群體對稻瘟病抗性單基因系的致病性分析[J]. 董麗英,王群,劉樹芳,鄭鳳萍,李迅東,楊勤忠. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(02)
[8]長蛸(Octopus variabilis)不同地理群體遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 郭寶英,周超,呂振明,李繼姬,吳常文. 海洋與湖沼. 2011(06)
[9]用SSR標(biāo)記法對黑龍江省稻瘟菌無毒基因的檢測[J]. 張崎峰,靳學(xué)慧,蔡鑫鑫,鞏雙印,劉顯元. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2010(10)
[10]寧夏稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J]. 李文強(qiáng),王源超,鄭小波. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2008(04)
本文編號:3455818
【文章來源】:植物病理學(xué)報. 2016,46(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 供試菌株
1.2 菌絲體培養(yǎng)
1.3 病菌基因組DNA提取
1.4 引物的選擇及PCR檢測
1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 供試菌株的PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.1.1致病基因特異性引物擴(kuò)增結(jié)果
2.1.2無毒基因特異性引物擴(kuò)增結(jié)果
2.2 稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)
2.2.1稻瘟病菌群體單元型分析
2.2.2稻瘟病菌群體遺傳宗譜分析
2.2.3稻瘟病菌遺傳結(jié)構(gòu)的地理分布特點(diǎn)
2.3 西南地區(qū)稻瘟病菌群體遺傳多樣性分析
2.3.1稻瘟病菌群體遺傳多樣性水平
2.3.2稻瘟病菌群體遺傳分化
2.4 西南地區(qū)稻瘟病菌群體間的聚類分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]遼寧省稻瘟病菌無毒基因型鑒定及分析[J]. 王世維,鄭文靜,趙家銘,魏松紅,王妍,趙寶海,劉志恒. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(03)
[2]研究稻瘟病菌群體遺傳多態(tài)性的分子標(biāo)記方法[J]. 穆慧敏,姜華,王艷麗,孫國昌. 中國水稻科學(xué). 2013(05)
[3]中國稻瘟病菌種群分布及優(yōu)勢生理小種的研究進(jìn)展[J]. 肖丹鳳,張佩勝,王玲,黃世文. 中國水稻科學(xué). 2013(03)
[4]云南省稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J]. 劉振華,李曉菲,王園媛,陳濤,王云月. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2013(01)
[5]黑龍江省稻瘟病菌無毒基因分析及抗病種質(zhì)資源篩選[J]. 李祥曉,王倩,羅生香,何云霞,朱苓華,周永力,黎志康. 作物學(xué)報. 2012(12)
[6]湖南稻瘟病菌遺傳多樣性分析[J]. 童建新,任佐華,劉毅雄,俞海,劉二明. 雜交水稻. 2012(03)
[7]云南省稻瘟病菌群體對稻瘟病抗性單基因系的致病性分析[J]. 董麗英,王群,劉樹芳,鄭鳳萍,李迅東,楊勤忠. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(02)
[8]長蛸(Octopus variabilis)不同地理群體遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 郭寶英,周超,呂振明,李繼姬,吳常文. 海洋與湖沼. 2011(06)
[9]用SSR標(biāo)記法對黑龍江省稻瘟菌無毒基因的檢測[J]. 張崎峰,靳學(xué)慧,蔡鑫鑫,鞏雙印,劉顯元. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2010(10)
[10]寧夏稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J]. 李文強(qiáng),王源超,鄭小波. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2008(04)
本文編號:3455818
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