EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化對肺部良惡性腫瘤的鑒別
發(fā)布時間:2021-08-29 00:19
目的:使用基因甲基化芯片技術,篩選出鑒別肺部良惡性腫瘤之間的基因甲基化標志物。驗證EVX2和ZNF577基因在標本組織及血漿中的甲基化狀態(tài),探討該基因啟動子甲基化狀態(tài)與患者的病理類型、病理分期、性別、年齡、吸煙、飲酒等之間的關系。材料與方法:本研究共收集肺部腫瘤標本60例,其中非小細胞肺癌標本40例,肺部良性結節(jié)標本20例。肺癌組織標本為實驗組,癌旁組織及肺部良性結節(jié)組織為對照組,進行如下實驗操作:(1)基因甲基化芯片測序,選定目的基因;(2)分別提取組織DNA和血漿游離DNA;(3)紫外分光光度計檢測DNA的濃度及純度,1%瓊脂糖凝膠電泳質檢;(4)DNA標本甲基化處理,2.5%瓊脂糖凝膠電泳對目的基因啟動子甲基化狀態(tài)進行判讀;(5)運用spss24.0軟件進行統(tǒng)計學分析。結果:1.確定目的基因為EVX2和ZNF577,肺癌組織中目的基因啟動子甲基化狀態(tài)與對應的癌旁組織及肺部良性結節(jié)組織之間的差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。2.肺癌血漿游離DNA中EVX2和ZNF577基因甲基化狀態(tài)與肺部良性結節(jié)血漿之間的差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。3.肺癌組織EVX2和ZN...
【文章來源】:寧夏醫(yī)科大學寧夏回族自治區(qū)
【文章頁數】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
基因樹聚類分析(130個探針)
寧夏醫(yī)科大學碩士學位論文結果21圖3目的基因ZNF577EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化引物及非甲基化引物(表8)均從MethPrimer網站設計,并且從肺癌A549細胞株及部分肺癌組織驗證其特異性。表8甲基化及非甲基化引物設計結果引物名稱上游引物5`-3`下游引物5`-3`退火溫度/℃片段長度/bpEVX2MAGAATTTTTCGTTAAGGGTAAATTCCTAAATAATAACCCGACTTCTTACG65.7129EVX2UAATTTTTTGTTAAGGGTAAATTTGAAAATAATAACCCAACTTCTTACAAC64.5127ZNF577MTTGAAATTTTTGTAAGATTGTCGCCTTTACAACATTAACCAAAAACGCT64.3171ZNF577UTGAAATTTTTGTAAGATTGTTGTGTCTTTACAACATTAACCAAAAACACT63.4170
寧夏醫(yī)科大學碩士學位論文結果224.EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化凝膠電泳驗證結果:EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化在肺癌組織及癌旁組織、肺部良性結節(jié)組織及結節(jié)旁組織中甲基化狀態(tài)、實驗中陽性對照及陰性對照的結果。我們用MSP技術對全部60對肺組織(40對肺癌組織和20對肺部良性結節(jié)組織)及配對的血漿標本中EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化狀態(tài)檢測,40對肺癌組織中28例(70.0%)EVX2基因啟動子呈甲基化狀態(tài),23例(57.5%)ZNF577基因啟動子呈甲基化的狀態(tài),20例肺部良性結節(jié)組織中EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化各1例(5.0%),40例肺癌血漿中有23例(57.5%)EVX2基因呈甲基化狀態(tài),12例(30.0%)ZNF577基因呈甲基化狀態(tài),20例肺良性組織血漿中EVX2和ZNF577基因甲基化各有1例(5.0%),其中部分甲基化PCR結果如下圖(圖4-圖13)。圖4EVX2基因甲基化狀態(tài)在肺癌中的凝膠電泳圖(1)圖5EVX2基因甲基化狀態(tài)在肺癌中的凝膠電泳圖(2)圖6EVX2基因甲基化狀態(tài)在肺癌中的凝膠電泳圖(3)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國肺癌和煙草流行及控煙現狀[J]. 鄒小農,賈漫漫,王鑫,支修益. 中國肺癌雜志. 2017(08)
[2]中國癌癥發(fā)病、死亡現狀與趨勢分析[J]. 曾倩,崔芳芳,宇傳華,張干深. 中國衛(wèi)生統(tǒng)計. 2016(02)
本文編號:3369514
【文章來源】:寧夏醫(yī)科大學寧夏回族自治區(qū)
【文章頁數】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
基因樹聚類分析(130個探針)
寧夏醫(yī)科大學碩士學位論文結果21圖3目的基因ZNF577EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化引物及非甲基化引物(表8)均從MethPrimer網站設計,并且從肺癌A549細胞株及部分肺癌組織驗證其特異性。表8甲基化及非甲基化引物設計結果引物名稱上游引物5`-3`下游引物5`-3`退火溫度/℃片段長度/bpEVX2MAGAATTTTTCGTTAAGGGTAAATTCCTAAATAATAACCCGACTTCTTACG65.7129EVX2UAATTTTTTGTTAAGGGTAAATTTGAAAATAATAACCCAACTTCTTACAAC64.5127ZNF577MTTGAAATTTTTGTAAGATTGTCGCCTTTACAACATTAACCAAAAACGCT64.3171ZNF577UTGAAATTTTTGTAAGATTGTTGTGTCTTTACAACATTAACCAAAAACACT63.4170
寧夏醫(yī)科大學碩士學位論文結果224.EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化凝膠電泳驗證結果:EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化在肺癌組織及癌旁組織、肺部良性結節(jié)組織及結節(jié)旁組織中甲基化狀態(tài)、實驗中陽性對照及陰性對照的結果。我們用MSP技術對全部60對肺組織(40對肺癌組織和20對肺部良性結節(jié)組織)及配對的血漿標本中EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化狀態(tài)檢測,40對肺癌組織中28例(70.0%)EVX2基因啟動子呈甲基化狀態(tài),23例(57.5%)ZNF577基因啟動子呈甲基化的狀態(tài),20例肺部良性結節(jié)組織中EVX2和ZNF577基因啟動子甲基化各1例(5.0%),40例肺癌血漿中有23例(57.5%)EVX2基因呈甲基化狀態(tài),12例(30.0%)ZNF577基因呈甲基化狀態(tài),20例肺良性組織血漿中EVX2和ZNF577基因甲基化各有1例(5.0%),其中部分甲基化PCR結果如下圖(圖4-圖13)。圖4EVX2基因甲基化狀態(tài)在肺癌中的凝膠電泳圖(1)圖5EVX2基因甲基化狀態(tài)在肺癌中的凝膠電泳圖(2)圖6EVX2基因甲基化狀態(tài)在肺癌中的凝膠電泳圖(3)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國肺癌和煙草流行及控煙現狀[J]. 鄒小農,賈漫漫,王鑫,支修益. 中國肺癌雜志. 2017(08)
[2]中國癌癥發(fā)病、死亡現狀與趨勢分析[J]. 曾倩,崔芳芳,宇傳華,張干深. 中國衛(wèi)生統(tǒng)計. 2016(02)
本文編號:3369514
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