GH-IGF信號(hào)通路對(duì)魚(yú)類的生長(zhǎng)起到重要的調(diào)控作用。為探尋生長(zhǎng)激素受體（growth hormone receptor, GHR）和類胰島素生長(zhǎng)因子Ⅰ（insulin-like growth factor-Ⅰ, IGF-Ⅰ）基因的單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）分子標(biāo)記與尼羅羅非魚(yú)（Oreochromis niloticus）優(yōu)勢(shì)生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性,本研究利用Sanger測(cè)序技術(shù)從吉富品系（JF）和埃及品系（AJ）兩種尼羅羅非魚(yú)GHR1、GHR2和IGF-I基因啟動(dòng)子區(qū)和編碼區(qū)共篩選出32個(gè)SNPs位點(diǎn)。以是否引起序列功能改變?yōu)闂l件進(jìn)行SNPs的二次篩選,在JF群體中共保留9個(gè)SNPs位點(diǎn),分布于GHR1基因（7個(gè)）和GHR2基因（2個(gè)）中;在AJ群體中共保留5個(gè)SNPs位點(diǎn),分布于GHR1基因（4個(gè)）和GHR2基因（1個(gè)）中。通過(guò)一般線性模型（general linear model,GLM）及最小二乘分析（least-significant difference, LSD）對(duì)兩種羅非魚(yú)的子代群體進(jìn)行SNPs與生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性... 

【文章來(lái)源】：農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2020,28(11)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：16 頁(yè)

【部分圖文】：

吉富羅非魚(yú)3個(gè)生長(zhǎng)相關(guān)因子序列結(jié)構(gòu)及SNPs位點(diǎn)

由于GHR1和GHR2基因在部分群體中存在的SNPs位點(diǎn)數(shù)大于2個(gè)，因此可通過(guò)Haplo View 4.2軟件對(duì)2個(gè)群體羅非魚(yú)GHR1和GHR2基因SNPs位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡分析，分析結(jié)果見(jiàn)圖3。跟據(jù)Wang等(2002)的四配子檢驗(yàn)法，在JF群體GHR1基因的7個(gè)SNPs中確定了1個(gè)單倍塊，由全部7個(gè)SNPs位點(diǎn)構(gòu)成，其中N3、N4、N7、N8和N9彼此之間連鎖性較高，N3與N7、N4與N8和N9、N11與N13三組位點(diǎn)之間完全連鎖(r2=1,D=1),N3、N4、N7、N8、N9位點(diǎn)均可作為單倍塊1的標(biāo)簽SNPs；在AJ群體GHR1基因中4個(gè)位點(diǎn)共同組成1個(gè)單倍塊，其中N"4、N"5和N"7三個(gè)位點(diǎn)之間連鎖性較高，且N"5與N"7之間完全連鎖(r2=1,D=1),N"5和N"7均可作為該單倍塊的標(biāo)簽SNPs;JF群體GHR2基因的2個(gè)位點(diǎn)未構(gòu)成單倍塊，且位點(diǎn)之間的連鎖性較低。2.6 生長(zhǎng)因子SNPs位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析

在JF群體中保留了9個(gè)位點(diǎn)。其中，GHR1基因保留了7個(gè)位點(diǎn)，N3及N4會(huì)引起編碼氨基酸由纈氨酸(Val)改變?yōu)楫惲涟彼?Ile),N7會(huì)引起編碼氨基酸由亮氨酸(Leu)改變?yōu)楣劝滨０?Gln),N8會(huì)引起編碼氨基酸由纈氨酸(Val)改變?yōu)楦拾彼?Gly),N9會(huì)引起編碼氨基酸由蘇氨酸(Thr)改變?yōu)橘嚢彼?Lys),N11會(huì)引起編碼氨基酸由蘇氨酸(Thr)改變?yōu)榻z氨酸(Ser),N13會(huì)引起編碼氨基酸由甲硫氨酸(Met)改變?yōu)樘K氨酸(Thr)；在GHR2基因中保留了2個(gè)位點(diǎn)，N17和N18共同引起基因啟動(dòng)子區(qū)減少了1個(gè)鈣反應(yīng)因子(calcium-responsive factor,Ca RF)的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。在AJ群體中保留了5個(gè)位點(diǎn)。其中，GHR1基因保留了4個(gè)位點(diǎn)，N"2使轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)由Vir D2結(jié)合蛋白(Vir D2-binding-protein,VBP)改變?yōu)閱温砸蜃? (odd-skipped related 2,OSR2),N"4會(huì)引起編碼氨基酸由絲氨酸(Ser)改變?yōu)楸彼?Ala),N"5會(huì)引起編碼氨基酸由蘇氨酸(Thr)改變?yōu)榻z氨酸(Ser),N"7會(huì)引起編碼氨基酸由甲硫氨酸(Met)改變?yōu)樘K氨酸(Thr)；在GHR2基因中僅保留1個(gè)位點(diǎn)，N"10位點(diǎn)引起基因啟動(dòng)子區(qū)增加了1個(gè)熱休克因子2 (heat shock factors 2,HSF2)的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)；在IGF-Ⅰ基因中并未發(fā)現(xiàn)引起了序列功能改變的SNPs位點(diǎn)，無(wú)位點(diǎn)被保留。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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