家族性血脂異常LPL基因新突變位點分析
發(fā)布時間:2021-10-13 03:37
目的:對收集的1例血脂異常家系的致病基因進行全外顯子測序,確定其突變基因位點。方法:收集在我院就診的1例血脂異;颊呒捌浼蚁党蓡T的臨床資料,采集患者及相關(guān)家系成員外周血樣本并提取基因組DNA,利用目標外顯子捕獲技術(shù)和二代測序技術(shù)對先證者的與血脂異常有關(guān)的基因進行基因突變篩查,并使用Sanger測序法驗證可疑突變位點并篩查患者家系成員和100例健康人,確定該家系患者的致病突變基因,使用Polyphen2、MutationTaster、SIFT和Provean這4種軟件進行突變基因功能檢測,并利用Swiss-Model軟件分析突變前后的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)模型。結(jié)果:在受檢人樣品中檢測到LPL基因的純合變異c.1322+1G>A(編碼區(qū)第1322+1位核苷酸由G變?yōu)锳),在其子女樣品中檢測到LPL基因同位點的雜合變異。4種預(yù)測軟件均預(yù)測該突變?yōu)橛泻ν蛔?Swiss-Model軟件結(jié)果顯示該突變位點導致442位的纈氨酸突變?yōu)榻K止密碼子,可能影響蛋白質(zhì)的剪切和活化功能。結(jié)論:本研究應(yīng)用全外顯子測序技術(shù)在一血脂異常家系中發(fā)現(xiàn)LPL基因新的突變位點:LPL c.1322+1G>A。該突變可能...
【文章來源】:臨床心血管病雜志. 2020,36(08)北大核心
【文章頁數(shù)】:3 頁
【部分圖文】:
血脂異;颊呒蚁祱D譜
結(jié)合全外顯子組測序的結(jié)果和文獻報道的已知與血脂異常相關(guān)的基因,在先證者DNA樣品中檢測到到一個位于LPL基因第8號外顯子上的非同義突變:LPL基因的純合變異c.1322+1G>A(編碼區(qū)第1322+1位核苷酸由G變?yōu)锳)。該變異位于8號內(nèi)含子經(jīng)典剪接位點+1位,該基因上的無功能變異是導致血脂異常I型的已知致病機理。在先證者子女(Ⅲ-1、Ⅲ-2)的DNA樣品中檢測到LPL基因同位點的雜合變異c.1322+1G>A(圖2)。在先證者的丈夫(Ⅱ-2)及100例健康對照者中并未發(fā)現(xiàn)該突變位點。2.2 生物信息學分析
家族性血脂異常主要包括家族性高三酰甘油血癥和家族性混合型血脂異常,其診斷主要依靠血清TG和TC水平。家族性高三酰甘油血癥的主要特征是血清TG明顯升高,其發(fā)生發(fā)展與LPL基因密切相關(guān)[7-8]。LPL基因位于8p21.3染色體上,編碼蛋白為脂蛋白脂肪酶,該蛋白作為同型二聚體發(fā)揮甘油三酸酯水解酶與脂蛋白攝入受體的配體/橋聯(lián)因子功能。該基因中的致病性突變與脂蛋白脂酶缺乏有關(guān),從而導致家族性血脂異常[9]。本研究應(yīng)用全外顯子測序技術(shù)在一血脂異常家系中發(fā)現(xiàn)LPL基因新的突變位點:LPL基因c.1322+1G>A。此位點目前在我國人群中少見文獻報道,但已有文獻報道在該變異相鄰堿基位點處發(fā)生變異與脂蛋白脂酶缺乏癥有關(guān):1例患I型血脂異常的日本男嬰攜帶LPL基因的復合雜合變異,其中一個變異是8號內(nèi)含子經(jīng)典剪接位點+2位變異(c.1322+2T>C),該變異導致mRNA異常剪接,產(chǎn)生的mRNA比正常的短134 bp,造成終止密碼子的移碼,使編碼蛋白提前終止而缺乏C末端關(guān)鍵結(jié)構(gòu)域。LPL突變導致的高三酰甘油是冠心病的重要危險因素[10]。在該血脂異常家系中,先證者攜帶有LPL基因c.1322+1G>A的純合變異,這可能是其嚴重血脂異常且冠脈病變較重的原因。先證者的母親也曾被檢測出嚴重血脂異常,且死于嚴重冠心病,推測其也為該突變位點的攜帶者。先證者的子女均被檢測出該突變的雜合變異,但目前尚未表現(xiàn)出血脂異常。對血脂異;颊呒捌浼蚁党蓡T盡早進行基因檢測可以明確疾病的遺傳原因,有助于篩查家系突變基因,對患者的治療方案、其家系成員的早期診斷有明確的價值,并且對突變攜帶者的早期干預(yù)和遺傳咨詢具有非常重要的臨床意義[11]。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]肥厚型心肌病家系攜帶ACTN2、MYBPC3和TNNI3基因突變分析[J]. 張智文,王婷,楊海濤. 臨床心血管病雜志. 2020(02)
[2]家族性高膽固醇血癥診治新進展[J]. 姚純,趙水平. 臨床心血管病雜志. 2019(12)
本文編號:3433883
【文章來源】:臨床心血管病雜志. 2020,36(08)北大核心
【文章頁數(shù)】:3 頁
【部分圖文】:
血脂異;颊呒蚁祱D譜
結(jié)合全外顯子組測序的結(jié)果和文獻報道的已知與血脂異常相關(guān)的基因,在先證者DNA樣品中檢測到到一個位于LPL基因第8號外顯子上的非同義突變:LPL基因的純合變異c.1322+1G>A(編碼區(qū)第1322+1位核苷酸由G變?yōu)锳)。該變異位于8號內(nèi)含子經(jīng)典剪接位點+1位,該基因上的無功能變異是導致血脂異常I型的已知致病機理。在先證者子女(Ⅲ-1、Ⅲ-2)的DNA樣品中檢測到LPL基因同位點的雜合變異c.1322+1G>A(圖2)。在先證者的丈夫(Ⅱ-2)及100例健康對照者中并未發(fā)現(xiàn)該突變位點。2.2 生物信息學分析
家族性血脂異常主要包括家族性高三酰甘油血癥和家族性混合型血脂異常,其診斷主要依靠血清TG和TC水平。家族性高三酰甘油血癥的主要特征是血清TG明顯升高,其發(fā)生發(fā)展與LPL基因密切相關(guān)[7-8]。LPL基因位于8p21.3染色體上,編碼蛋白為脂蛋白脂肪酶,該蛋白作為同型二聚體發(fā)揮甘油三酸酯水解酶與脂蛋白攝入受體的配體/橋聯(lián)因子功能。該基因中的致病性突變與脂蛋白脂酶缺乏有關(guān),從而導致家族性血脂異常[9]。本研究應(yīng)用全外顯子測序技術(shù)在一血脂異常家系中發(fā)現(xiàn)LPL基因新的突變位點:LPL基因c.1322+1G>A。此位點目前在我國人群中少見文獻報道,但已有文獻報道在該變異相鄰堿基位點處發(fā)生變異與脂蛋白脂酶缺乏癥有關(guān):1例患I型血脂異常的日本男嬰攜帶LPL基因的復合雜合變異,其中一個變異是8號內(nèi)含子經(jīng)典剪接位點+2位變異(c.1322+2T>C),該變異導致mRNA異常剪接,產(chǎn)生的mRNA比正常的短134 bp,造成終止密碼子的移碼,使編碼蛋白提前終止而缺乏C末端關(guān)鍵結(jié)構(gòu)域。LPL突變導致的高三酰甘油是冠心病的重要危險因素[10]。在該血脂異常家系中,先證者攜帶有LPL基因c.1322+1G>A的純合變異,這可能是其嚴重血脂異常且冠脈病變較重的原因。先證者的母親也曾被檢測出嚴重血脂異常,且死于嚴重冠心病,推測其也為該突變位點的攜帶者。先證者的子女均被檢測出該突變的雜合變異,但目前尚未表現(xiàn)出血脂異常。對血脂異;颊呒捌浼蚁党蓡T盡早進行基因檢測可以明確疾病的遺傳原因,有助于篩查家系突變基因,對患者的治療方案、其家系成員的早期診斷有明確的價值,并且對突變攜帶者的早期干預(yù)和遺傳咨詢具有非常重要的臨床意義[11]。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]肥厚型心肌病家系攜帶ACTN2、MYBPC3和TNNI3基因突變分析[J]. 張智文,王婷,楊海濤. 臨床心血管病雜志. 2020(02)
[2]家族性高膽固醇血癥診治新進展[J]. 姚純,趙水平. 臨床心血管病雜志. 2019(12)
本文編號:3433883
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