洋蔥AcSKP1基因的克
發(fā)布時(shí)間:2021-08-29 17:47
洋蔥(Allium cepa L.)是全球主要的商業(yè)化蔬菜作物,至少有139個(gè)國(guó)家種植。洋蔥基因組巨大,分子生物學(xué)基礎(chǔ)領(lǐng)域研究相對(duì)薄弱,特別是關(guān)于洋蔥功能性基因的研究甚少。S期激酶蛋白SKP1(S-phase kinase-associated-protein 1)是普遍存在于真核生物中的一類(lèi)小分子量蛋白質(zhì),其主要生物學(xué)功能在于參與了SCF復(fù)合體的形成,通過(guò)26S蛋白酶途徑調(diào)控生物體內(nèi)泛素介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解,參與了包括植物花粉發(fā)育在內(nèi)的多個(gè)生物過(guò)程。本研究主要以洋蔥恢復(fù)系(DH17)和不育系(230)為材料,利用染色體步移、RACE試驗(yàn)、序列比對(duì)分析、農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化等分子生物學(xué)方法,初步闡明了洋蔥AcSKP1基因在洋蔥可育系和不育系中存在可變剪接現(xiàn)象,并且初步進(jìn)行了AcSKP1基因啟動(dòng)子的功能驗(yàn)證。在此基礎(chǔ)上開(kāi)發(fā)了一個(gè)穩(wěn)定高效的洋蔥Ms位點(diǎn)的SSR分子標(biāo)記(WH-SSR-1),已成功的應(yīng)用于育種實(shí)踐。本研究結(jié)果如下:(1)克隆了洋蔥AcSKP1基因的全長(zhǎng)序列,恢復(fù)系材料(DH17)含有5659 bp,不育系材料(230)含有5636 bp,比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),恢復(fù)系和不育系材料之間存在大...
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
利用WH-SSR-1標(biāo)記直接從OP群體中篩選保持株和不育株Figure1ScreeningofmaintainerandsterileplantsdirectlyfromtheOPpopulationusingtheWH-SSR-1marker
洋蔥 AcSKP1 基因的克隆、轉(zhuǎn)錄特性及其在育種中的應(yīng)用 結(jié)果與分析.1 洋蔥總 DNA 和 RNA 提取的結(jié)果由圖 2 洋蔥總 RNA 電泳條帶可以得出,點(diǎn)樣孔干凈,表示無(wú)蛋白質(zhì)或多糖的殘留 DNA 條帶,表明幾乎沒(méi)有 DNA 殘留;28 S 和 18 S 條帶清晰,并且可以看出 28 S度大約為 18 S 亮度的兩倍,說(shuō)明 RNA 樣本完整性好。有圖中洋蔥總 DNA 電泳可出,洋蔥總 DNA 片段約為 23 kb,條帶較清晰,并未發(fā)現(xiàn)條帶彌散或降解,表示可本試驗(yàn)的需要。
圖 3 AcSKP1 序列基因預(yù)測(cè)的結(jié)果a:恢復(fù)系(DH17)AcSKP1 序列基因;b:不育系(230)AcSKP1 序列基因Figure 3 Results ofAcSKP1 sequence gene predictiona: Restore line (DH17)AcSKP1 sequence gene; b: Sterile line (230)AcSKP1 sequence gene表 18 引物名稱(chēng)及組合Table18 Primer name and combination組合 Exon3-1LP Exon4-1LP Exon6-1LP Exon7-1LP Exon8-1LP Exon9-1LP Exon10-PolyALPExon1-1UP 385 519 738 827 992 1056 ﹥1000Exon2-1UP 285 419 638 727 892 956 ﹥900Exon3-1UP NA 169 388 477 642 706 ~700Exon4-1UP NA NA 245 334 495 559 ~550Exon5-1UP NA NA 138 227 388 452 ~450Exon6-1UP NA NA NA 133 294 358 ~350Exon7-1UP NA NA NA NA 140 204 ~200Exon8-1UP NA NA NA NA NA 131 ~150
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]洋蔥CMS-T型育性分子標(biāo)記的篩選與鑒定[J]. 潘美紅,楊海峰,惠林沖,薛萍,張新圣,繆美華,陳振泰. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(04)
[2]草莓FaSKP1-1基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 殷姍姍,李茂福,王華,李洋,張秋雷,金萬(wàn)梅,李天忠. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(12)
[3]棉花GhGT-2轉(zhuǎn)錄因子的克隆及其功能分析[J]. 李月,劉曉東,謝宗銘,董永梅,武冬梅,陳受宜. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(24)
[4]豬SKP1基因的克隆及其在梅山豬與杜洛克豬卵泡中的表達(dá)研究[J]. 徐夢(mèng)思,黃濤,劉麗娟,楊飛,魯慧文,翟騰蛟,陳亞楠. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(07)
[5]調(diào)控細(xì)胞活動(dòng)不可或缺的重要分子——F-box蛋白[J]. 鄭鴻平,李逸平. 生命的化學(xué). 2011(05)
[6]巴西橡膠樹(shù)乳管細(xì)胞HbSKP1基因克隆及原核表達(dá)[J]. 馬瑞豐,王立豐,彭世清,田維敏. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2010(08)
[7]SSR標(biāo)記在玉米遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 孫琦,孟昭東,張發(fā)軍,丁照華,張慶偉. 玉米科學(xué). 2006(01)
[8]RAPD分子標(biāo)記技術(shù)及其在十字花科蔬菜研究中的應(yīng)用[J]. 胡學(xué)軍,邱正明,李金泉. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2005(03)
[9]DNA分子標(biāo)記及其在谷子遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 王軍,謝皓,郭二虎,李?lèi)?ài)軍,范慧萍. 北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào). 2005(01)
[10]RAPD分子標(biāo)記技術(shù)在蔬菜研究中的應(yīng)用[J]. 鄧儉英,劉忠,康德賢,方鋒學(xué). 種子. 2005(03)
博士論文
[1]抗根結(jié)線(xiàn)蟲(chóng)基因的克隆、遺傳轉(zhuǎn)化及黑籽南瓜再生體系的建立[D]. 霍雨猛.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]洋蔥果膠甲酯酶基因AcPME的克隆、原核表達(dá)及亞細(xì)胞定位[D]. 孫亞玲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]云南農(nóng)業(yè)大學(xué)滇型雜交水稻優(yōu)勢(shì)利用技術(shù)發(fā)展史研究[D]. 閻祺鵬.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]低溫處理對(duì)菜心花粉發(fā)育及相關(guān)基因表達(dá)的影響[D]. 劉丹丹.浙江大學(xué) 2016
[4]白菜花粉發(fā)育和授粉受精相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA的鑒定方法[D]. 張芳.浙江大學(xué) 2015
[5]小粒野生稻OmSKP1的點(diǎn)突變蛋白表達(dá)純化與體外互作的初步分析[D]. 范錫麟.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]洋蔥A、B、C、E功能MADS-box基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 黃赫.東北林業(yè)大學(xué) 2013
[7]擬南芥干旱誘導(dǎo)型啟動(dòng)子的克隆及功能分析[D]. 吳憲.吉林大學(xué) 2013
[8]我國(guó)雜交水稻育種技術(shù)的傳播研究[D]. 李小玉.湖南大學(xué) 2011
[9]小麥雄性不育相關(guān)基因SKP1的克隆與表達(dá)分析[D]. 宋瑜龍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2011
本文編號(hào):3371102
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:77 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
利用WH-SSR-1標(biāo)記直接從OP群體中篩選保持株和不育株Figure1ScreeningofmaintainerandsterileplantsdirectlyfromtheOPpopulationusingtheWH-SSR-1marker
洋蔥 AcSKP1 基因的克隆、轉(zhuǎn)錄特性及其在育種中的應(yīng)用 結(jié)果與分析.1 洋蔥總 DNA 和 RNA 提取的結(jié)果由圖 2 洋蔥總 RNA 電泳條帶可以得出,點(diǎn)樣孔干凈,表示無(wú)蛋白質(zhì)或多糖的殘留 DNA 條帶,表明幾乎沒(méi)有 DNA 殘留;28 S 和 18 S 條帶清晰,并且可以看出 28 S度大約為 18 S 亮度的兩倍,說(shuō)明 RNA 樣本完整性好。有圖中洋蔥總 DNA 電泳可出,洋蔥總 DNA 片段約為 23 kb,條帶較清晰,并未發(fā)現(xiàn)條帶彌散或降解,表示可本試驗(yàn)的需要。
圖 3 AcSKP1 序列基因預(yù)測(cè)的結(jié)果a:恢復(fù)系(DH17)AcSKP1 序列基因;b:不育系(230)AcSKP1 序列基因Figure 3 Results ofAcSKP1 sequence gene predictiona: Restore line (DH17)AcSKP1 sequence gene; b: Sterile line (230)AcSKP1 sequence gene表 18 引物名稱(chēng)及組合Table18 Primer name and combination組合 Exon3-1LP Exon4-1LP Exon6-1LP Exon7-1LP Exon8-1LP Exon9-1LP Exon10-PolyALPExon1-1UP 385 519 738 827 992 1056 ﹥1000Exon2-1UP 285 419 638 727 892 956 ﹥900Exon3-1UP NA 169 388 477 642 706 ~700Exon4-1UP NA NA 245 334 495 559 ~550Exon5-1UP NA NA 138 227 388 452 ~450Exon6-1UP NA NA NA 133 294 358 ~350Exon7-1UP NA NA NA NA 140 204 ~200Exon8-1UP NA NA NA NA NA 131 ~150
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]洋蔥CMS-T型育性分子標(biāo)記的篩選與鑒定[J]. 潘美紅,楊海峰,惠林沖,薛萍,張新圣,繆美華,陳振泰. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(04)
[2]草莓FaSKP1-1基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 殷姍姍,李茂福,王華,李洋,張秋雷,金萬(wàn)梅,李天忠. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(12)
[3]棉花GhGT-2轉(zhuǎn)錄因子的克隆及其功能分析[J]. 李月,劉曉東,謝宗銘,董永梅,武冬梅,陳受宜. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(24)
[4]豬SKP1基因的克隆及其在梅山豬與杜洛克豬卵泡中的表達(dá)研究[J]. 徐夢(mèng)思,黃濤,劉麗娟,楊飛,魯慧文,翟騰蛟,陳亞楠. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2015(07)
[5]調(diào)控細(xì)胞活動(dòng)不可或缺的重要分子——F-box蛋白[J]. 鄭鴻平,李逸平. 生命的化學(xué). 2011(05)
[6]巴西橡膠樹(shù)乳管細(xì)胞HbSKP1基因克隆及原核表達(dá)[J]. 馬瑞豐,王立豐,彭世清,田維敏. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2010(08)
[7]SSR標(biāo)記在玉米遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 孫琦,孟昭東,張發(fā)軍,丁照華,張慶偉. 玉米科學(xué). 2006(01)
[8]RAPD分子標(biāo)記技術(shù)及其在十字花科蔬菜研究中的應(yīng)用[J]. 胡學(xué)軍,邱正明,李金泉. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2005(03)
[9]DNA分子標(biāo)記及其在谷子遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 王軍,謝皓,郭二虎,李?lèi)?ài)軍,范慧萍. 北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào). 2005(01)
[10]RAPD分子標(biāo)記技術(shù)在蔬菜研究中的應(yīng)用[J]. 鄧儉英,劉忠,康德賢,方鋒學(xué). 種子. 2005(03)
博士論文
[1]抗根結(jié)線(xiàn)蟲(chóng)基因的克隆、遺傳轉(zhuǎn)化及黑籽南瓜再生體系的建立[D]. 霍雨猛.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]洋蔥果膠甲酯酶基因AcPME的克隆、原核表達(dá)及亞細(xì)胞定位[D]. 孫亞玲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]云南農(nóng)業(yè)大學(xué)滇型雜交水稻優(yōu)勢(shì)利用技術(shù)發(fā)展史研究[D]. 閻祺鵬.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]低溫處理對(duì)菜心花粉發(fā)育及相關(guān)基因表達(dá)的影響[D]. 劉丹丹.浙江大學(xué) 2016
[4]白菜花粉發(fā)育和授粉受精相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA的鑒定方法[D]. 張芳.浙江大學(xué) 2015
[5]小粒野生稻OmSKP1的點(diǎn)突變蛋白表達(dá)純化與體外互作的初步分析[D]. 范錫麟.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]洋蔥A、B、C、E功能MADS-box基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 黃赫.東北林業(yè)大學(xué) 2013
[7]擬南芥干旱誘導(dǎo)型啟動(dòng)子的克隆及功能分析[D]. 吳憲.吉林大學(xué) 2013
[8]我國(guó)雜交水稻育種技術(shù)的傳播研究[D]. 李小玉.湖南大學(xué) 2011
[9]小麥雄性不育相關(guān)基因SKP1的克隆與表達(dá)分析[D]. 宋瑜龍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2011
本文編號(hào):3371102
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