柑橘潰瘍病抗性SNP標(biāo)記驗(yàn)證及關(guān)聯(lián)基因表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-17 18:03
柑橘潰瘍病是由柑橘黃單胞菌柑橘亞種(Xanthomonas citri subsp.Citri.,,Xcc)引起的檢疫性病害之一,會(huì)導(dǎo)致落葉落果,甚至整樹枯死,嚴(yán)重影響世界柑橘產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展。培育抗病品種是防控柑橘潰瘍病最根本、最有效的方法。由于傳統(tǒng)的雜交育種方法育種效率低,轉(zhuǎn)基因柑橘的存在食品安全問題,所以亟待一種更高效、安全的育種方式。分子標(biāo)記輔助選擇(Marker-assisted Selection,MAS)是一種基于基因型選擇的育種方法,選擇準(zhǔn)確性高,不受環(huán)境條件影響,可極大地提高選擇效率,縮短育種年限。因此,開發(fā)與柑橘潰瘍病抗性關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記,對(duì)加快柑橘潰瘍病抗性品種選育具有重要意義。本研究室之前從金柑、四季桔、臺(tái)灣椪柑和紐荷爾的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中挖掘出170多個(gè)差異表達(dá)且存在單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)的激酶基因,并以100多個(gè)柑橘品種(自然群體)為材料進(jìn)行潰瘍抗性鑒定和SNP分型,通過關(guān)聯(lián)分析篩選到14個(gè)與柑橘潰瘍病抗性關(guān)聯(lián)的SNP。為進(jìn)一步驗(yàn)證這些SNP的準(zhǔn)確性,本研究將利用耐/感柑橘品種的雜交F1群體為材料,采用離...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
DNA分子1與DNA分子2在同一位點(diǎn)上堿基對(duì)不同F(xiàn)ig.1DifferentsinglebasepairatthesamesiteoftwoDNAmolecules.
西南大學(xué)碩士學(xué)位論文26 第4章結(jié)果與分析4.1F1群體潰瘍病抗性鑒定采用針刺接種法對(duì)143個(gè)供試材料進(jìn)行潰瘍病抗性離體鑒定,接菌10d后拍照統(tǒng)計(jì)計(jì)算病斑面積,以敏感品種’冰糖橙’和高抗品種‘金彈’作對(duì)照,根據(jù)病斑面積大小分級(jí),計(jì)算材料的病情指數(shù)(表11)。結(jié)果顯示,143供試材料病斑面積在0.75–3.29mm2之間;而‘金彈’病斑面積為0.5mm2,‘冰糖橙’病斑面積為3.69mm2。雜交F1群體的病情指數(shù)在30.2–100之間,對(duì)照‘金彈’的病情指數(shù)為11.1,‘冰糖橙’為100如表一。不同組合的F1群體間抗性差異較大,同一組合后代不同個(gè)體間的抗性也存在差異。發(fā)病程度較低的雜交后代,其親本至少有1個(gè)為耐病性品種,母本耐病性強(qiáng)的居多,如清見♀(中抗)×冰糖橙♂(敏感)(圖3)。但母本對(duì)潰瘍病敏感而父本耐病性強(qiáng)的雜交組合其F1代表現(xiàn)耐病性強(qiáng)的也不少,如沃柑♀(敏感)×南豐蜜桔♂(高抗)等雜交組合,其F1代中抗性表型為中抗以上的占到近1/3(圖4)。根據(jù)病情指數(shù)分級(jí),140個(gè)雜交材料中對(duì)潰瘍病抗性表型為免疫的0個(gè),高抗17個(gè),中抗30個(gè),中感38個(gè),高度敏感的55個(gè)(圖2)。圖2.140個(gè)雜交材料潰瘍病病情指數(shù)和病斑面積分布圖Fig2.Diseaseindexdistributionandlesionareaof143testedmaterials
第4章結(jié)果與分析27 圖3.清見♀×冰糖橙♂雜交后代潰瘍病病斑面積和病情指數(shù)分布圖Fig3.Diseaseindexdistributionandlesionareaof‘QingJian’בBingtangOrange’圖4.沃柑♀(敏感)×南豐蜜桔♂(高抗)雜交后代潰瘍病病斑面積和病情指數(shù)分布圖Fig4.Diseaseindexdistributionandlesionareaof‘WoGan’בNanFengMiJv’
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]分子標(biāo)記輔助選擇在大豆育種中的應(yīng)用[J]. 王欣,李長鎖. 現(xiàn)代化農(nóng)業(yè). 2017(12)
[2]對(duì)防治柑橘潰瘍病幾個(gè)問題的思考[J]. 陳長福. 南方農(nóng)業(yè). 2017(16)
[3]柑桔潰瘍病的為害癥狀及防治對(duì)策[J]. 朱雪梅. 現(xiàn)代園藝. 2017(05)
[4]參與植物天然免疫的LRR型蛋白[J]. 張肖晗,趙芊,謝晨星,靳曉揚(yáng),宋水山. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(09)
[5]柑橘品種對(duì)不同基因型柑橘衰退病毒的抑制及變異的影響[J]. 唐萌,金鑫,周常勇,李中安,陶珍珍,周彥. 園藝學(xué)報(bào). 2016(01)
[6]分子標(biāo)記輔助選擇選育高抗性淀粉水稻新品種[J]. 楊瑞芳,白建江,方軍,曾威,樸鐘澤,李剛夑. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2015(12)
[7]廣西柑橘病蟲害綜合防治及其應(yīng)用[J]. 蘭中舉. 南方農(nóng)業(yè). 2015(33)
[8]柑橘黃化脈明病毒DTBIA檢測(cè)方法的建立[J]. 賓羽,宋震,李中安,周常勇. 園藝學(xué)報(bào). 2015(09)
[9]不同柑橘屬種質(zhì)對(duì)柑橘褐斑病菌的抗性評(píng)價(jià)[J]. 胡軍華,劉榮萍,王雪蓮,周娜,洪棋斌,姚廷山,李太盛,江東,曹立,李鴻筠. 果樹學(xué)報(bào). 2015(04)
[10]基于復(fù)雜性測(cè)度的柑橘病蟲害識(shí)別[J]. 溫芝元,曹樂平. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2015(10)
博士論文
[1]弓形蟲鈣依賴性蛋白激酶的功能及免疫保護(hù)性研究[D]. 王金磊.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[2]擬南芥和煙草LRR受體激酶家族及其在調(diào)控葉片衰老中作用研究[D]. MADIHA HAMYAT.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
碩士論文
[1]酸橙與甜橙的遺傳起源及柑橘糖酸變化初探[D]. 何發(fā).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]小麥SNP標(biāo)記與SSR標(biāo)記整合高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. 陳成.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]柑橘種質(zhì)資源抗?jié)儾≡u(píng)價(jià)[D]. 胡青波.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]安全合理使用農(nóng)藥防治柑橘病蟲害計(jì)算機(jī)咨詢系統(tǒng)[D]. 高松.浙江大學(xué) 2003
本文編號(hào):3442189
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
DNA分子1與DNA分子2在同一位點(diǎn)上堿基對(duì)不同F(xiàn)ig.1DifferentsinglebasepairatthesamesiteoftwoDNAmolecules.
西南大學(xué)碩士學(xué)位論文26 第4章結(jié)果與分析4.1F1群體潰瘍病抗性鑒定采用針刺接種法對(duì)143個(gè)供試材料進(jìn)行潰瘍病抗性離體鑒定,接菌10d后拍照統(tǒng)計(jì)計(jì)算病斑面積,以敏感品種’冰糖橙’和高抗品種‘金彈’作對(duì)照,根據(jù)病斑面積大小分級(jí),計(jì)算材料的病情指數(shù)(表11)。結(jié)果顯示,143供試材料病斑面積在0.75–3.29mm2之間;而‘金彈’病斑面積為0.5mm2,‘冰糖橙’病斑面積為3.69mm2。雜交F1群體的病情指數(shù)在30.2–100之間,對(duì)照‘金彈’的病情指數(shù)為11.1,‘冰糖橙’為100如表一。不同組合的F1群體間抗性差異較大,同一組合后代不同個(gè)體間的抗性也存在差異。發(fā)病程度較低的雜交后代,其親本至少有1個(gè)為耐病性品種,母本耐病性強(qiáng)的居多,如清見♀(中抗)×冰糖橙♂(敏感)(圖3)。但母本對(duì)潰瘍病敏感而父本耐病性強(qiáng)的雜交組合其F1代表現(xiàn)耐病性強(qiáng)的也不少,如沃柑♀(敏感)×南豐蜜桔♂(高抗)等雜交組合,其F1代中抗性表型為中抗以上的占到近1/3(圖4)。根據(jù)病情指數(shù)分級(jí),140個(gè)雜交材料中對(duì)潰瘍病抗性表型為免疫的0個(gè),高抗17個(gè),中抗30個(gè),中感38個(gè),高度敏感的55個(gè)(圖2)。圖2.140個(gè)雜交材料潰瘍病病情指數(shù)和病斑面積分布圖Fig2.Diseaseindexdistributionandlesionareaof143testedmaterials
第4章結(jié)果與分析27 圖3.清見♀×冰糖橙♂雜交后代潰瘍病病斑面積和病情指數(shù)分布圖Fig3.Diseaseindexdistributionandlesionareaof‘QingJian’בBingtangOrange’圖4.沃柑♀(敏感)×南豐蜜桔♂(高抗)雜交后代潰瘍病病斑面積和病情指數(shù)分布圖Fig4.Diseaseindexdistributionandlesionareaof‘WoGan’בNanFengMiJv’
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]分子標(biāo)記輔助選擇在大豆育種中的應(yīng)用[J]. 王欣,李長鎖. 現(xiàn)代化農(nóng)業(yè). 2017(12)
[2]對(duì)防治柑橘潰瘍病幾個(gè)問題的思考[J]. 陳長福. 南方農(nóng)業(yè). 2017(16)
[3]柑桔潰瘍病的為害癥狀及防治對(duì)策[J]. 朱雪梅. 現(xiàn)代園藝. 2017(05)
[4]參與植物天然免疫的LRR型蛋白[J]. 張肖晗,趙芊,謝晨星,靳曉揚(yáng),宋水山. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(09)
[5]柑橘品種對(duì)不同基因型柑橘衰退病毒的抑制及變異的影響[J]. 唐萌,金鑫,周常勇,李中安,陶珍珍,周彥. 園藝學(xué)報(bào). 2016(01)
[6]分子標(biāo)記輔助選擇選育高抗性淀粉水稻新品種[J]. 楊瑞芳,白建江,方軍,曾威,樸鐘澤,李剛夑. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2015(12)
[7]廣西柑橘病蟲害綜合防治及其應(yīng)用[J]. 蘭中舉. 南方農(nóng)業(yè). 2015(33)
[8]柑橘黃化脈明病毒DTBIA檢測(cè)方法的建立[J]. 賓羽,宋震,李中安,周常勇. 園藝學(xué)報(bào). 2015(09)
[9]不同柑橘屬種質(zhì)對(duì)柑橘褐斑病菌的抗性評(píng)價(jià)[J]. 胡軍華,劉榮萍,王雪蓮,周娜,洪棋斌,姚廷山,李太盛,江東,曹立,李鴻筠. 果樹學(xué)報(bào). 2015(04)
[10]基于復(fù)雜性測(cè)度的柑橘病蟲害識(shí)別[J]. 溫芝元,曹樂平. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2015(10)
博士論文
[1]弓形蟲鈣依賴性蛋白激酶的功能及免疫保護(hù)性研究[D]. 王金磊.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[2]擬南芥和煙草LRR受體激酶家族及其在調(diào)控葉片衰老中作用研究[D]. MADIHA HAMYAT.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
碩士論文
[1]酸橙與甜橙的遺傳起源及柑橘糖酸變化初探[D]. 何發(fā).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]小麥SNP標(biāo)記與SSR標(biāo)記整合高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. 陳成.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]柑橘種質(zhì)資源抗?jié)儾≡u(píng)價(jià)[D]. 胡青波.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]安全合理使用農(nóng)藥防治柑橘病蟲害計(jì)算機(jī)咨詢系統(tǒng)[D]. 高松.浙江大學(xué) 2003
本文編號(hào):3442189
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