GH-IGF信號通路對魚類的生長起到重要的調(diào)控作用。為探尋生長激素受體（growth hormone receptor, GHR）和類胰島素生長因子Ⅰ（insulin-like growth factor-Ⅰ, IGF-Ⅰ）基因的單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）分子標記與尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）優(yōu)勢生長性狀的相關(guān)性,本研究利用Sanger測序技術(shù)從吉富品系（JF）和埃及品系（AJ）兩種尼羅羅非魚GHR1、GHR2和IGF-I基因啟動子區(qū)和編碼區(qū)共篩選出32個SNPs位點。以是否引起序列功能改變?yōu)闂l件進行SNPs的二次篩選,在JF群體中共保留9個SNPs位點,分布于GHR1基因（7個）和GHR2基因（2個）中;在AJ群體中共保留5個SNPs位點,分布于GHR1基因（4個）和GHR2基因（1個）中。通過一般線性模型（general linear model,GLM）及最小二乘分析（least-significant difference, LSD）對兩種羅非魚的子代群體進行SNPs與生長性狀的相關(guān)性... 

【文章來源】：農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2020,28(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：16 頁

【部分圖文】：

吉富羅非魚3個生長相關(guān)因子序列結(jié)構(gòu)及SNPs位點

由于GHR1和GHR2基因在部分群體中存在的SNPs位點數(shù)大于2個，因此可通過Haplo View 4.2軟件對2個群體羅非魚GHR1和GHR2基因SNPs位點進行連鎖不平衡分析，分析結(jié)果見圖3。跟據(jù)Wang等(2002)的四配子檢驗法，在JF群體GHR1基因的7個SNPs中確定了1個單倍塊，由全部7個SNPs位點構(gòu)成，其中N3、N4、N7、N8和N9彼此之間連鎖性較高，N3與N7、N4與N8和N9、N11與N13三組位點之間完全連鎖(r2=1,D=1),N3、N4、N7、N8、N9位點均可作為單倍塊1的標簽SNPs；在AJ群體GHR1基因中4個位點共同組成1個單倍塊，其中N"4、N"5和N"7三個位點之間連鎖性較高，且N"5與N"7之間完全連鎖(r2=1,D=1),N"5和N"7均可作為該單倍塊的標簽SNPs;JF群體GHR2基因的2個位點未構(gòu)成單倍塊，且位點之間的連鎖性較低。2.6 生長因子SNPs位點與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析

在JF群體中保留了9個位點。其中，GHR1基因保留了7個位點，N3及N4會引起編碼氨基酸由纈氨酸(Val)改變?yōu)楫惲涟彼?Ile),N7會引起編碼氨基酸由亮氨酸(Leu)改變?yōu)楣劝滨０?Gln),N8會引起編碼氨基酸由纈氨酸(Val)改變?yōu)楦拾彼?Gly),N9會引起編碼氨基酸由蘇氨酸(Thr)改變?yōu)橘嚢彼?Lys),N11會引起編碼氨基酸由蘇氨酸(Thr)改變?yōu)榻z氨酸(Ser),N13會引起編碼氨基酸由甲硫氨酸(Met)改變?yōu)樘K氨酸(Thr)；在GHR2基因中保留了2個位點，N17和N18共同引起基因啟動子區(qū)減少了1個鈣反應(yīng)因子(calcium-responsive factor,Ca RF)的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。在AJ群體中保留了5個位點。其中，GHR1基因保留了4個位點，N"2使轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點由Vir D2結(jié)合蛋白(Vir D2-binding-protein,VBP)改變?yōu)閱温砸蜃? (odd-skipped related 2,OSR2),N"4會引起編碼氨基酸由絲氨酸(Ser)改變?yōu)楸彼?Ala),N"5會引起編碼氨基酸由蘇氨酸(Thr)改變?yōu)榻z氨酸(Ser),N"7會引起編碼氨基酸由甲硫氨酸(Met)改變?yōu)樘K氨酸(Thr)；在GHR2基因中僅保留1個位點，N"10位點引起基因啟動子區(qū)增加了1個熱休克因子2 (heat shock factors 2,HSF2)的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點；在IGF-Ⅰ基因中并未發(fā)現(xiàn)引起了序列功能改變的SNPs位點，無位點被保留。

【參考文獻】：
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