CRISPR/Cas9及ABE基因編輯系統(tǒng)在甘藍(lán)中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-10-09 17:29
基因定點(diǎn)編輯技術(shù)為植物功能基因研究和作物遺傳育種提供了重要的技術(shù)支撐。CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)作為當(dāng)前最熱門的基因編輯技術(shù),其作用原理主要由sgRNA靶向目的DNA序列并與之結(jié)合,從而激活Cas9的核酸酶切割靶DNA,產(chǎn)生靶序列DNA雙鏈斷裂(DSB)的損傷。通過非同源末端連接與同源重組的修復(fù)方式在靶位點(diǎn)處產(chǎn)生DNA片段的插入或缺失或在靶位點(diǎn)處敲入外源片段或引入點(diǎn)突變,以此來實(shí)現(xiàn)對(duì)目的基因的突變。另外,在DNA修復(fù)機(jī)制中,同源重組的效率遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于非同源末端連接,導(dǎo)致靶位點(diǎn)處修復(fù)結(jié)果不可控。而單堿基編輯技術(shù)在不依賴雙鏈斷裂的條件下實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)基因片段中特定位點(diǎn)的單個(gè)堿基進(jìn)行轉(zhuǎn)換,可以實(shí)現(xiàn)目標(biāo)基因的精確修飾。目前已開發(fā)出實(shí)現(xiàn)靶序列中C/G→T/A轉(zhuǎn)換的CBE編輯器和A/T→G/C轉(zhuǎn)換的ABE編輯器,這些單堿基編輯器針對(duì)目標(biāo)基因的修飾可以不再依賴于DNA雙鏈斷裂且能產(chǎn)生4種形式的堿基轉(zhuǎn)換,既規(guī)避了HR修復(fù)途徑效率低的限制,也擺脫了NHEJ修復(fù)途徑的隨機(jī)性。植物的成花過程受外部環(huán)境的影響與錯(cuò)綜復(fù)雜的內(nèi)源基因調(diào)控。FT、CO調(diào)控植物開花進(jìn)程,突變FT、CO基因使其在植物體內(nèi)的表達(dá)量降低或不...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
TALEN作用原理示意圖(沈延等,2013)
西南大學(xué)碩士學(xué)位論文4圖1-2CRISPR/Cas9系統(tǒng)作用原理示意圖(Wiedenheftetal.,2012)Figure1-2SchematicdiagramofCRISPR/Cas9systemprinciple(Wiedenheftetal.,2012)1.1.3.2CRISPR/Cas介導(dǎo)的多基因編輯CRISPR/Cas9系統(tǒng)在植物體細(xì)胞內(nèi)工作時(shí)每個(gè)sgRNA都具有獨(dú)立性,這使其在同一個(gè)體實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)或多基因的編輯成為可能。CRISPR/Cas系統(tǒng)主要由sgRNA與Cas9蛋白組成,sgRNA識(shí)別并導(dǎo)向Cas9蛋白對(duì)靶位點(diǎn)的切割,因此,CRISPR/Cas系統(tǒng)的靶向精確性很大程度上取決于sgRNA生成。研究發(fā)現(xiàn)tRNA大量存在于生物體細(xì)胞內(nèi),能在細(xì)胞內(nèi)迅速加工合成,其合成機(jī)制與生物體自身的單個(gè)多順反子基因合成的小片段RNA的機(jī)制非常相似(Nakajimaetal.,1981;Kruszkaetal.,2014)。BoxA和BoxB作為tRNA內(nèi)部啟動(dòng)原件能招募RNA聚合酶PolⅢ型復(fù)合體,此外,RNA聚合酶PolⅢ型啟動(dòng)子的表達(dá)也能在tRNA序列的作用下加強(qiáng)(Diecietal.,2007;Whiteetal.,2011);谝陨显,研究者將tRNA與gRNA進(jìn)行結(jié)合,一種能夠同時(shí)產(chǎn)生大量gRNA的多順反子結(jié)構(gòu)tRNA-gRNA的創(chuàng)制得以實(shí)現(xiàn)(Xieetal.,2015)。CRISPR/Cas9表達(dá)載體中tRNA組分被內(nèi)源tRNA加工系統(tǒng)識(shí)別并將gRNA從tRNA-gRNA轉(zhuǎn)錄物中切除出形成單個(gè)獨(dú)立的gRNA,細(xì)胞內(nèi)大量存在的gRNA引導(dǎo)Cas9靶向多個(gè)目標(biāo)位點(diǎn)進(jìn)行基因組編輯。此外,Ma等應(yīng)用PCR程序原理使多個(gè)表達(dá)盒sgRNA能夠快速的得到,由Gibson或GoldenGate構(gòu)建二元表達(dá)載體,再與經(jīng)過優(yōu)化的Cas9蛋白結(jié)合,實(shí)
第1章文獻(xiàn)綜述5現(xiàn)了在雙子葉和單子葉植物中的多基因編輯,這大大提高了突變效率。圖1-3基于內(nèi)源tRNA表達(dá)加工的CRISPR/Cas9多基因編輯原理圖(Xieetal.,2015)Figure1-3SchematicdiagramofCRISPR/Cas9multigeneeditingbasedonendogenoustRNAexpressionprocessing(Xieetal.,2015)1.1.3.3CRISPR/Cas9技術(shù)在作物中的應(yīng)用自然進(jìn)化過程中基因突變是生物多樣性的重要來源,在作物育種中基因突變也為優(yōu)良品種的選育提供了更多的選擇。盡管物理誘變(如γ射線)和化學(xué)誘變(如亞硝基乙基脲NEH和甲基磺酸乙酯EMS)的方法能引入植物基因的突變,但此種方法引入的基因突變具有隨機(jī)性而且難以實(shí)現(xiàn)目標(biāo)性狀的定向突變,在作物育種方面難以廣泛應(yīng)用。CRISPR/Cas9系統(tǒng)能實(shí)現(xiàn)目的基因的精準(zhǔn)打靶完成定向突變,此系統(tǒng)至開發(fā)以來即被育種家們廣泛應(yīng)用于作物育種,迅速成為了作物遺傳育種中的熱門技術(shù)。在水稻中Gn1a、DEP1、GS3、IPA1分別控制水稻穗粒數(shù)、直立密穗、單粒重和分蘗數(shù),Li等利用CRISPR/Cas9技術(shù)對(duì)這上述基因進(jìn)行突變,成功創(chuàng)制了優(yōu)良性狀的水稻品種,大幅度的提高了產(chǎn)量(Lietal.,2016)。此外,利用此系統(tǒng)進(jìn)行水稻抗病基因與抗除草劑基因的編輯,獲得了抗稻瘟病和抗除草劑的水稻品種(Liuetal.,2012;Sunetal.,2016)。在玉米育種中,育種家一直探索著降低玉米中的肌醇六磷酸(PA),因?yàn)檫@類物質(zhì)對(duì)于單胃動(dòng)物來說難以吸收消化。ZmIPK1A、ZmIPK、ZmMRP基因控制著PA合成途徑,Liang等應(yīng)用CRISPR/Cas9技術(shù)成功敲除ZmIPK基因,大幅度降低了玉米中的PA含量(Liangetal.,2014)。另外,CRISPR/Cas9技術(shù)也被用于玉米代謝途徑調(diào)控(Fengetal.,2016)、鹽脅迫(Xingetal.,2014)和干旱脅迫(Habbenetal.,2014;Shietal.,2016)等基因編輯。
本文編號(hào):3426751
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
TALEN作用原理示意圖(沈延等,2013)
西南大學(xué)碩士學(xué)位論文4圖1-2CRISPR/Cas9系統(tǒng)作用原理示意圖(Wiedenheftetal.,2012)Figure1-2SchematicdiagramofCRISPR/Cas9systemprinciple(Wiedenheftetal.,2012)1.1.3.2CRISPR/Cas介導(dǎo)的多基因編輯CRISPR/Cas9系統(tǒng)在植物體細(xì)胞內(nèi)工作時(shí)每個(gè)sgRNA都具有獨(dú)立性,這使其在同一個(gè)體實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)或多基因的編輯成為可能。CRISPR/Cas系統(tǒng)主要由sgRNA與Cas9蛋白組成,sgRNA識(shí)別并導(dǎo)向Cas9蛋白對(duì)靶位點(diǎn)的切割,因此,CRISPR/Cas系統(tǒng)的靶向精確性很大程度上取決于sgRNA生成。研究發(fā)現(xiàn)tRNA大量存在于生物體細(xì)胞內(nèi),能在細(xì)胞內(nèi)迅速加工合成,其合成機(jī)制與生物體自身的單個(gè)多順反子基因合成的小片段RNA的機(jī)制非常相似(Nakajimaetal.,1981;Kruszkaetal.,2014)。BoxA和BoxB作為tRNA內(nèi)部啟動(dòng)原件能招募RNA聚合酶PolⅢ型復(fù)合體,此外,RNA聚合酶PolⅢ型啟動(dòng)子的表達(dá)也能在tRNA序列的作用下加強(qiáng)(Diecietal.,2007;Whiteetal.,2011);谝陨显,研究者將tRNA與gRNA進(jìn)行結(jié)合,一種能夠同時(shí)產(chǎn)生大量gRNA的多順反子結(jié)構(gòu)tRNA-gRNA的創(chuàng)制得以實(shí)現(xiàn)(Xieetal.,2015)。CRISPR/Cas9表達(dá)載體中tRNA組分被內(nèi)源tRNA加工系統(tǒng)識(shí)別并將gRNA從tRNA-gRNA轉(zhuǎn)錄物中切除出形成單個(gè)獨(dú)立的gRNA,細(xì)胞內(nèi)大量存在的gRNA引導(dǎo)Cas9靶向多個(gè)目標(biāo)位點(diǎn)進(jìn)行基因組編輯。此外,Ma等應(yīng)用PCR程序原理使多個(gè)表達(dá)盒sgRNA能夠快速的得到,由Gibson或GoldenGate構(gòu)建二元表達(dá)載體,再與經(jīng)過優(yōu)化的Cas9蛋白結(jié)合,實(shí)
第1章文獻(xiàn)綜述5現(xiàn)了在雙子葉和單子葉植物中的多基因編輯,這大大提高了突變效率。圖1-3基于內(nèi)源tRNA表達(dá)加工的CRISPR/Cas9多基因編輯原理圖(Xieetal.,2015)Figure1-3SchematicdiagramofCRISPR/Cas9multigeneeditingbasedonendogenoustRNAexpressionprocessing(Xieetal.,2015)1.1.3.3CRISPR/Cas9技術(shù)在作物中的應(yīng)用自然進(jìn)化過程中基因突變是生物多樣性的重要來源,在作物育種中基因突變也為優(yōu)良品種的選育提供了更多的選擇。盡管物理誘變(如γ射線)和化學(xué)誘變(如亞硝基乙基脲NEH和甲基磺酸乙酯EMS)的方法能引入植物基因的突變,但此種方法引入的基因突變具有隨機(jī)性而且難以實(shí)現(xiàn)目標(biāo)性狀的定向突變,在作物育種方面難以廣泛應(yīng)用。CRISPR/Cas9系統(tǒng)能實(shí)現(xiàn)目的基因的精準(zhǔn)打靶完成定向突變,此系統(tǒng)至開發(fā)以來即被育種家們廣泛應(yīng)用于作物育種,迅速成為了作物遺傳育種中的熱門技術(shù)。在水稻中Gn1a、DEP1、GS3、IPA1分別控制水稻穗粒數(shù)、直立密穗、單粒重和分蘗數(shù),Li等利用CRISPR/Cas9技術(shù)對(duì)這上述基因進(jìn)行突變,成功創(chuàng)制了優(yōu)良性狀的水稻品種,大幅度的提高了產(chǎn)量(Lietal.,2016)。此外,利用此系統(tǒng)進(jìn)行水稻抗病基因與抗除草劑基因的編輯,獲得了抗稻瘟病和抗除草劑的水稻品種(Liuetal.,2012;Sunetal.,2016)。在玉米育種中,育種家一直探索著降低玉米中的肌醇六磷酸(PA),因?yàn)檫@類物質(zhì)對(duì)于單胃動(dòng)物來說難以吸收消化。ZmIPK1A、ZmIPK、ZmMRP基因控制著PA合成途徑,Liang等應(yīng)用CRISPR/Cas9技術(shù)成功敲除ZmIPK基因,大幅度降低了玉米中的PA含量(Liangetal.,2014)。另外,CRISPR/Cas9技術(shù)也被用于玉米代謝途徑調(diào)控(Fengetal.,2016)、鹽脅迫(Xingetal.,2014)和干旱脅迫(Habbenetal.,2014;Shietal.,2016)等基因編輯。
本文編號(hào):3426751
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