基于TCGA數(shù)據(jù)庫的吸煙相關(guān)肺腺癌基因表達(dá)差異及臨床意義
發(fā)布時間：2021-10-09 06:58
目的:我們探究了吸煙對肺腺癌患者的mRNA及miRNA的表達(dá)影響,獲得與生存緊密相關(guān)的mRNA及miRNA,進(jìn)一步探討其指導(dǎo)肺腺癌的診斷、治療及評價預(yù)后的臨床應(yīng)用價值。方法:本研究利用TCGA數(shù)據(jù)庫,從中獲取肺腺癌樣本的mRNA和miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)及與臨床預(yù)后相關(guān)的數(shù)據(jù),對數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選選出有完整的吸煙和預(yù)后信息數(shù)據(jù)的樣本進(jìn)行下一步分析。（1）我們通過利用R語言統(tǒng)計軟件中的limma包對mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析,獲取與吸煙相關(guān)的差異表達(dá)mRNA,將篩選條件設(shè)為P.Value<0.001,adj.P.Val<0.001,logFC>2。利用SPSS 20.0軟件對篩選出的差異mRNA進(jìn)行Kaplan-Meier生存分析,P<0.05說明該mRNA在肺腺癌中的表達(dá)對病人生存期存在顯著影響。利用DAVID軟件探究對生存具有顯著影響的吸煙相關(guān)肺腺癌差異mRNA存在的KEGGPATHWAY信號通路。（2）我們同樣利用R語言的limma包對miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析,獲取在吸煙與不吸煙樣本中存在差異表達(dá)的miRNA,篩選條件為P.Value&l...
【文章來源】：大連醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】：46 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
在cBioPortal中獲取肺腺癌mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)及臨床信息
圖 3.具有顯著生存差異的 8 個 miRNA(A.hsa-mir-4709，B.hsa-mir-99a，C.hsa-mir-30e，D.hsa-mir-1976，E.hsa-mir-181c，F(xiàn).hsa-mir-101-2，G.hsa-mir-101-1，H.hsa-let-7c)（四）討論惡性腫瘤中肺癌是發(fā)病率和死亡率都高的腫瘤，對人們的社會生活造成嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)，對人類的生命健康造成嚴(yán)重影響。肺癌中有 80%為非小細(xì)胞癌，包括肺鱗癌、肺腺癌、大細(xì)胞癌三種類型。吸煙是肺癌主要的致癌因素，通常肺鱗癌被認(rèn)為與吸煙關(guān)系密切，但近年來調(diào)查顯示肺鱗癌的比例較前下降，而肺腺癌的比例上升，中國目前的吸煙人口仍處于較高水平，控?zé)熾y度大，肺腺癌人數(shù)的上升可能與過濾嘴香煙的普及有關(guān)，肺腺癌與吸煙之間的關(guān)系需要重新審視。肺腺癌相比肺鱗癌具有發(fā)展迅速、轉(zhuǎn)移早、預(yù)后差等特點(diǎn)，隨著對肺癌的分子病因?qū)W的深入了解及分子靶向藥物治療在分子機(jī)制水平針對性較強(qiáng)，有著高效、安全的特點(diǎn)，探索更多
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]2015年浙江省腫瘤登記地區(qū)惡性腫瘤發(fā)病與死亡分析[J]. 王悠清,李輝章,龔巍巍,朱陳,陳瑤瑤,鐘節(jié)鳴,俞敏,杜靈彬. 中國腫瘤. 2019(01)
[2]非小細(xì)胞肺癌免疫治療進(jìn)展[J]. 尚聰聰,張力. 中國腫瘤臨床. 2018(04)
[3]2017年非小細(xì)胞肺癌靶向治療進(jìn)展[J]. 陳婧華,鐘文昭,吳一龍. 循證醫(yī)學(xué). 2018(01)
[4]肺癌的外科治療進(jìn)展[J]. 高文,張智. 中華胸部外科電子雜志. 2017(04)
[5]小細(xì)胞肺癌放射治療進(jìn)展[J]. 孫世昌,張云,岳金波. 中華腫瘤防治雜志. 2017(13)
[6]非小細(xì)胞肺癌術(shù)后輔助EGFR-TKI的治療進(jìn)展[J]. 姚舒洋,支修益. 首都醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2016(06)
[7]安全性高的非甾體抗炎藥的研究進(jìn)展[J]. 呂田,葉海,張燦. 中國新藥雜志. 2016(11)
[8]塞來昔布聯(lián)合放化療對比單純放化療治療晚期非小細(xì)胞肺癌療效與安全性的Meta分析[J]. 任春利,繆李麗. 中國藥房. 2014(44)
[9]吸煙致肺癌機(jī)制及遺傳易感因素研究進(jìn)展[J]. 薛雯,鐘理,周敬華. 中國公共衛(wèi)生. 2011(08)
[10]中國11省市成年人吸煙和被動吸煙情況調(diào)查[J]. 徐濤,李衛(wèi),胡泊,陳濤,劉冰,孫毅,王楊. 中國慢性病預(yù)防與控制. 2010(03)
本文編號：3425869
【文章來源】：大連醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】：46 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
在cBioPortal中獲取肺腺癌mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)及臨床信息
圖 3.具有顯著生存差異的 8 個 miRNA(A.hsa-mir-4709，B.hsa-mir-99a，C.hsa-mir-30e，D.hsa-mir-1976，E.hsa-mir-181c，F(xiàn).hsa-mir-101-2，G.hsa-mir-101-1，H.hsa-let-7c)（四）討論惡性腫瘤中肺癌是發(fā)病率和死亡率都高的腫瘤，對人們的社會生活造成嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)，對人類的生命健康造成嚴(yán)重影響。肺癌中有 80%為非小細(xì)胞癌，包括肺鱗癌、肺腺癌、大細(xì)胞癌三種類型。吸煙是肺癌主要的致癌因素，通常肺鱗癌被認(rèn)為與吸煙關(guān)系密切，但近年來調(diào)查顯示肺鱗癌的比例較前下降，而肺腺癌的比例上升，中國目前的吸煙人口仍處于較高水平，控?zé)熾y度大，肺腺癌人數(shù)的上升可能與過濾嘴香煙的普及有關(guān)，肺腺癌與吸煙之間的關(guān)系需要重新審視。肺腺癌相比肺鱗癌具有發(fā)展迅速、轉(zhuǎn)移早、預(yù)后差等特點(diǎn)，隨著對肺癌的分子病因?qū)W的深入了解及分子靶向藥物治療在分子機(jī)制水平針對性較強(qiáng)，有著高效、安全的特點(diǎn)，探索更多
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]2015年浙江省腫瘤登記地區(qū)惡性腫瘤發(fā)病與死亡分析[J]. 王悠清,李輝章,龔巍巍,朱陳,陳瑤瑤,鐘節(jié)鳴,俞敏,杜靈彬. 中國腫瘤. 2019(01)
[2]非小細(xì)胞肺癌免疫治療進(jìn)展[J]. 尚聰聰,張力. 中國腫瘤臨床. 2018(04)
[3]2017年非小細(xì)胞肺癌靶向治療進(jìn)展[J]. 陳婧華,鐘文昭,吳一龍. 循證醫(yī)學(xué). 2018(01)
[4]肺癌的外科治療進(jìn)展[J]. 高文,張智. 中華胸部外科電子雜志. 2017(04)
[5]小細(xì)胞肺癌放射治療進(jìn)展[J]. 孫世昌,張云,岳金波. 中華腫瘤防治雜志. 2017(13)
[6]非小細(xì)胞肺癌術(shù)后輔助EGFR-TKI的治療進(jìn)展[J]. 姚舒洋,支修益. 首都醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2016(06)
[7]安全性高的非甾體抗炎藥的研究進(jìn)展[J]. 呂田,葉海,張燦. 中國新藥雜志. 2016(11)
[8]塞來昔布聯(lián)合放化療對比單純放化療治療晚期非小細(xì)胞肺癌療效與安全性的Meta分析[J]. 任春利,繆李麗. 中國藥房. 2014(44)
[9]吸煙致肺癌機(jī)制及遺傳易感因素研究進(jìn)展[J]. 薛雯,鐘理,周敬華. 中國公共衛(wèi)生. 2011(08)
[10]中國11省市成年人吸煙和被動吸煙情況調(diào)查[J]. 徐濤,李衛(wèi),胡泊,陳濤,劉冰,孫毅,王楊. 中國慢性病預(yù)防與控制. 2010(03)
本文編號：3425869
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