辣椒PSY基因家族分析及CaPSY1功能研究
發(fā)布時間:2021-09-19 15:39
八氫番茄紅素合成酶(PSY,phytoene synthase)是類胡蘿卜素合成途徑的第一個限制酶,在果實發(fā)育中起著重要的作用。然而,CaPSY基因在果實成熟過程中基因組范圍內的表達模式還不清楚。本研究中,我們對辣椒中PSY基因家族進行了鑒定,并用生物信息學方法對PSY基因家族進行了分析,并對其與非生物脅迫之間的關系進行了研究。為探究CaPSY1基因在辣椒果實中的作用,我們構建了GFP熒光定位載體分析其定位情況;我們還構建了VIGS-CaPSY1沉默載體,在辣椒轉色期沉默果實CaPSY1基因,分析其表型及相關基因表達量;我們還構建了過表達載體,在擬南芥中遺傳轉化。結果如下:(1)通過已公布的辣椒遵辣1號基因組數據庫,運用Pfam數據庫和Blast等技術,我們在辣椒中共鑒定出3個同源PSY基因,對其命名CaPSY1、CaPSY2.a和CaPSY2.b。通過生物信息學分析,我們發(fā)現3個PSY基因中都只含有5個內含子,并且我們在其蛋白序列中發(fā)現8個motif,PSY基因的活性位點DXXXD只存在于motif 2和motif 3中。在對單子葉和雙子葉植物中PSY基因進化關系的研究中,我們發(fā)現C...
【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校
【文章頁數】:80 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
類胡蘿卜素合成途徑(引自[24]
員與擬南芥 PSY 基因氨基酸序列比對發(fā)現所有的基因都含有 DXXXD 保守結構域,并且該結構域高度保守(圖 2.1)。所以辣椒 PSY 基因可能與擬南芥 PSY 基因行駛相同的功能。
圖 2.2 辣椒 PSY 基因染色體定位igure 2.2 Chromosome localization of pepper PS家族結構分析構和基序分布分析能更好理解它們結構構是相似的。PSY 蛋白中鑒定出來 8 PSY1 和 CaPSY2.b,預測活性位點 DXX位點(圖 2.3)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]芒果八氫番茄紅素合成酶基因PSY的結構分析及功能預測[J]. 黃建峰,秦于玲,高愛平,趙志常,黨志國,羅睿雄,陳業(yè)淵. 西南農業(yè)學報. 2017(03)
[2]辣椒CaWRKY13基因克隆及非生物脅迫下表達分析[J]. 魏小春,姚秋菊,原玉香,趙艷艷,王志勇,姜俊,蔣武生,張曉偉. 分子植物育種. 2016(10)
[3]基于綠色熒光蛋白瞬時表達的植物亞細胞定位方法[J]. 于一帆,朱小彬,葛會敏,陳云. 江蘇農業(yè)科學. 2014(12)
[4]幾種經濟植物UFGT基因的生物信息學分析[J]. 付海輝,辛培堯,許玉蘭,劉巖,韋援教,董嬌,曹有龍,周軍. 基因組學與應用生物學. 2011(01)
[5]Tissue differential expression of lycopene β-cyclase gene in papaya[J]. RachelLSkelton,RajeswariSrinivasan,RichardManshardt,Paul H Moore,Ray Ming. Cell Research. 2006(08)
本文編號:3401883
【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校
【文章頁數】:80 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
類胡蘿卜素合成途徑(引自[24]
員與擬南芥 PSY 基因氨基酸序列比對發(fā)現所有的基因都含有 DXXXD 保守結構域,并且該結構域高度保守(圖 2.1)。所以辣椒 PSY 基因可能與擬南芥 PSY 基因行駛相同的功能。
圖 2.2 辣椒 PSY 基因染色體定位igure 2.2 Chromosome localization of pepper PS家族結構分析構和基序分布分析能更好理解它們結構構是相似的。PSY 蛋白中鑒定出來 8 PSY1 和 CaPSY2.b,預測活性位點 DXX位點(圖 2.3)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]芒果八氫番茄紅素合成酶基因PSY的結構分析及功能預測[J]. 黃建峰,秦于玲,高愛平,趙志常,黨志國,羅睿雄,陳業(yè)淵. 西南農業(yè)學報. 2017(03)
[2]辣椒CaWRKY13基因克隆及非生物脅迫下表達分析[J]. 魏小春,姚秋菊,原玉香,趙艷艷,王志勇,姜俊,蔣武生,張曉偉. 分子植物育種. 2016(10)
[3]基于綠色熒光蛋白瞬時表達的植物亞細胞定位方法[J]. 于一帆,朱小彬,葛會敏,陳云. 江蘇農業(yè)科學. 2014(12)
[4]幾種經濟植物UFGT基因的生物信息學分析[J]. 付海輝,辛培堯,許玉蘭,劉巖,韋援教,董嬌,曹有龍,周軍. 基因組學與應用生物學. 2011(01)
[5]Tissue differential expression of lycopene β-cyclase gene in papaya[J]. RachelLSkelton,RajeswariSrinivasan,RichardManshardt,Paul H Moore,Ray Ming. Cell Research. 2006(08)
本文編號:3401883
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