中國小家鼠Y染色體特異性基因(Zfy1,Zfy2)的遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-28 16:59
小家鼠(Mus musculus)屬嚙齒目(Rodentia)、鼠科(Muridae)、小家鼠屬(Mus),是人類伴生種,分布于世界各個(gè)地區(qū)。野生小家鼠及其實(shí)驗(yàn)室品系,在生物學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中有廣泛應(yīng)用。Y染色體嚴(yán)格遵循父系遺傳,其演化機(jī)制一直是物種演化領(lǐng)域重要的研究課題之一。ZFY基因作為Y染色體上重要的雄性特異性基因,在精子形成及精子發(fā)育過程中起到了重要作用,其基因特征及種群遺傳結(jié)構(gòu)對于我們了解雄性特異基因的演化機(jī)制有重要價(jià)值。本論文中,我們對來自全國21個(gè)地區(qū)的野生小家鼠Zfy1/Zfy2基因進(jìn)行序列擴(kuò)增、測序及序列特征和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析。實(shí)驗(yàn)中共得到來自21個(gè)地區(qū)的251條長度為561bp的Zfy1序列和來自21個(gè)地區(qū)的251條長度為583bp的Zfy2序列。針對序列進(jìn)行的后續(xù)分析顯示:1)Zfy1/Zfy2序列片段的堿基組成平均為A25.1%/28.2%、T 39.6%/36.1%、G 20.7%/20.6%、C 14.6%/15.1%,兩個(gè)基因序列堿基含量有微小差異;Zfy1/Zfy2序列共檢出變異位點(diǎn)(V)25/24個(gè),將序列定義為29/28個(gè)單倍型(H);2)不同地理種...
【文章來源】:魯東大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
Y染色體結(jié)構(gòu)(BachtrogD.2013)
魯東大學(xué)碩士學(xué)位論文152.1.2DNA提取實(shí)驗(yàn)前先提前將采集的樣品從超低溫冰箱中取出進(jìn)行解凍,防止DNA的降解及取及用避免在室溫下放置時(shí)間過長。DNA提取主要為粉碎,消化,提取,清洗等步驟。使用上海生工所售的Promega試劑盒。具體過程見表2.2。2.1.3PCR擴(kuò)增使用的引物由上海生工生物公司設(shè)計(jì)并由其合成。合成引物呈粉末狀,使用時(shí)根據(jù)說明進(jìn)行稀釋,并在總樣品中吸取10μL置于潔凈離心管中進(jìn)行備用,其余引物防止降解置于冰箱保存。在正式PCR擴(kuò)增前通過梯度PCR選定Zfy1/Zfy2引物最適退火溫度及時(shí)間。表2.3為本次實(shí)驗(yàn)中是用的兩組引物序列。圖2.1小家鼠樣品各采集地區(qū)分布Fig2.1ThecollectionrecordsofM.musculus
中國小家鼠Y染色體特異性基因(Zfy1,Zfy2)的遺傳多樣性分析18圖2.2部分小家鼠DNA提取產(chǎn)物電泳圖Fig2.2TheresultsofgenomicDNAextraction圖2.3部分小家鼠PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Fig2.3PCRamplificationproductselectrophoresisbasedonZFYgene注:M:DNAMarkerDL2000,K:空白對照樣品選出寄送至上海生工進(jìn)行純化和測序,測序結(jié)果的峰圖如圖所示。圖2.4ZFY基因擴(kuò)增產(chǎn)物測序圖片段Fig2.4ZFYgeneDNAsequencingresults2.2數(shù)據(jù)處理與分析2.2.1序列處理將測序結(jié)果通過Chromas軟件查看峰圖結(jié)果。注意檢查序列中是否有雙峰現(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]3個(gè)群體小家鼠Sry基因序列分析[J]. 王金鵬,楊曉瑩,于立強(qiáng),靖美東. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(11)
[2]冠狀動(dòng)脈介入治療患者感染MRSA耐藥性及毒力基因分布研究[J]. 趙英麗,何繼強(qiáng). 中國病原生物學(xué)雜志. 2016(12)
[3]利用Y染色體進(jìn)行鹿科動(dòng)物的起源和進(jìn)化分析[J]. 蘇瑩,鞠貴春,邵元臣,王洪亮,邢秀梅,高兵,常彤. 特產(chǎn)研究. 2016(01)
[4]人類Y染色體的演化[J]. 楊仙榮,王美琴,李少華. 遺傳. 2014(09)
[5]2013年中國植物科學(xué)若干領(lǐng)域重要研究進(jìn)展[J]. 袁明,瞿禮嘉,王小菁,錢前,楊維才,王臺,孔宏智,蔣高明,種康. 植物學(xué)報(bào). 2014(04)
[6]絨山羊DBY基因的BAC篩選與序列分析[J]. 肖紅梅,肖旭,劉志紅,李金泉. 生物技術(shù)通報(bào). 2013(07)
[7]Y染色體與基因家譜[J]. 李輝. 世界科學(xué). 2013(02)
[8]Y染色體的分子結(jié)構(gòu)和多態(tài)性研究與應(yīng)用[J]. 張羽. 生命科學(xué)研究. 2009(02)
[9]SRY基因研究進(jìn)展及其在動(dòng)物性別鑒定中的應(yīng)用[J]. 孫偉麗,李光玉,鐘偉,常忠娟. 黑龍江動(dòng)物繁殖. 2008(03)
[10]小鼠屬(Mus)與田鼠屬(Microtus)的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系研究概述[J]. 張新蕊,相學(xué)軍,陳艷秋,劉煥民,王宇峰,閆楠,朱必才. 遺傳. 2008(05)
博士論文
[1]利用Y染色體遺傳多樣性對中國家馬起源的研究[D]. 劉書琴.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]異齒亞綱貝類DNA條形碼與系統(tǒng)發(fā)生學(xué)研究[D]. 于貞貞.中國海洋大學(xué) 2014
[3]新疆兔屬物種的群體遺傳學(xué)及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系[D]. 單文娟.新疆大學(xué) 2011
碩士論文
[1]中國小家鼠(Mus musculus)TLR2基因的遺傳多樣性研究[D]. 孫曉敏.魯東大學(xué) 2018
[2]基于線粒體和核基因序列分析單環(huán)刺螠(Urechis unicinctus)種群遺傳多樣性[D]. 宮杰.魯東大學(xué) 2018
[3]團(tuán)頭魴Toll樣受體基因序列分析及其表達(dá)研究[D]. 賴瑞芳.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]中國家養(yǎng)雙峰駝Y染色體SNP、STR、CNV與父系起源研究[D]. 陳慧玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[5]中國小家鼠線粒體全基因組序列分析[D]. 徐健.魯東大學(xué) 2014
[6]海南兔的線粒體基因組結(jié)構(gòu)特征與系統(tǒng)演化初探[D]. 王曉明.山東大學(xué) 2012
[7]基于常染色體、Y染色體、線粒體序列解析中國野生小家鼠亞種進(jìn)化[D]. 蔡慧強(qiáng).東華大學(xué) 2012
[8]Zfy基因干擾對小鼠性別控制的研究[D]. 彭強(qiáng).石河子大學(xué) 2011
[9]人類性染色體DNA回文序列分析[D]. 蔣虎.蘭州大學(xué) 2011
[10]自適應(yīng)協(xié)同進(jìn)化模型及應(yīng)用[D]. 張桂娟.山東師范大學(xué) 2006
本文編號:3368902
【文章來源】:魯東大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
Y染色體結(jié)構(gòu)(BachtrogD.2013)
魯東大學(xué)碩士學(xué)位論文152.1.2DNA提取實(shí)驗(yàn)前先提前將采集的樣品從超低溫冰箱中取出進(jìn)行解凍,防止DNA的降解及取及用避免在室溫下放置時(shí)間過長。DNA提取主要為粉碎,消化,提取,清洗等步驟。使用上海生工所售的Promega試劑盒。具體過程見表2.2。2.1.3PCR擴(kuò)增使用的引物由上海生工生物公司設(shè)計(jì)并由其合成。合成引物呈粉末狀,使用時(shí)根據(jù)說明進(jìn)行稀釋,并在總樣品中吸取10μL置于潔凈離心管中進(jìn)行備用,其余引物防止降解置于冰箱保存。在正式PCR擴(kuò)增前通過梯度PCR選定Zfy1/Zfy2引物最適退火溫度及時(shí)間。表2.3為本次實(shí)驗(yàn)中是用的兩組引物序列。圖2.1小家鼠樣品各采集地區(qū)分布Fig2.1ThecollectionrecordsofM.musculus
中國小家鼠Y染色體特異性基因(Zfy1,Zfy2)的遺傳多樣性分析18圖2.2部分小家鼠DNA提取產(chǎn)物電泳圖Fig2.2TheresultsofgenomicDNAextraction圖2.3部分小家鼠PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Fig2.3PCRamplificationproductselectrophoresisbasedonZFYgene注:M:DNAMarkerDL2000,K:空白對照樣品選出寄送至上海生工進(jìn)行純化和測序,測序結(jié)果的峰圖如圖所示。圖2.4ZFY基因擴(kuò)增產(chǎn)物測序圖片段Fig2.4ZFYgeneDNAsequencingresults2.2數(shù)據(jù)處理與分析2.2.1序列處理將測序結(jié)果通過Chromas軟件查看峰圖結(jié)果。注意檢查序列中是否有雙峰現(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]3個(gè)群體小家鼠Sry基因序列分析[J]. 王金鵬,楊曉瑩,于立強(qiáng),靖美東. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(11)
[2]冠狀動(dòng)脈介入治療患者感染MRSA耐藥性及毒力基因分布研究[J]. 趙英麗,何繼強(qiáng). 中國病原生物學(xué)雜志. 2016(12)
[3]利用Y染色體進(jìn)行鹿科動(dòng)物的起源和進(jìn)化分析[J]. 蘇瑩,鞠貴春,邵元臣,王洪亮,邢秀梅,高兵,常彤. 特產(chǎn)研究. 2016(01)
[4]人類Y染色體的演化[J]. 楊仙榮,王美琴,李少華. 遺傳. 2014(09)
[5]2013年中國植物科學(xué)若干領(lǐng)域重要研究進(jìn)展[J]. 袁明,瞿禮嘉,王小菁,錢前,楊維才,王臺,孔宏智,蔣高明,種康. 植物學(xué)報(bào). 2014(04)
[6]絨山羊DBY基因的BAC篩選與序列分析[J]. 肖紅梅,肖旭,劉志紅,李金泉. 生物技術(shù)通報(bào). 2013(07)
[7]Y染色體與基因家譜[J]. 李輝. 世界科學(xué). 2013(02)
[8]Y染色體的分子結(jié)構(gòu)和多態(tài)性研究與應(yīng)用[J]. 張羽. 生命科學(xué)研究. 2009(02)
[9]SRY基因研究進(jìn)展及其在動(dòng)物性別鑒定中的應(yīng)用[J]. 孫偉麗,李光玉,鐘偉,常忠娟. 黑龍江動(dòng)物繁殖. 2008(03)
[10]小鼠屬(Mus)與田鼠屬(Microtus)的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系研究概述[J]. 張新蕊,相學(xué)軍,陳艷秋,劉煥民,王宇峰,閆楠,朱必才. 遺傳. 2008(05)
博士論文
[1]利用Y染色體遺傳多樣性對中國家馬起源的研究[D]. 劉書琴.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]異齒亞綱貝類DNA條形碼與系統(tǒng)發(fā)生學(xué)研究[D]. 于貞貞.中國海洋大學(xué) 2014
[3]新疆兔屬物種的群體遺傳學(xué)及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系[D]. 單文娟.新疆大學(xué) 2011
碩士論文
[1]中國小家鼠(Mus musculus)TLR2基因的遺傳多樣性研究[D]. 孫曉敏.魯東大學(xué) 2018
[2]基于線粒體和核基因序列分析單環(huán)刺螠(Urechis unicinctus)種群遺傳多樣性[D]. 宮杰.魯東大學(xué) 2018
[3]團(tuán)頭魴Toll樣受體基因序列分析及其表達(dá)研究[D]. 賴瑞芳.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]中國家養(yǎng)雙峰駝Y染色體SNP、STR、CNV與父系起源研究[D]. 陳慧玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[5]中國小家鼠線粒體全基因組序列分析[D]. 徐健.魯東大學(xué) 2014
[6]海南兔的線粒體基因組結(jié)構(gòu)特征與系統(tǒng)演化初探[D]. 王曉明.山東大學(xué) 2012
[7]基于常染色體、Y染色體、線粒體序列解析中國野生小家鼠亞種進(jìn)化[D]. 蔡慧強(qiáng).東華大學(xué) 2012
[8]Zfy基因干擾對小鼠性別控制的研究[D]. 彭強(qiáng).石河子大學(xué) 2011
[9]人類性染色體DNA回文序列分析[D]. 蔣虎.蘭州大學(xué) 2011
[10]自適應(yīng)協(xié)同進(jìn)化模型及應(yīng)用[D]. 張桂娟.山東師范大學(xué) 2006
本文編號:3368902
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