地中海貧血癥是世界上最常見和發(fā)生率最高的一種單基因遺傳病。目前臨床上地中海貧血癥沒有可以普遍推廣的根治方法。產(chǎn)前診斷在地中海貧血癥的預(yù)防上有重要貢獻(xiàn)。由于產(chǎn)前診斷技術(shù)的局限,導(dǎo)致地中海貧血癥稀有突變類型不能被檢測,不能完全避免地中海貧血癥患兒出生。而外顯子測序技術(shù)有可能彌補這一缺點,因此我們運用外顯子測序技術(shù)對地中海貧血癥基因攜帶者羊水樣本進(jìn)行檢測,既能驗證臨床產(chǎn)前診斷結(jié)果,同時也是為了發(fā)現(xiàn)新的變異位點。我們通過外顯子測序篩選出1344個共有變異位點。通過對這些共有變異位點進(jìn)行GO富集分析篩選了26個term,涵蓋膜的整體成分、跨膜信號受體活性、細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)成分、鈣離子結(jié)合等;通過KEGG富集分析篩選了13條信號通路,包括糖酵解/糖異生、ECM受體相互作用、補體與凝血級聯(lián)反應(yīng)等。這些基因和信號通路可能與地中海貧血癥的發(fā)病機制密切相關(guān),其結(jié)果需要進(jìn)一步驗證。另一方面,珠蛋白基因缺陷影響紅細(xì)胞發(fā)育過程。紅細(xì)胞的發(fā)育起源于造血干細(xì)胞,對造血干細(xì)胞的機理研究是根治地中海貧血癥等一系列血液疾病的潛在突破口。我們利用磁珠分選和流式分選的方法從臍帶血樣本分離純化CD34陽性細(xì)胞,在體外運用多種細(xì)胞... 

【文章來源】：哈爾濱工業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 985工程院校

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

外顯子測序分析流程圖

哈爾濱工業(yè)大學(xué)理學(xué)碩士論文-38-表3-2地中海貧血樣本SNP-InDel統(tǒng)計表樣本來源SNPnumberInDelnumberCYMZQYLWLCLZGCL477924819047697473474786940974048396940534068SNP變異和InDel變異檢測統(tǒng)計包括變異發(fā)生在基因組位置的信息和變異導(dǎo)致功能上的改變的信息。由圖3-2展示的結(jié)果，SNP在基因組上發(fā)生的主要位置集中在外顯子區(qū)域（橙色部分）和內(nèi)含子區(qū)域（灰綠色部分），兩者占據(jù)SNP總量的80%以上，總體分布比較均勻。圖3-2SNP基因位置信息統(tǒng)計圖InDel在基因組上發(fā)生的位置與SNP不同，由圖3-3可知，主要集中在內(nèi)含子區(qū)域（草綠色部分），占據(jù)了全部InDel數(shù)量的60%到70%。推測是因為InDel變異發(fā)生在外顯子區(qū)域?qū)虻木幋a表達(dá)影響較大，大概率造成不良后果，不容易遺傳保留下來。

哈爾濱工業(yè)大學(xué)理學(xué)碩士論文-39-圖3-3InDel基因位置信息統(tǒng)計圖發(fā)生在編碼區(qū)域的SNP變異對編碼基因有不同類型的影響。由圖3-4可知，主要的結(jié)果是引起非同義突變（紅色部分）和同義突變（藍(lán)色部分），二者占比超過了98%。還有小于1%的終止突變類型（綠色部分），部分突變功能未知。圖3-4編碼區(qū)域SNP基因功能信息統(tǒng)計圖


本文編號：3413264