朝倉(cāng)花椒CBL基因家族的鑒定及分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-28 09:30
通過(guò)NCBI BLAST分析,從朝倉(cāng)花椒轉(zhuǎn)錄組中鑒定獲得31條朝倉(cāng)花椒類鈣調(diào)磷酸酶B亞基蛋白(Calcineurin B-like protein,CBL)家族的編碼基因序列,將其命名為ZpCBL 1-ZpCBL 31。對(duì)該基因家族進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),朝倉(cāng)花椒的CBL基因家族在進(jìn)化上可分為4組,每組成員數(shù)量分別為16、8、5、2。該家族蛋白等電點(diǎn)均小于7,偏酸性,且較多數(shù)為不穩(wěn)定蛋白。多基因序列比對(duì)可知朝倉(cāng)花椒CBL家族均具有至少1個(gè)高度保守的EF-hand結(jié)構(gòu)域。對(duì)空間結(jié)構(gòu)的分析發(fā)現(xiàn),ZpCBL蛋白為多鏈折疊蛋白,以α螺旋為主。
【文章來(lái)源】:種子. 2020,39(11)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
植物CBL蛋白進(jìn)化樹
ZpCBL序列Logo及保守基序
ZpCBL蛋白結(jié)構(gòu)域序列比對(duì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]朝倉(cāng)花椒幾丁質(zhì)酶類似基因的克隆及分析[J]. 劉雪薇,趙懿琛,趙德剛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(04)
[2]桃鈣調(diào)磷酸酶B類似蛋白基因家族鑒定與分析[J]. 張杰偉,吳婷,任飛,謝華,魏建華. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[3]蘋果MdCBL3基因的克隆與功能鑒定[J]. 劉亞靜,馬齊軍,李浩浩,路靜,郝玉金,由春香. 園藝學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]朝倉(cāng)花椒幼芽轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)組裝及基因功能注釋[J]. 趙懿琛,劉雪微,李巖,趙德剛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(07)
[5]番茄CBL家族基因的鑒定和遺傳進(jìn)化分析[J]. 劉淑梅,王施慧,劉明毓,紀(jì)復(fù)勤,李利斌,侯麗霞. 分子植物育種. 2015(10)
[6]蘋果生長(zhǎng)素響應(yīng)因子(ARF)基因家族全基因組鑒定及表達(dá)分析[J]. 李慧峰,冉昆,何平,王海波,常源升,孫清榮,程來(lái)亮,李林光. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(07)
[7]梨CBL基因家族全基因組序列的鑒定及非生物脅迫下的表達(dá)分析[J]. 許園園,藺經(jīng),李曉剛,常有宏. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(04)
[8]植物CBL-CIPK信號(hào)系統(tǒng)的功能及其作用機(jī)理[J]. 沈金秋,鄭仲仲,潘偉槐,潘建偉. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(05)
博士論文
[1]小麥TaCBL和TaWRKY基因家族的克隆及功能分析[D]. 許琦.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]南瓜CBL和CIPK基因家族的鑒定及表達(dá)模式分析[D]. 彭昭雯.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]冰葉日中花McCBL1基因的克隆及初步功能分析[D]. 豐宇凱.浙江農(nóng)林大學(xué) 2018
[3]蜆殼花椒種子萌發(fā)的差異表達(dá)基因初步研究[D]. 楊輝.中南林業(yè)科技大學(xué) 2015
[4]花椒皮刺分化轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)據(jù)分析[D]. 蔣弘剛.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
本文編號(hào):3411655
【文章來(lái)源】:種子. 2020,39(11)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
植物CBL蛋白進(jìn)化樹
ZpCBL序列Logo及保守基序
ZpCBL蛋白結(jié)構(gòu)域序列比對(duì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]朝倉(cāng)花椒幾丁質(zhì)酶類似基因的克隆及分析[J]. 劉雪薇,趙懿琛,趙德剛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(04)
[2]桃鈣調(diào)磷酸酶B類似蛋白基因家族鑒定與分析[J]. 張杰偉,吳婷,任飛,謝華,魏建華. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[3]蘋果MdCBL3基因的克隆與功能鑒定[J]. 劉亞靜,馬齊軍,李浩浩,路靜,郝玉金,由春香. 園藝學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]朝倉(cāng)花椒幼芽轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)組裝及基因功能注釋[J]. 趙懿琛,劉雪微,李巖,趙德剛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(07)
[5]番茄CBL家族基因的鑒定和遺傳進(jìn)化分析[J]. 劉淑梅,王施慧,劉明毓,紀(jì)復(fù)勤,李利斌,侯麗霞. 分子植物育種. 2015(10)
[6]蘋果生長(zhǎng)素響應(yīng)因子(ARF)基因家族全基因組鑒定及表達(dá)分析[J]. 李慧峰,冉昆,何平,王海波,常源升,孫清榮,程來(lái)亮,李林光. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(07)
[7]梨CBL基因家族全基因組序列的鑒定及非生物脅迫下的表達(dá)分析[J]. 許園園,藺經(jīng),李曉剛,常有宏. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(04)
[8]植物CBL-CIPK信號(hào)系統(tǒng)的功能及其作用機(jī)理[J]. 沈金秋,鄭仲仲,潘偉槐,潘建偉. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(05)
博士論文
[1]小麥TaCBL和TaWRKY基因家族的克隆及功能分析[D]. 許琦.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]南瓜CBL和CIPK基因家族的鑒定及表達(dá)模式分析[D]. 彭昭雯.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]冰葉日中花McCBL1基因的克隆及初步功能分析[D]. 豐宇凱.浙江農(nóng)林大學(xué) 2018
[3]蜆殼花椒種子萌發(fā)的差異表達(dá)基因初步研究[D]. 楊輝.中南林業(yè)科技大學(xué) 2015
[4]花椒皮刺分化轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)據(jù)分析[D]. 蔣弘剛.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
本文編號(hào):3411655
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