駱駝刺中慢生根瘤菌CCNWXJ12-2 T 鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組分析及與耐鹽相關(guān)基因功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-09-06 01:21
駱駝刺中慢生根瘤菌Mesorhizobium alhagi CCNWXJ12-2T是本實(shí)驗(yàn)室從新疆荒漠地區(qū)疏葉駱駝刺根瘤中分離得到的具有優(yōu)良抗逆性的菌株,最高能夠耐受0.8 M NaCl。為了更好的研究其耐鹽機(jī)制,本文使用RNA-Seq技術(shù),研究其在不同鹽濃度條件下轉(zhuǎn)錄組表達(dá)差異,然后選取部分差異表達(dá)基因,利用同源重組技術(shù)構(gòu)建基因敲除突變體,對(duì)突變體表型進(jìn)行檢測(cè),以進(jìn)一步研究基因功能。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果顯示,以2倍為篩選差異表達(dá)基因的閾值,在高鹽條件下,差異表達(dá)基因總數(shù)為1849個(gè),占總注釋基因數(shù)(7195)的25.7%。其中933個(gè)基因表達(dá)下調(diào),916個(gè)基因表達(dá)上調(diào)。表達(dá)上調(diào)基因主要集中在氨基酸合成及轉(zhuǎn)運(yùn)、碳水化合物轉(zhuǎn)運(yùn)及代謝、能量代謝、核糖體合成、蛋白質(zhì)翻譯等代謝過程,說明在高鹽條件下,M.alhagi XJ12-2T的能量代謝水平和蛋白合成能力都有所提高。同時(shí),大部分與抗氧化相關(guān)基因的表達(dá)有不同程度的升高,說明在高鹽條件下,該菌的抗氧化能力有一定程度的提高。下調(diào)基因主要富集在膜轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)代謝通路,該菌中幾種常見的蛋白分泌系統(tǒng),如第二套三型分泌...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:117 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1分布于荒漠地區(qū)的駱駝刺Fig1-1Adhagispars扣diaindesertarea
4 駱駝刺中慢生根瘤菌 CCNWXJ12-2T鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組分析及與耐鹽相關(guān)基因功能研究例如脯氨酸、四氫嘧啶、甘氨酸甜菜堿等(Gouffi et al. 2000)。微生物往往能夠利用多種親和性溶質(zhì)或滲透保護(hù)物來應(yīng)對(duì)高滲條件,以便在不同的營(yíng)養(yǎng)條件下對(duì)高滲脅迫做出響應(yīng)。下面對(duì)幾種常見親和性溶質(zhì)和滲透保護(hù)物進(jìn)行具體介紹。
圖 1-3 以葡萄糖為底物合成海藻糖途徑Fig 1-3 Trehalose synthesis pathway using glucose as substrate圖 1-4 以淀粉為底物合成海藻糖途徑Fig 1-4 Trehalose synthesis pathway using starch as substrate露醇 在高鹽條件下,Acinetobacter baylyi 能夠通過累積谷氨酸及甘外壓力。對(duì)該菌的進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)了一個(gè)受高鹽條件誘導(dǎo)的基,因甘(mltD)基因,該酶能夠催化甘露醇的合成。甘露醇不僅對(duì)微生物耐,同時(shí)也能為微生物的新陳代謝貯存能量,并且能夠抑制微生物e oxygen species, ROS)的活力(Meena et al. 2015)。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),甘露醇瘤菌的親和性溶質(zhì)(Fernandez-Aunion et al. 2010)。氨酸 脯氨酸在滲透保護(hù)中的重要作用是在滲透調(diào)節(jié)領(lǐng)域的重大發(fā)現(xiàn)ia coli K12 中發(fā)現(xiàn)三個(gè)與脯氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān)的基因,putP、 proP 和 p
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]土壤鹽堿化的災(zāi)害學(xué)定義及其風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)體系[J]. 谷洪彪,姜紀(jì)沂. 災(zāi)害學(xué). 2013(01)
[2]中國(guó)荒漠化防治標(biāo)準(zhǔn)化發(fā)展現(xiàn)狀與展望[J]. 崔向慧,盧琦. 干旱區(qū)研究. 2012(05)
[3]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[4]駱駝刺幼苗生長(zhǎng)特性對(duì)不同地下水埋深的響應(yīng)[J]. 劉波,曾凡江,郭海峰,曾杰. 生態(tài)學(xué)雜志. 2009(02)
[5]遏制土壤鹽堿化、荒漠化的必要性及技術(shù)進(jìn)展[J]. 彭津琴,劉永強(qiáng),楊玉芳,吳琛. 天津農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(04)
[6]甘肅中西部豆科植物根瘤菌多樣性調(diào)查研究[J]. 陳衛(wèi)民,張執(zhí)欣,張宏昌,韋革宏. 干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2006(01)
[7]原核生物的sigma因子[J]. 楊明,李權(quán)勝. 河南醫(yī)學(xué)研究. 1999(01)
[8]夏季灌溉對(duì)駱駝刺形態(tài)學(xué)特征、群落生態(tài)結(jié)構(gòu)和天然更新的影響[J]. 張立運(yùn),買買提,安尼瓦爾,夏陽(yáng). 干旱區(qū)研究. 1995(04)
本文編號(hào):3386451
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:117 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1分布于荒漠地區(qū)的駱駝刺Fig1-1Adhagispars扣diaindesertarea
4 駱駝刺中慢生根瘤菌 CCNWXJ12-2T鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組分析及與耐鹽相關(guān)基因功能研究例如脯氨酸、四氫嘧啶、甘氨酸甜菜堿等(Gouffi et al. 2000)。微生物往往能夠利用多種親和性溶質(zhì)或滲透保護(hù)物來應(yīng)對(duì)高滲條件,以便在不同的營(yíng)養(yǎng)條件下對(duì)高滲脅迫做出響應(yīng)。下面對(duì)幾種常見親和性溶質(zhì)和滲透保護(hù)物進(jìn)行具體介紹。
圖 1-3 以葡萄糖為底物合成海藻糖途徑Fig 1-3 Trehalose synthesis pathway using glucose as substrate圖 1-4 以淀粉為底物合成海藻糖途徑Fig 1-4 Trehalose synthesis pathway using starch as substrate露醇 在高鹽條件下,Acinetobacter baylyi 能夠通過累積谷氨酸及甘外壓力。對(duì)該菌的進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)了一個(gè)受高鹽條件誘導(dǎo)的基,因甘(mltD)基因,該酶能夠催化甘露醇的合成。甘露醇不僅對(duì)微生物耐,同時(shí)也能為微生物的新陳代謝貯存能量,并且能夠抑制微生物e oxygen species, ROS)的活力(Meena et al. 2015)。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),甘露醇瘤菌的親和性溶質(zhì)(Fernandez-Aunion et al. 2010)。氨酸 脯氨酸在滲透保護(hù)中的重要作用是在滲透調(diào)節(jié)領(lǐng)域的重大發(fā)現(xiàn)ia coli K12 中發(fā)現(xiàn)三個(gè)與脯氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān)的基因,putP、 proP 和 p
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]土壤鹽堿化的災(zāi)害學(xué)定義及其風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)體系[J]. 谷洪彪,姜紀(jì)沂. 災(zāi)害學(xué). 2013(01)
[2]中國(guó)荒漠化防治標(biāo)準(zhǔn)化發(fā)展現(xiàn)狀與展望[J]. 崔向慧,盧琦. 干旱區(qū)研究. 2012(05)
[3]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[4]駱駝刺幼苗生長(zhǎng)特性對(duì)不同地下水埋深的響應(yīng)[J]. 劉波,曾凡江,郭海峰,曾杰. 生態(tài)學(xué)雜志. 2009(02)
[5]遏制土壤鹽堿化、荒漠化的必要性及技術(shù)進(jìn)展[J]. 彭津琴,劉永強(qiáng),楊玉芳,吳琛. 天津農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(04)
[6]甘肅中西部豆科植物根瘤菌多樣性調(diào)查研究[J]. 陳衛(wèi)民,張執(zhí)欣,張宏昌,韋革宏. 干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2006(01)
[7]原核生物的sigma因子[J]. 楊明,李權(quán)勝. 河南醫(yī)學(xué)研究. 1999(01)
[8]夏季灌溉對(duì)駱駝刺形態(tài)學(xué)特征、群落生態(tài)結(jié)構(gòu)和天然更新的影響[J]. 張立運(yùn),買買提,安尼瓦爾,夏陽(yáng). 干旱區(qū)研究. 1995(04)
本文編號(hào):3386451
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3386451.html
最近更新
教材專著