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基于線粒體序列和單拷貝核基因序列的細(xì)葉石斛親緣地理學(xué)研究

發(fā)布時間:2021-09-22 05:26
  細(xì)葉石斛(Dendrobium hancokiiRolfe)隸屬于蘭科(Orchidaceae)石斛屬(Dendrobium),是中國特有的珍稀物種,具有很高的藥用和觀賞價值。細(xì)葉石斛的形態(tài)特征具有明顯的差異,特別是葉型,表現(xiàn)出大葉型和小葉型兩種。近年來,因人們的亂采亂挖和生境的毀壞,細(xì)葉石斛的野生資源受到嚴(yán)重的破壞。因此開展細(xì)葉石斛的親緣地理學(xué)研究不僅為石斛屬物種的進(jìn)化研究提供理論基礎(chǔ),而且可以對細(xì)葉石斛資源的利用和保護(hù)學(xué)研究提供科學(xué)依據(jù)。本研究,自2015年到2017年收集了代表細(xì)葉石斛自然分布的32個野生居群,分別來自中國中部-西北部區(qū)域(21個小葉型居群:分別來自重慶、湖北、湖南、河南、陜西、甘肅和四川等。┖椭袊髂喜繀^(qū)域(11個大葉型居群:分別來自廣西、貴州和云南。H缓蠛Y選出具有多態(tài)性的兩條線粒體片段和一條單拷貝核基因片段分析細(xì)葉石斛的進(jìn)化過程、動態(tài)歷史、時空分布和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。基于線粒體序列和單拷貝核基因序列的細(xì)葉石斛親緣地理學(xué)研究結(jié)果如下:篩選了兩條線粒體基因片段(ccb256和rpl5)和一條單拷貝核基因片段(LEAFY intron1)分別對細(xì)葉石斛32個野生居... 

【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:70 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于線粒體序列和單拷貝核基因序列的細(xì)葉石斛親緣地理學(xué)研究


圖2.1細(xì)葉石斛居群的地理分布??Fig?2.1?Geographic?distribution?of?32?populations?of?D.?hancockii??

地理分布圖,單倍型,地理分布


缺失位點(diǎn)13個,共定義30種單倍型。單倍型序列多態(tài)性位點(diǎn)見表2.3。所有的??序列都以單倍型H1作為參照。細(xì)葉石斛居群mtDNA的30種單倍型的地理分布??見表2.4和圖2.2。重慶黔江(QJ)和云南石屏(SP)這兩個居群的單倍型分布??最多,都有4種單倍型。小葉型的細(xì)葉石斛(Groupl)主要分布于中國的中部(重??慶、湖南、湖北、河南)和西北部(陜西、甘肅、四川),共有]8種單倍型。??大葉型的細(xì)葉石斛(GrouP2)主要分布于貴州、廣西和云南三省,有12種??17??

分布情況,單倍型,石斛,密花石斛


Fig?2.3?Network?of?D.?hancockii?based?on?30?haplotypes??以澳洲石斛、竹枝石斛和密花石斛為外類群,用MEGA?5.0構(gòu)建ML系統(tǒng)發(fā)??生樹(圖2.4a)。從ML樹可以看出,外類群澳洲石斛、竹枝石斛和密花石斛被??嚴(yán)格分開,各節(jié)點(diǎn)的后驗(yàn)概率都超過了?50%,各單倍型呈現(xiàn)單系或者并系的關(guān)系。??細(xì)葉石斛的30種mtDNA單倍型,分成了兩大組,分別對應(yīng)著小葉型的細(xì)葉石??斛和大葉型的細(xì)葉石斛。H8-HI8聚在-起,位于樹的頂端,對應(yīng)單倍型網(wǎng)絡(luò)??閣中的Clade?B;?H19-H24聚在一起,對應(yīng)單倍型M絡(luò)閣中的Clade?D。ML系統(tǒng)??發(fā)育樹的聚類情況與mtDNA單倍型的Network網(wǎng)絡(luò)閣的分布情況大體是一致??的。??以澳洲石斛、竹枝石斛和密花石解為外類群,用Mrbayes法構(gòu)建Bayesian??系統(tǒng)樹(圖2.4b)。從Bayesian嚴(yán)格一致樹可以看出,外類群澳洲石斛、竹枝??石斛和密花石斛被嚴(yán)格地分開。細(xì)葉石斛的30種mtDNA單倍型明顯地分成了??兩人組,分別對應(yīng)著小葉型的細(xì)葉石斛和大葉型的細(xì)葉石斛,支持率為95%。大??葉型的細(xì)葉石斛又明顯地分成了兩個分支

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3403220

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